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タイトルStructure of the native myosin filament in the relaxed cardiac sarcomere.
ジャーナル・号・ページNature, Vol. 623, Issue 7988, Page 863-871, Year 2023
掲載日2023年11月1日
著者Davide Tamborrini / Zhexin Wang / Thorsten Wagner / Sebastian Tacke / Markus Stabrin / Michael Grange / Ay Lin Kho / Martin Rees / Pauline Bennett / Mathias Gautel / Stefan Raunser /
PubMed 要旨The thick filament is a key component of sarcomeres, the basic units of striated muscle. Alterations in thick filament proteins are associated with familial hypertrophic cardiomyopathy and other ...The thick filament is a key component of sarcomeres, the basic units of striated muscle. Alterations in thick filament proteins are associated with familial hypertrophic cardiomyopathy and other heart and muscle diseases. Despite the central importance of the thick filament, its molecular organization remains unclear. Here we present the molecular architecture of native cardiac sarcomeres in the relaxed state, determined by cryo-electron tomography. Our reconstruction of the thick filament reveals the three-dimensional organization of myosin, titin and myosin-binding protein C (MyBP-C). The arrangement of myosin molecules is dependent on their position along the filament, suggesting specialized capacities in terms of strain susceptibility and force generation. Three pairs of titin-α and titin-β chains run axially along the filament, intertwining with myosin tails and probably orchestrating the length-dependent activation of the sarcomere. Notably, whereas the three titin-α chains run along the entire length of the thick filament, titin-β chains do not. The structure also demonstrates that MyBP-C bridges thin and thick filaments, with its carboxy-terminal region binding to the myosin tails and directly stabilizing the OFF state of the myosin heads in an unforeseen manner. These results provide a foundation for future research investigating muscle disorders involving sarcomeric components.
リンクNature / PubMed:37914933 / PubMed Central
手法EM (サブトモグラム平均) / EM (トモグラフィー)
解像度8.0 - 23.6 Å
構造データ

EMDB-16986: Structure of the relaxed thin filament from FIB milled left ventricular mouse myofibrils (tropomyosin masked out)
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 8.3 Å

EMDB-16987: Structure of the relaxed thin filament from FIB milled left ventricular mouse myofibrils (including tropomyosin)
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 8.2 Å

EMDB-16988: Tomogram of sarcomere C-zone from mouse cardiac muscle
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-16989: Tomogram of sarcomere M-band to C-zone from mouse cardiac muscle
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-16990: Structure of the relaxed thick filament from FIB milled left ventricular mouse myofibrils - Crowns P2-A1
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 20.0 Å

EMDB-16991: Structure of the relaxed thick filament from FIB milled left ventricular mouse myofibrils - M-band
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 20.0 Å

EMDB-16992: Structure of the relaxed thick filament from FIB milled left ventricular mouse myofibrils - Crowns A15-A29
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 18.0 Å

EMDB-16993: Structure of the relaxed thick filament from FIB milled left ventricular mouse myofibrils - Crown P1
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 10.5 Å

EMDB-16994: Structure of the relaxed thick filament from FIB milled left ventricular mouse myofibrils - Crowns A11-A15
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 23.6 Å

EMDB-16995: Structure of the relaxed thick filament from FIB milled left ventricular mouse myofibrils - Crowns A8-A12
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 22.2 Å

EMDB-16996: Structure of the relaxed thick filament from FIB milled left ventricular mouse myofibrils - Crowns A5-A7
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 19.3 Å

EMDB-16997: Structure of the relaxed thick filament from FIB milled left ventricular mouse myofibrils - Crowns A1-A5
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 21.6 Å

EMDB-18146: In situ structures from relaxed cardiac myofibrils reveal the organization of the muscle thick filament
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 18.0 Å

EMDB-18147, PDB-8q4g:
Thin filament from FIB milled relaxed left ventricular mouse myofibrils
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 8.0 Å

EMDB-18198, PDB-8q6t:
Helical reconstruction of the relaxed thick filament from FIB milled left ventricular mouse myofibrils
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 18.0 Å

EMDB-18200: Thin filament consensus map from FIB milled relaxed left ventricular mouse myofibrils
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 9.2 Å

由来
  • mus musculus (ハツカネズミ)
キーワードSTRUCTURAL PROTEIN / muscle sarcomere calcium-free cardiac thin-filament / MOTOR PROTEIN / Mammalian / Muscle / Thick filament / Cardiac

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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