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Structure paper

タイトルMolecular mechanism of prestin electromotive signal amplification.
ジャーナル・号・ページCell, Vol. 184, Issue 18, Page 4669-4679.e13, Year 2021
掲載日2021年9月2日
著者Jingpeng Ge / Johannes Elferich / Sepehr Dehghani-Ghahnaviyeh / Zhiyu Zhao / Marc Meadows / Henrique von Gersdorff / Emad Tajkhorshid / Eric Gouaux /
PubMed 要旨Hearing involves two fundamental processes: mechano-electrical transduction and signal amplification. Despite decades of studies, the molecular bases for both remain elusive. Here, we show how ...Hearing involves two fundamental processes: mechano-electrical transduction and signal amplification. Despite decades of studies, the molecular bases for both remain elusive. Here, we show how prestin, the electromotive molecule of outer hair cells (OHCs) that senses both voltage and membrane tension, mediates signal amplification by coupling conformational changes to alterations in membrane surface area. Cryoelectron microscopy (cryo-EM) structures of human prestin bound with chloride or salicylate at a common "anion site" adopt contracted or expanded states, respectively. Prestin is ensconced within a perimeter of well-ordered lipids, through which it induces dramatic deformation in the membrane and couples protein conformational changes to the bulk membrane. Together with computational studies, we illustrate how the anion site is allosterically coupled to changes in the transmembrane domain cross-sectional area and the surrounding membrane. These studies provide insight into OHC electromotility by providing a structure-based mechanism of the membrane motor prestin.
リンクCell / PubMed:34390643 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度2.3 - 4.3 Å
構造データ

23329

7lgu

EMDB-23329, PDB-7lgu:
Structure of human prestin in the presence of NaCl
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.3 Å

23331

7lgw

EMDB-23331, PDB-7lgw:
Structure of human Prestin in nanodisc in the presence of NaCl
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.7 Å

23334

7lh2

EMDB-23334, PDB-7lh2:
Structure of human prestin in the presence of sodium salicylate and sodium sulfate
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.43 Å

23335

7lh3

EMDB-23335, PDB-7lh3:
Structure of human prestin in the presence of sodium sulfate
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.3 Å

化合物

ChemComp-CL:
Unknown entry / クロリド / 塩化物

ChemComp-CLR:
CHOLESTEROL / コレステロ-ル / コレステロール

ChemComp-OCT:
N-OCTANE / オクタン / オクタン

ChemComp-D10:
DECANE / デカン / デカン

ChemComp-D12:
DODECANE / ドデカン / ドデカン

ChemComp-HEX:
HEXANE / ヘキサン / ヘキサン

ChemComp-HP6:
HEPTANE / ヘプタン-1,1,1-トリイルラジカル / Heptane

ChemComp-C14:
TETRADECANE / テトラデカン / テトラデカン

ChemComp-HOH:
WATER / 水

ChemComp-SAL:
2-HYDROXYBENZOIC ACID / サリチル酸 / サリチル酸

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードMEMBRANE PROTEIN (膜タンパク質) / transporter family (運搬体タンパク質) / lipid interaction / high resolution (解像度)

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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