[日本語] English
文献
- EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース -

+
検索条件

キーワード
構造解析手法
著者・登録者
ジャーナル
IF

-
Structure paper

タイトルMolecular architecture of mammalian nitric oxide synthases.
ジャーナル・号・ページProc Natl Acad Sci U S A, Vol. 111, Issue 35, Page E3614-E3623, Year 2014
掲載日2014年9月2日
著者Melody G Campbell / Brian C Smith / Clinton S Potter / Bridget Carragher / Michael A Marletta /
PubMed 要旨NOSs are homodimeric multidomain enzymes responsible for producing NO. In mammals, NO acts as an intercellular messenger in a variety of signaling reactions, as well as a cytotoxin in the innate ...NOSs are homodimeric multidomain enzymes responsible for producing NO. In mammals, NO acts as an intercellular messenger in a variety of signaling reactions, as well as a cytotoxin in the innate immune response. Mammals possess three NOS isoforms--inducible, endothelial, and neuronal NOS--that are composed of an N-terminal oxidase domain and a C-terminal reductase domain. Calmodulin (CaM) activates NO synthesis by binding to the helical region connecting these two domains. Although crystal structures of isolated domains have been reported, no structure is available for full-length NOS. We used high-throughput single-particle EM to obtain the structures and higher-order domain organization of all three NOS holoenzymes. The structures of inducible, endothelial, and neuronal NOS with and without CaM bound are similar, consisting of a dimerized oxidase domain flanked by two separated reductase domains. NOS isoforms adopt many conformations enabled by three flexible linkers. These conformations represent snapshots of the continuous electron transfer pathway from the reductase domain to the oxidase domain, which reveal that only a single reductase domain participates in electron transfer at a time, and that CaM activates NOS by constraining rotational motions and by directly binding to the oxidase domain. Direct visualization of these large conformational changes induced during electron transfer provides significant insight into the molecular underpinnings governing NO formation.
リンクProc Natl Acad Sci U S A / PubMed:25125509 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度60.0 - 77.0 Å
構造データ

EMDB-2718:
Conformational Snapshots of Inducible Nitric Oxide Synthase (iNOS)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 65.0 Å

EMDB-2719:
Conformational Snapshots of Inducible Nitric Oxide Synthase (iNOS)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 74.0 Å

EMDB-2720:
Conformational Snapshots of Inducible Nitric Oxide Synthase (iNOS)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 60.0 Å

EMDB-2721:
Conformational Snapshots of Inducible Nitric Oxide Synthase (iNOS)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 66.0 Å

EMDB-2722:
Conformational Snapshots of Inducible Nitric Oxide Synthase (iNOS)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 66.0 Å

EMDB-2723:
Conformational Snapshots of Inducible Nitric Oxide Synthase (iNOS)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 69.0 Å

EMDB-2724:
Conformational Snapshots of Inducible Nitric Oxide Synthase (iNOS)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 65.0 Å

EMDB-2725:
Conformational Snapshots of Inducible Nitric Oxide Synthase (iNOS)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 67.0 Å

EMDB-2726:
Conformational Snapshots of Inducible Nitric Oxide Synthase (iNOS)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 71.0 Å

EMDB-2727:
Conformational Snapshots of Inducible Nitric Oxide Synthase (iNOS)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 67.0 Å

EMDB-2728:
Conformational Snapshots of Inducible Nitric Oxide Synthase (iNOS)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 64.0 Å

EMDB-2729:
Conformational Snapshots of Inducible Nitric Oxide Synthase (iNOS)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 73.0 Å

EMDB-2730:
Conformational Snapshots of Inducible Nitric Oxide Synthase (iNOS)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 66.0 Å

EMDB-2731:
Conformational Snapshots of Inducible Nitric Oxide Synthase (iNOS)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 65.0 Å

EMDB-2732:
Conformational Snapshots of Inducible Nitric Oxide Synthase (iNOS)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 70.0 Å

EMDB-2733:
Conformational Snapshots of Inducible Nitric Oxide Synthase (iNOS)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 63.0 Å

EMDB-2734:
Conformational Snapshots of Inducible Nitric Oxide Synthase (iNOS)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 62.0 Å

EMDB-2735:
Conformational Snapshots of Inducible Nitric Oxide Synthase (iNOS)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 73.0 Å

EMDB-2736:
Conformational Snapshots of Inducible Nitric Oxide Synthase (iNOS)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 69.0 Å

EMDB-2737:
Conformational Snapshots of Inducible Nitric Oxide Synthase (iNOS)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 66.0 Å

EMDB-2738:
Conformational Snapshots of Inducible Nitric Oxide Synthase (iNOS)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 67.0 Å

EMDB-2739:
Conformational Snapshots of Inducible Nitric Oxide Synthase (iNOS)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 67.0 Å

EMDB-2740:
Conformational Snapshots of Inducible Nitric Oxide Synthase (iNOS)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 64.0 Å

EMDB-2741:
Conformational Snapshots of Inducible Nitric Oxide Synthase (iNOS)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 69.0 Å

EMDB-2742:
Conformational Snapshots of Inducible Nitric Oxide Synthase (iNOS)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 68.0 Å

EMDB-2743:
Conformational Snapshots of Inducible Nitric Oxide Synthase (iNOS)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 73.0 Å

EMDB-2744:
Conformational Snapshots of Inducible Nitric Oxide Synthase (iNOS)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 77.0 Å

EMDB-2745:
Conformational Snapshots of Inducible Nitric Oxide Synthase (iNOS)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 65.0 Å

EMDB-2746:
Conformational Snapshots of Inducible Nitric Oxide Synthase (iNOS)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 69.0 Å

EMDB-2747:
Conformational Snapshots of Inducible Nitric Oxide Synthase (iNOS)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 65.0 Å

EMDB-2748:
Conformational Snapshots of Inducible Nitric Oxide Synthase (iNOS)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 67.0 Å

EMDB-2749:
Conformational Snapshots of Inducible Nitric Oxide Synthase (iNOS)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 74.0 Å

由来
  • Mus musculus (ハツカネズミ)

+
万見文献について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

-
万見文献

EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース

  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る