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タイトルUniversal protection against influenza infection by a multidomain antibody to influenza hemagglutinin.
ジャーナル・号・ページScience, Vol. 362, Issue 6414, Page 598-602, Year 2018
掲載日2018年11月2日
著者Nick S Laursen / Robert H E Friesen / Xueyong Zhu / Mandy Jongeneelen / Sven Blokland / Jan Vermond / Alida van Eijgen / Chan Tang / Harry van Diepen / Galina Obmolova / Marijn van der Neut Kolfschoten / David Zuijdgeest / Roel Straetemans / Ryan M B Hoffman / Travis Nieusma / Jesper Pallesen / Hannah L Turner / Steffen M Bernard / Andrew B Ward / Jinquan Luo / Leo L M Poon / Anna P Tretiakova / James M Wilson / Maria P Limberis / Ronald Vogels / Boerries Brandenburg / Joost A Kolkman / Ian A Wilson /
PubMed 要旨Broadly neutralizing antibodies against highly variable pathogens have stimulated the design of vaccines and therapeutics. We report the use of diverse camelid single-domain antibodies to influenza ...Broadly neutralizing antibodies against highly variable pathogens have stimulated the design of vaccines and therapeutics. We report the use of diverse camelid single-domain antibodies to influenza virus hemagglutinin to generate multidomain antibodies with impressive breadth and potency. Multidomain antibody MD3606 protects mice against influenza A and B infection when administered intravenously or expressed locally from a recombinant adeno-associated virus vector. Crystal and single-particle electron microscopy structures of these antibodies with hemagglutinins from influenza A and B viruses reveal binding to highly conserved epitopes. Collectively, our findings demonstrate that multidomain antibodies targeting multiple epitopes exhibit enhanced virus cross-reactivity and potency. In combination with adeno-associated virus-mediated gene delivery, they may provide an effective strategy to prevent infection with influenza virus and other highly variable pathogens.
リンクScience / PubMed:30385580 / PubMed Central
手法EM (単粒子) / X線回折
解像度0.92 - 6.9 Å
構造データ

EMDB-9029:
Hemagglutinin trimeric ectodomain (B/Massachusetts/02/2012) in complex with Fab from IgG CR9114 and single-domain antibody SD84
手法: EM (単粒子) / 解像度: 6.9 Å

PDB-6ck8:
Crystal structure of anti-influenza single-domain llama antibody SD38
手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.05 Å

PDB-6cnv:
INFLUENZA B/BRISBANE HEMAGGLUTININ FAB CR9115 SD84H COMPLEX
手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 4.1 Å

PDB-6cnw:
STRUCTURE OF HUMANIZED SINGLE DOMAIN ANTIBODY SD84
手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 0.92 Å

PDB-6fys:
Structure of single domain antibody SD83
手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2 Å

PDB-6fyt:
Structure of H1 (A/solomon Islands/3/06) Influenza Hemagglutinin in complex with SD38
手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.8 Å

PDB-6fyu:
Structure of H7(A/Shanghai/2/2013) Influenza Hemagglutinin in complex SD36
手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.643 Å

PDB-6fyw:
Structure of B/Brisbane/60/2008 Influenza Hemagglutinin in complex with SD83
手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.2 Å

化合物

ChemComp-SO4:
SULFATE ION / 硫酸ジアニオン

ChemComp-1PE:
PENTAETHYLENE GLYCOL / ペンタエチレングリコ-ル / 沈殿剤*YM

ChemComp-GOL:
GLYCEROL / グリセロ-ル

ChemComp-HOH:
WATER

ChemComp-NAG:
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-アセチル-β-D-グルコサミン

ChemComp-ACT:
ACETATE ION / 酢酸イオン

ChemComp-PEG:
DI(HYDROXYETHYL)ETHER / ジエチレングリコ-ル

ChemComp-EDO:
1,2-ETHANEDIOL / エチレングリコ-ル

ChemComp-NA:
Unknown entry / ナトリウムカチオン

由来
  • Influenza B virus (B/Massachusetts/02/2012) (B型インフルエンザウイルス)
  • homo sapiens (ヒト)
  • lama glama (ラマ)
  • influenza b virus (B型インフルエンザウイルス)
  • human immunodeficiency virus 1 (ヒト免疫不全ウイルス)
  • synthetic construct (人工物)
  • hybrid (その他)
  • influenza a virus (a/solomon islands/3/2006(h1n1)) (A型インフルエンザウイルス)
  • influenza a virus (A型インフルエンザウイルス)
  • influenza b virus (b/brisbane/60/2008) (B型インフルエンザウイルス)
キーワードIMMUNE SYSTEM / single-domain / multi-domain / llama / antibody / influenza / broad / neutralization / VIRAL PROTEIN / VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex / Single domain antibody / hemagglutinin / humanization

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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