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タイトルA surface lipoprotein on Pasteurella multocida binds complement factor I to promote immune evasion.
ジャーナル・号・ページPLoS Pathog, Vol. 21, Issue 5, Page e1012686, Year 2025
掲載日2025年5月6日
著者Quynh Huong Nguyen / Chun Heng Royce Lai / Michael J Norris / Dixon Ng / Megha Shah / Christine Chieh-Lin Lai / David E Isenman / Trevor F Moraes /
PubMed 要旨Pasteurella multocida is the leading cause of wound infections in humans following animals' bites or scratches. This bacterium is also commonly found in the respiratory tract of many mammals and can ...Pasteurella multocida is the leading cause of wound infections in humans following animals' bites or scratches. This bacterium is also commonly found in the respiratory tract of many mammals and can cause serious diseases resulting in the rapid death of infected animals, especially cattle. To prevent these infections in cattle, a subunit-based vaccine utilizing the surface lipoprotein PmSLP was developed and showed remarkable protection with a single dose administration. Here, we report that PmSLP binds host complement factor I (FI) and facilitates cleavage of complement components C3b and C4b independently of any cofactors (e.g., FH, C4BP), thereby allowing the pathogen to evade host defence. Cryo-EM structure of PmSLP bound to FI reveals that PmSLP stimulates FI enzymatic activity by stabilizing the catalytic domain. This is the first time that a bacterial protein has been shown to directly activate FI independent of complement cofactors and target all arms of the complement cascade.
リンクPLoS Pathog / PubMed:40327719 / PubMed Central
手法EM (単粒子) / X線回折
解像度2 - 4.0 Å
構造データ

44139

9b3h

EMDB-44139, PDB-9b3h:
Structure of a complex between Pasteurella multocida surface lipoprotein, PmSLP-1, and bovine complement factor I
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.0 Å

EMDB-44146: Conformation 1 of the assembled dimer of PmSLP-1:FI complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.7 Å

EMDB-44149: Conformation 2 of the assembled dimer of PmSLP-1:FI complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.4 Å

PDB-9b3e:
Crystal structure of a Slam-dependent surface lipoprotein, PmSLP, in Pasteurella multocida
手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2 Å

化合物

ChemComp-SE:
SELENIUM ATOM / ヒドリドセレン

ChemComp-HOH:
WATER

ChemComp-NAG:
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-アセチル-β-D-グルコサミン

由来
  • bos taurus (ウシ)
  • pasteurella multocida 36950 (バクテリア)
キーワードMEMBRANE PROTEIN / Bacterial surface lipoprotein / complement evasion / complement protein / immune evasion

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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