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タイトルStructure of active human telomerase with telomere shelterin protein TPP1.
ジャーナル・号・ページNature, Vol. 604, Issue 7906, Page 578-583, Year 2022
掲載日2022年4月13日
著者Baocheng Liu / Yao He / Yaqiang Wang / He Song / Z Hong Zhou / Juli Feigon /
PubMed 要旨Human telomerase is a RNA-protein complex that extends the 3' end of linear chromosomes by synthesizing multiple copies of the telomeric repeat TTAGGG. Its activity is a determinant of cancer ...Human telomerase is a RNA-protein complex that extends the 3' end of linear chromosomes by synthesizing multiple copies of the telomeric repeat TTAGGG. Its activity is a determinant of cancer progression, stem cell renewal and cellular aging. Telomerase is recruited to telomeres and activated for telomere repeat synthesis by the telomere shelterin protein TPP1. Human telomerase has a bilobal structure with a catalytic core ribonuclear protein and a H and ACA box ribonuclear protein. Here we report cryo-electron microscopy structures of human telomerase catalytic core of telomerase reverse transcriptase (TERT) and telomerase RNA (TER (also known as hTR)), and of telomerase with the shelterin protein TPP1. TPP1 forms a structured interface with the TERT-unique telomerase essential N-terminal domain (TEN) and the telomerase RAP motif (TRAP) that are unique to TERT, and conformational dynamics of TEN-TRAP are damped upon TPP1 binding, defining the requirements for recruitment and activation. The structures further reveal that the elements of TERT and TER that are involved in template and telomeric DNA handling-including the TEN domain and the TRAP-thumb helix channel-are largely structurally homologous to those in Tetrahymena telomerase, and provide unique insights into the mechanism of telomerase activity. The binding site of the telomerase inhibitor BIBR1532 overlaps a critical interaction between the TER pseudoknot and the TERT thumb domain. Numerous mutations leading to telomeropathies are located at the TERT-TER and TEN-TRAP-TPP1 interfaces, highlighting the importance of TER-TERT and TPP1 interactions for telomerase activity, recruitment and as drug targets.
リンクNature / PubMed:35418675 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度3.3 - 4.3 Å
構造データ

EMDB-26085, PDB-7trc:
Human telomerase H/ACA RNP at 3.3 Angstrom
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.3 Å

EMDB-26086, PDB-7trd:
Human telomerase catalytic core structure at 3.3 Angstrom
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.3 Å

EMDB-26087, PDB-7tre:
Human telomerase catalytic core with shelterin protein TPP1
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.5 Å

EMDB-26088, PDB-7trf:
Human telomerase catalytic core RNP with H2A/H2B
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.7 Å

EMDB-26090: Human telomerase catalytic core with TPP1-OB, P2a state1-1
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.2 Å

EMDB-26091: Human telomerase catalytic core with TPP1-OB, P2a state 1-2
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.1 Å

EMDB-26092: Human telomerase catalytic core with TPP1-OB, P2a state1-3
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.1 Å

EMDB-26093: Human telomerase catalytic core with TPP1-OB, P2a state2
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.0 Å

EMDB-26094: Human telomerase catalytic core without TPP1-OB, P2a state1
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.3 Å

EMDB-26095: Human telomerase catalytic core without TPP1-OB, P2a state2
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.1 Å

EMDB-26096: Human telomerase catalytic core without TPP1
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.7 Å

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードREPLICATION / DNA / RNA

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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