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タイトルStabilization of the H5 clade 2.3.4.4b hemagglutinin improves vaccine-elicited neutralizing antibody responses in mice.
ジャーナル・号・ページSci Transl Med, Vol. 18, Issue 839, Page eaea8770, Year 2026
掲載日2026年3月4日
著者Annie Dosey / Bernadeta Dadonaite / Rebecca A Gillespie / Elizabeth M Leaf / Matthew J Vukovich / Jackson McGowan / Emily Grey / Hiromi Muramatsu / Rachel H J Jun / Norbert Pardi / Masaru Kanekiyo / Jesse D Bloom / Neil P King /
PubMed 要旨Transmission of highly pathogenic avian influenza from H5 clade 2.3.4.4b has expanded in recent years to infect large populations of birds and mammals, heightening the risk of a human pandemic. ...Transmission of highly pathogenic avian influenza from H5 clade 2.3.4.4b has expanded in recent years to infect large populations of birds and mammals, heightening the risk of a human pandemic. Influenza viruses that are adapted to transmission in birds and a variety of mammals tend to have a less stable hemagglutinin (HA) than seasonal influenza viruses, enabling membrane fusion at comparatively higher pH levels. Here, we combined five mutations in the H5 HA that increased its melting temperature and promoted stable closure of the HA trimer. Structural analysis by cryo-electron microscopy revealed that the stabilizing mutations create several new hydrophobic interactions while maintaining the local HA structure. We found that vaccinating mice with stabilized H5 HA immunogens resulted in higher hemagglutination inhibition and neutralization titers than nonstabilized comparators. Epitope mapping of vaccine-elicited polyclonal antibody responses using negative-stain electron microscopy and deep mutational scanning showed that site E on the side of the HA receptor binding domain was immunodominant across all groups; however, the stabilized immunogens shifted responses toward the receptor binding site, which elicited a higher proportion of neutralizing antibodies. Consistent with these findings, stabilized H5 HA immunogens delivered as messenger RNA-lipid nanoparticle (mRNA-LNP) vaccines protected mice against H5N1 challenge. These findings highlight that H5 HA-stabilizing mutations enhance the quality of antibody responses across different vaccine formats, underscoring their potential to improve pandemic preparedness vaccines targeting viruses from this widely circulating clade.
リンクSci Transl Med / PubMed:41779867
手法EM (単粒子)
解像度15.16 - 19.97 Å
構造データ

EMDB-71459: Negative stain EM map 3 of polyclonal serum from mouse immunized with H5 TX24-FMLMI-RC_I_1 in complex with TX24-I53_dn5B.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 18.99 Å

EMDB-71460: Negative stain EM map 2 of polyclonal serum from mouse immunized with H5 TX24-FMLMI-RC_I_1 in complex with TX24-I53_dn5B.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 17.83 Å

EMDB-71461: Negative stain EM map 1 of polyclonal serum from mouse immunized with H5 TX24-FMLMI-RC_I_1 in complex with TX24-I53_dn5B.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 15.16 Å

EMDB-71462: Negative stain EM map of polyclonal serum from mouse immunized with H5 TX24-foldon in complex with TX24-I53_dn5B.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 16.43 Å

EMDB-71463: Negative stain EM map 1 of polyclonal serum from mouse immunized with H5 TX24-FMLMI-foldon in complex with TX24-I53_dn5B.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 19.41 Å

EMDB-71464: Negative stain EM map 2 of polyclonal serum from mouse immunized with H5 TX24-FMLMI-foldon in complex with TX24-I53_dn5B.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 18.44 Å

EMDB-71465: Negative stain EM map 3 of polyclonal serum from mouse immunized with H5 TX24-FMLMI-foldon in complex with TX24-I53_dn5B.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 18.96 Å

EMDB-71466: Negative stain EM map 1 of polyclonal serum from mouse immunized with H5 TX24-membrane anchored in complex with TX24-I53_dn5B.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 17.1 Å

EMDB-71467: Negative stain EM map 2 of polyclonal serum from mouse immunized with H5 TX24-membrane anchored in complex with TX24-I53_dn5B.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 19.1 Å

EMDB-71468: Negative stain EM map 3 of polyclonal serum from mouse immunized with H5 TX24-membrane anchored in complex with TX24-I53_dn5B.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 18.59 Å

EMDB-71469: Negative stain EM map 4 of polyclonal serum from mouse immunized with H5 TX24-membrane anchored in complex with TX24-I53_dn5B.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 19.97 Å

EMDB-71470: Negative stain EM map 1 of polyclonal serum from mouse immunized with H5 TX24-FMLMI-membrane anchored in complex with TX24-I53_dn5B.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 16.16 Å

EMDB-71471: Negative stain EM map 2 of polyclonal serum from mouse immunized with H5 TX24-FMLMI-membrane anchored in complex with TX24-I53_dn5B.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 17.08 Å

EMDB-71472: Negative stain EM map 3 of polyclonal serum from mouse immunized with H5 TX24-FMLMI-membrane anchored in complex with TX24-I53_dn5B.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 15.82 Å

EMDB-71473: Negative stain EM map 4 of polyclonal serum from mouse immunized with H5 TX24-FMLMI-membrane anchored in complex with TX24-I53_dn5B.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 16.71 Å

由来
  • Mus musculus (ハツカネズミ)
  • Influenza A virus (A型インフルエンザウイルス)

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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