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タイトルDistinct TAF15 amyloid filament folds define multiple subtypes of FTLD-TAF15.
ジャーナル・号・ページbioRxiv, Year 2026
掲載日2026年1月12日
著者Stephan Tetter / Nikhil R Varghese / Alexey G Murzin / Wouter De Coster / Marleen Van den Broeck / Sigrun Roeber / Jeffrey T Joseph / Kathy Newell / Rudolf Castellani / Sumit Das / Lee-Cyn Ang / Matthis Synofzik / Jochen Herms / Rosa Rademakers / Bernardino Ghetti / Tammaryn Lashley / Ian R A Mackenzie / Manuela Neumann / Benjamin Ryskeldi-Falcon /
PubMed 要旨Neurodegenerative diseases are characterised by the assembly of a limited number of disease-specific proteins into amyloid filaments, which form intracellular inclusions or extracellular deposits in ...Neurodegenerative diseases are characterised by the assembly of a limited number of disease-specific proteins into amyloid filaments, which form intracellular inclusions or extracellular deposits in the central nervous system (CNS). We previously found that amyloid filaments of TATA-binding protein-associated factor 15 (TAF15) characterise a subtype of frontotemporal lobar degeneration with FET protein-immunoreactive inclusions (FTLD-FET), termed atypical FTLD with ubiquitin-positive inclusions (aFTLD-U), which causes early-onset, rapidly progressive behavioural variant frontotemporal dementia (FTD). However, it was not clear if TAF15 proteinopathy was more widespread in neurodegenerative diseases. Two additional FTLD-FET subtypes have been proposed, neuronal intermediate filament inclusion body disease (NIFID) and basophilic inclusion body disease (BIBD), which have more heterogenous clinical presentations including FTD, motor neuron diseases (MND) and movement disorders. Here, we used electron cryo-microscopy (cryo-EM) to determine a total of 32 amyloid filament structures from the brains of 17 individuals encompassing all three proposed subtypes of FTLD-FET and their diverse clinical presentations. All cases were characterised by TAF15 filaments, in the absence of filaments of the other FET proteins, fused in sarcoma (FUS) and Ewing's sarcoma (EWS). All three aFTLD-U cases had the previously-reported TAF15 fold. Unexpectedly, we found four distinct TAF15 folds among 11 NIFID cases. Eight of these cases shared a common fold, while the remaining three were each distinct. Furthermore, we found distinct TAF15 folds for each of the three BIBD cases. Neuropathological reassessment of the neocortical TAF15 inclusion pathology of these cases distinguished the NIFID cases with the common fold from the others. Thus, TAF15 filament structures form the basis of a new, expanded classification of FTLD-FET subtypes. Moreover, we discovered a TAF15 Y38C variant in the filament fold of one of the individuals with BIBD. The structure is unable to incorporate wild-type TAF15, despite the individual being heterozygous, suggesting that this variant drives TAF15 filament assembly. This study provides structural and genetic evidence that TAF15 amyloid filaments underlie the diverse group of neurodegenerative diseases currently termed FTLD-FET, which we therefore rename FTLD-TAF15.
リンクbioRxiv / PubMed:41648099 / PubMed Central
手法EM (らせん対称)
解像度1.64 - 3.59 Å
構造データ

EMDB-55930, PDB-9thm:
TAF15 amyloid filament fold B variant 1
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 1.64 Å

EMDB-55931, PDB-9thn:
TAF15 amyloid filament fold B variant 2
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 1.97 Å

EMDB-55932, PDB-9thp:
TAF15 amyloid filament fold B variant 3
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 1.98 Å

EMDB-56025, PDB-9tke:
TAF15 amyloid filament fold H (Y38C)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.74 Å

EMDB-56026, PDB-9tkf:
TAF15 amyloid filament fold G
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.55 Å

EMDB-56027, PDB-9tkg:
TAF15 amyloid filament fold F
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.08 Å

EMDB-56028, PDB-9tkh:
TAF15 amyloid filament fold E variant 1
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.05 Å

EMDB-56029, PDB-9tki:
TAF15 amyloid filament fold E variant 2
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.39 Å

EMDB-56030, PDB-9tkj:
TAF15 amyloid filament fold D
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.21 Å

EMDB-56031, PDB-9tkk:
TAF15 amyloid filament fold C variant 1
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.38 Å

EMDB-56032, PDB-9tkl:
TAF15 amyloid filament fold C variant 1 doublet
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.6 Å

EMDB-56040, PDB-9tkz:
TAF15 amyloid filament fold D prime
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.59 Å

EMDB-56041, PDB-9tl2:
TAF15 amyloid filament fold C variant 2
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.82 Å

化合物

ChemComp-HOH:
WATER

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードPROTEIN FIBRIL / Amyloid Neurodegeneration Frontotemporal lobar degeneration

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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