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タイトルHuman species D adenovirus hexon capsid protein mediates cell entry through a direct interaction with CD46.
ジャーナル・号・ページProc Natl Acad Sci U S A, Vol. 118, Issue 3, Year 2021
掲載日2021年1月19日
著者B David Persson / Lijo John / Karim Rafie / Michael Strebl / Lars Frängsmyr / Monika Z Ballmann / Katja Mindler / Menzo Havenga / Angelique Lemckert / Thilo Stehle / Lars-Anders Carlson / Niklas Arnberg /
PubMed 要旨Human adenovirus species D (HAdV-D) types are currently being explored as vaccine vectors for coronavirus disease 2019 (COVID-19) and other severe infectious diseases. The efficacy of such vector- ...Human adenovirus species D (HAdV-D) types are currently being explored as vaccine vectors for coronavirus disease 2019 (COVID-19) and other severe infectious diseases. The efficacy of such vector-based vaccines depends on functional interactions with receptors on host cells. Adenoviruses of different species are assumed to enter host cells mainly by interactions between the knob domain of the protruding fiber capsid protein and cellular receptors. Using a cell-based receptor-screening assay, we identified CD46 as a receptor for HAdV-D56. The function of CD46 was validated in infection experiments using cells lacking and overexpressing CD46, and by competition infection experiments using soluble CD46. Remarkably, unlike HAdV-B types that engage CD46 through interactions with the knob domain of the fiber protein, HAdV-D types infect host cells through a direct interaction between CD46 and the hexon protein. Soluble hexon proteins (but not fiber knob) inhibited HAdV-D56 infection, and surface plasmon analyses demonstrated that CD46 binds to HAdV-D hexon (but not fiber knob) proteins. Cryoelectron microscopy analysis of the HAdV-D56 virion-CD46 complex confirmed the interaction and showed that CD46 binds to the central cavity of hexon trimers. Finally, soluble CD46 inhibited infection by 16 out of 17 investigated HAdV-D types, suggesting that CD46 is an important receptor for a large group of adenoviruses. In conclusion, this study identifies a noncanonical entry mechanism used by human adenoviruses, which adds to the knowledge of adenovirus biology and can also be useful for development of adenovirus-based vaccine vectors.
リンクProc Natl Acad Sci U S A / PubMed:33384338 / PubMed Central
手法EM (単粒子) / X線回折
解像度1.38201802428 - 5.11 Å
構造データ

EMDB-11593:
The structure of HAdV-D56
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.82 Å

EMDB-11594:
The structure of HAdV-D56 in complex with CD46
手法: EM (単粒子) / 解像度: 5.11 Å

PDB-7ajp:
Crystal Structure of Human Adenovirus 56 Fiber Knob
手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.38201802428 Å

化合物

ChemComp-GOL:
GLYCEROL / グリセロ-ル / グリセリン

ChemComp-NO3:
NITRATE ION / 硝酸塩

ChemComp-EDO:
1,2-ETHANEDIOL / エチレングリコ-ル / エチレングリコール

ChemComp-PGE:
TRIETHYLENE GLYCOL / トリエチレングリコ-ル / ポリエチレングリコール

ChemComp-HOH:
WATER /

由来
  • Homo sapiens (ヒト)
  • human adenovirus 56 (ヒトアデノウイルス)
キーワードVIRAL PROTEIN (ウイルスタンパク質) / Human Adenovirus (アデノウイルス) / Fiber Knob

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EMN文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN文献

3DEM構造データから引用されている文献のデータベース

  • EMDDBとPDBの3次元電子顕微鏡エントリから引用されている文献のデータベースです。
  • PubMedのデータを利用しています。

関連情報:EMDB / PDB / Q: EM Navigatorの情報源は? / EM Navigator / 万見文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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