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タイトルStructure-based classification of tauopathies.
ジャーナル・号・ページNature, Vol. 598, Issue 7880, Page 359-363, Year 2021
掲載日2021年9月29日
著者Yang Shi / Wenjuan Zhang / Yang Yang / Alexey G Murzin / Benjamin Falcon / Abhay Kotecha / Mike van Beers / Airi Tarutani / Fuyuki Kametani / Holly J Garringer / Ruben Vidal / Grace I Hallinan / Tammaryn Lashley / Yuko Saito / Shigeo Murayama / Mari Yoshida / Hidetomo Tanaka / Akiyoshi Kakita / Takeshi Ikeuchi / Andrew C Robinson / David M A Mann / Gabor G Kovacs / Tamas Revesz / Bernardino Ghetti / Masato Hasegawa / Michel Goedert / Sjors H W Scheres /
PubMed 要旨The ordered assembly of tau protein into filaments characterizes several neurodegenerative diseases, which are called tauopathies. It was previously reported that, by cryo-electron microscopy, the ...The ordered assembly of tau protein into filaments characterizes several neurodegenerative diseases, which are called tauopathies. It was previously reported that, by cryo-electron microscopy, the structures of tau filaments from Alzheimer's disease, Pick's disease, chronic traumatic encephalopathy and corticobasal degeneration are distinct. Here we show that the structures of tau filaments from progressive supranuclear palsy (PSP) define a new three-layered fold. Moreover, the structures of tau filaments from globular glial tauopathy are similar to those from PSP. The tau filament fold of argyrophilic grain disease (AGD) differs, instead resembling the four-layered fold of corticobasal degeneration. The AGD fold is also observed in ageing-related tau astrogliopathy. Tau protofilament structures from inherited cases of mutations at positions +3 or +16 in intron 10 of MAPT (the microtubule-associated protein tau gene) are also identical to those from AGD, suggesting that relative overproduction of four-repeat tau can give rise to the AGD fold. Finally, the structures of tau filaments from cases of familial British dementia and familial Danish dementia are the same as those from cases of Alzheimer's disease and primary age-related tauopathy. These findings suggest a hierarchical classification of tauopathies on the basis of their filament folds, which complements clinical diagnosis and neuropathology and also allows the identification of new entities-as we show for a case diagnosed as PSP, but with filament structures that are intermediate between those of globular glial tauopathy and PSP.
リンクNature / PubMed:34588692 / PubMed Central
手法EM (らせん対称)
解像度1.9 - 3.4 Å
構造データ

EMDB-13218, PDB-7p65:
Progressive supranuclear palsy tau filament
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.7 Å

EMDB-13219, PDB-7p66:
Globular glial tauopathy type 1 tau filament
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.0 Å

EMDB-13220, PDB-7p67:
Globular glial tauopathy type 2 tau filament
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.1 Å

EMDB-13221, PDB-7p68:
Globular glial tauopathy type 3 tau filament
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.9 Å

EMDB-13223, PDB-7p6a:
Limbic-predominant neuronal inclusion body 4R tauopathy type 1a tau filament
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 1.9 Å

EMDB-13224, PDB-7p6b:
Limbic-predominant neuronal inclusion body 4R tauopathy type 1b tau filament
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.2 Å

EMDB-13225, PDB-7p6c:
Limbic-predominant neuronal inclusion body 4R tauopathy type 2 tau filament
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.5 Å

EMDB-13226, PDB-7p6d:
Argyrophilic grain disease type 1 tau filament
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.3 Å

EMDB-13227, PDB-7p6e:
Argyrophilic grain disease type 2 tau filament
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.4 Å

化合物

ChemComp-HOH:
WATER

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードPROTEIN FIBRIL / Amyloid fibril

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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