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タイトルAnthrax toxin receptor 1 is the cellular receptor for Seneca Valley virus.
ジャーナル・号・ページJ Clin Invest, Vol. 127, Issue 8, Page 2957-2967, Year 2017
掲載日2017年8月1日
著者Linde A Miles / Laura N Burga / Eric E Gardner / Mihnea Bostina / John T Poirier / Charles M Rudin /
PubMed 要旨Seneca Valley virus (SVV) is an oncolytic picornavirus with selective tropism for neuroendocrine cancers. It has shown promise as a cancer therapeutic in preclinical studies and early-phase clinical ...Seneca Valley virus (SVV) is an oncolytic picornavirus with selective tropism for neuroendocrine cancers. It has shown promise as a cancer therapeutic in preclinical studies and early-phase clinical trials. Here, we have identified anthrax toxin receptor 1 (ANTXR1) as the receptor for SVV using genome-wide loss-of-function screens. ANTXR1 is necessary for permissivity in vitro and in vivo. However, robust SVV replication requires an additional innate immune defect. We found that SVV interacts directly and specifically with ANTXR1, that this interaction is required for SVV binding to permissive cells, and that ANTXR1 expression is necessary and sufficient for infection in cell lines with decreased expression of antiviral IFN genes at baseline. Finally, we identified the region of the SVV capsid that is responsible for receptor recognition using cryoelectron microscopy of the SVV-ANTXR1-Fc complex. These studies identify ANTXR1, a class of receptor that is shared by a mammalian virus and a bacterial toxin, as the cellular receptor for SVV.
リンクJ Clin Invest / PubMed:28650343 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度18.0 Å
構造データ

EMDB-3303:
Cryo-EM reconstruction of Seneca VAlley Virus - receptor complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 18.0 Å

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EMN文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN文献

3DEM構造データから引用されている文献のデータベース

  • EMDDBとPDBの3次元電子顕微鏡エントリから引用されている文献のデータベースです。
  • PubMedのデータを利用しています。

関連情報:EMDB / PDB / Q: EM Navigatorの情報源は？ / EM Navigator / 万見文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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