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タイトルStructural basis for childhood antibody recognition of the human metapneumovirus fusion protein.
ジャーナル・号・ページNat Commun, Vol. 17, Issue 1, Page 1267, Year 2025
掲載日2025年12月27日
著者Ahmed Magdy Khalil / Behrouz Ghazi Esfahani / Rose J Miller / Jiachen Huang / Guillermina Kuan / Angel Balmaseda / Aubree Gordon / Jarrod J Mousa /
PubMed 要旨Human metapneumovirus (hMPV) is a significant cause of acute respiratory illness in children and older adults, with most children becoming seropositive by five years of age. The hMPV fusion (F) ...Human metapneumovirus (hMPV) is a significant cause of acute respiratory illness in children and older adults, with most children becoming seropositive by five years of age. The hMPV fusion (F) protein is the sole target of neutralizing antibodies, and while most common B-cell-targeted neutralizing epitopes on the hMPV F protein have been determined in hMPV-infected adults, the antibody response in hMPV-infected children remains undefined. We isolate five human monoclonal antibodies (mAbs) from hMPV-infected children, and evaluate their binding avidity, neutralization potency, epitope specificity, and in vivo efficacy. All mAbs are neutralizing, and epitope binning reveals four different epitopes targeted by the mAbs. Cryo-EM structures of four mAbs in complex with the hMPV F protein reveal epitopes on the hMPV F trimer surface as well as an intratrimer epitope located completely within the hMPV F trimer interface. Furthermore, we determine the prophylactic efficacy of the mAbs in protection against hMPV challenge in mice. These findings provide new insights into the immunodominant antigenic epitopes on the hMPV F protein in children and identify new mAbs for hMPV F disease prevention.
リンクNat Commun / PubMed:41455691 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度2.61 - 6.57 Å
構造データ

70793

9os5

EMDB-70793, PDB-9os5:
Human antibody Fab MPV498 bound to hMPV B2 post-fusion F
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.61 Å

71547

9pdx

EMDB-71547, PDB-9pdx:
Human antibody Fab MPV513 bound to hMPV DsCav-ES2
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.94 Å

71548

9pdy

EMDB-71548, PDB-9pdy:
Human antibody Fab MPV510 bound to hMPV DsCav-ES2-IPDS F protein
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.85 Å

EMDB-72382: Human antibody Fab MPV499 bound to hMPV DsCav-ES2
手法: EM (単粒子) / 解像度: 6.57 Å

化合物

ChemComp-NAG:
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-アセチル-β-D-グルコサミン

ChemComp-HOH:
WATER

由来
  • homo sapiens (ヒト)
  • human metapneumovirus (ウイルス)
キーワードIMMUNE SYSTEM / ANTIVIRAL PROTEIN / hMPV / Human respiratory disease / cryoem / human metapneumovirus / VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM / VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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