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タイトルStructural basis of amine odorant perception by a mammal olfactory receptor.
ジャーナル・号・ページNature, Vol. 618, Issue 7963, Page 193-200, Year 2023
掲載日2023年5月24日
著者Lulu Guo / Jie Cheng / Shuo Lian / Qun Liu / Yan Lu / Yuan Zheng / Kongkai Zhu / Minghui Zhang / Yalei Kong / Chao Zhang / Naikang Rong / Yuming Zhuang / Guoxing Fang / Jingjing Jiang / Tianyao Zhang / Xiang Han / Zili Liu / Ming Xia / Shangming Liu / Lei Zhang / Stephen D Liberles / Xiao Yu / Yunfei Xu / Fan Yang / Qian Li / Jin-Peng Sun /
PubMed 要旨Odorants are detected as smell in the nasal epithelium of mammals by two G-protein-coupled receptor families, the odorant receptors and the trace amine-associated receptors (TAARs). TAARs emerged ...Odorants are detected as smell in the nasal epithelium of mammals by two G-protein-coupled receptor families, the odorant receptors and the trace amine-associated receptors (TAARs). TAARs emerged following the divergence of jawed and jawless fish, and comprise a large monophyletic family of receptors that recognize volatile amine odorants to elicit both intraspecific and interspecific innate behaviours such as attraction and aversion. Here we report cryo-electron microscopy structures of mouse TAAR9 (mTAAR9) and mTAAR9-G or mTAAR9-G trimers in complex with β-phenylethylamine, N,N-dimethylcyclohexylamine or spermidine. The mTAAR9 structures contain a deep and tight ligand-binding pocket decorated with a conserved DWY motif, which is essential for amine odorant recognition. In the mTAAR9 structure, a unique disulfide bond connecting the N terminus to ECL2 is required for agonist-induced receptor activation. We identify key structural motifs of TAAR family members for detecting monoamines and polyamines and the shared sequence of different TAAR members that are responsible for recognition of the same odour chemical. We elucidate the molecular basis of mTAAR9 coupling to G and G by structural characterization and mutational analysis. Collectively, our results provide a structural basis for odorant detection, receptor activation and G coupling of an amine olfactory receptor.
リンクNature / PubMed:37225986
手法EM (単粒子)
解像度2.97 - 3.49 Å
構造データ

35705

8itf

EMDB-35705, PDB-8itf:
Cryo-EM structure of the DMCHA-bound mTAAR9-Gs complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.46 Å

35761

8iw1

EMDB-35761, PDB-8iw1:
Cryo-EM structure of the PEA-bound mTAAR9-Golf complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.4 Å

35762

8iw4

EMDB-35762, PDB-8iw4:
Cryo-EM structure of the SPE-bound mTAAR9-Gs complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.49 Å

35763

8iw7

EMDB-35763, PDB-8iw7:
Cryo-EM structure of the PEA-bound mTAAR9-Gs complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.97 Å

35764

8iw9

EMDB-35764, PDB-8iw9:
Cryo-EM structure of the CAD-bound mTAAR9-Gs complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.08 Å

35765

8iwe

EMDB-35765, PDB-8iwe:
Cryo-EM structure of the SPE-mTAAR9 complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.4 Å

35771

8iwm

EMDB-35771, PDB-8iwm:
Cryo-EM structure of the PEA-bound mTAAR9 complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.17 Å

化合物

ChemComp-8IA:
~{N},~{N}-dimethylcyclohexanamine / N,N-ジメチルシクロヘキシルアミン

ChemComp-SPD:
SPERMIDINE / スペルミジン

ChemComp-PEA:
2-PHENYLETHYLAMINE / フェネチルアンモニウム / alkaloid*YM

由来
  • mus musculus (ハツカネズミ)
  • homo sapiens (ヒト)
  • synthetic construct (人工物)
  • escherichia coli bl21(de3) (大腸菌)
キーワードMEMBRANE PROTEIN / DMCHA / mTAAR9 / PEA / SPE / CAD

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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