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タイトルAtomic mechanisms of full-length ASC-mediated inflammasome assembly.
ジャーナル・号・ページNat Commun, Vol. 16, Issue 1, Page 10564, Year 2025
掲載日2025年11月26日
著者Dongmei Xue / Fengyun Ni / Sheng Liu / Huifang Yan / Zhenwei Luo / Gang Fu / Qinghua Wang / Jianpeng Ma /
PubMed 要旨ASC (Apoptosis-associated Speck-like protein containing a CARD) is a key adaptor protein that assembles inflammasomes by linking sensors such as NLRP3 to effectors like Caspase-1 via its PYD and CARD ...ASC (Apoptosis-associated Speck-like protein containing a CARD) is a key adaptor protein that assembles inflammasomes by linking sensors such as NLRP3 to effectors like Caspase-1 via its PYD and CARD Death Domains. Due to ASC's propensity to self-aggregate, most high-resolution structural studies focused on isolated PYD or CARD domains, leaving the atomic basis of full-length ASC assembly unknown. Here we determine atomic-resolution cryo-EM structures of PYD and CARD filaments from full-length ASC, revealing characteristic multitrack bundles composed of alternating ASC and ASC filaments that expose multiple interfaces for flexible assembly and efficient signaling. We further show that Caspase-1 filaments nucleate specifically from the B-end of ASC filaments, and that the interdomain linker modulates bundle formation. The ASC isoform ASCb, with a four-residue linker, adopts a distinct architecture, correlating with reduced Caspase-1 activation efficiency. In ASC THP-1 cells, only wild-type ASC, not interface-disrupting mutants, restored ASC speck formation and Caspase-1 activation, underscoring the requirement for intact multitrack bundles. Cryo-electron tomography captures snapshots of higher-order inflammasome structures. These findings collectively define the structural and functional principles by which ASC organizes inflammasomes to amplify immune signaling.
リンクNat Commun / PubMed:41298390 / PubMed Central
手法EM (らせん対称)
解像度2.45 - 4.41 Å
構造データ

66381

9wz4

EMDB-66381, PDB-9wz4:
Full-length ASC-PYD filament
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.21 Å

66382

9wz5

EMDB-66382, PDB-9wz5:
Full-length ASC-CARD filament
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.91 Å

66383

9wz6

EMDB-66383, PDB-9wz6:
Full-length Caspase-1-CARD filament
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.66 Å

66384

9wz7

EMDB-66384, PDB-9wz7:
Full-length ASCb filament
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.66 Å

66385

9wz8

EMDB-66385, PDB-9wz8:
Full-length ASC-GFP PYD-filament
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.14 Å

66387

9wzb

EMDB-66387, PDB-9wzb:
K21E/K22E-ASC CARD filament
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.67 Å

66388

9wzc

EMDB-66388, PDB-9wzc:
R41E-ASC CARD filament
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.45 Å

66391

9wzd

EMDB-66391, PDB-9wzd:
R125E-ASC PYD filament
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.86 Å

66401

9wzg

EMDB-66401, PDB-9wzg:
Full-length ASC-PYD filament
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 4.41 Å

66402

9wzh

EMDB-66402, PDB-9wzh:
Full-length ASC-CARD filament
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 4.02 Å

66403

9wzi

EMDB-66403, PDB-9wzi:
Full-length Caspase-1-CARD filament
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 4.0 Å

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードIMMUNE SYSTEM / filament / PYD / CARD

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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