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タイトルMolecular mechanisms of urate transport by the native human URAT1 and its inhibition by anti-gout drugs.
ジャーナル・号・ページCell Discov, Vol. 11, Issue 1, Page 33, Year 2025
掲載日2025年4月1日
著者Canrong Wu / Chao Zhang / Sanshan Jin / James Jiqi Wang / Antao Dai / Jiuyin Xu / Heng Zhang / Xuemei Yang / Xinheng He / Qingning Yuan / Wen Hu / Youwei Xu / Mingwei Wang / Yi Jiang / Dehua Yang / H Eric Xu /
PubMed 要旨Gout, a common and painful disease, stems from hyperuricemia, where elevated blood urate levels lead to urate crystal formation in joints and kidneys. The human urate transporter 1 (hURAT1) plays a ...Gout, a common and painful disease, stems from hyperuricemia, where elevated blood urate levels lead to urate crystal formation in joints and kidneys. The human urate transporter 1 (hURAT1) plays a critical role in urate homeostasis by facilitating urate reabsorption in the renal proximal tubule, making it a key target for gout therapy. Pharmacological inhibition of hURAT1 with drugs such as dotinurad, benzbromarone, lesinurad, and verinurad promotes urate excretion and alleviates gout symptoms. Here, we present cryo-electron microscopy structures of native hURAT1 bound with these anti-gout drugs in the inward-open state, and with urate in inward-open, outward-open, and occluded states. Complemented by mutagenesis and cell-based assays, these structures reveal the mechanisms of urate reabsorption and hURAT1 inhibition. Our findings elucidate the molecular basis of urate transport and anti-gout medication action and provide a structural framework for the rational design of next-generation therapies for hyperuricemia and gout.
リンクCell Discov / PubMed:40169562 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度3.23 - 3.6 Å
構造データ

61399

9jdv

EMDB-61399, PDB-9jdv:
Human URAT1 bound with Uric acid
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.32 Å

61401

9jdy

EMDB-61401, PDB-9jdy:
Human URAT1 bound with verinurad
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.23 Å

61402

9jdz

EMDB-61402, PDB-9jdz:
Human URAT1 bound to lesinurad
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.5 Å

61403

9je0

EMDB-61403, PDB-9je0:
Human URAT1 bound to benzbromarone
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.23 Å

61404

9je1

EMDB-61404, PDB-9je1:
Human URAT1 bound to dotinurad
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.6 Å

化合物

ChemComp-URC:
URIC ACID

ChemComp-HOH:
WATER

PDB-1aij:
PHOTOSYNTHETIC REACTION CENTER FROM RHODOBACTER SPHAEROIDES IN THE CHARGE-NEUTRAL DQAQB STATE

PDB-1ail:
N-TERMINAL FRAGMENT OF NS1 PROTEIN FROM INFLUENZA A VIRUS

ChemComp-R75:
[3,5-bis(bromanyl)-4-oxidanyl-phenyl]-(2-ethyl-1-benzofuran-3-yl)methanone / 抗不整脈薬, 阻害剤*YM

PDB-1aik:
HIV GP41 CORE STRUCTURE

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードTRANSPORT PROTEIN / URAT1

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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