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タイトルNeutralizing human monoclonal antibodies to poliovirus map to the receptor binding site.
ジャーナル・号・ページNat Commun, Vol. 17, Issue 1, Page 1512, Year 2026
掲載日2026年1月2日
著者Benjamin T Waddey / Andrew J Charnesky / Julia E Faust / Nadia M DiNunno / Rama Devudu Puligedda / Sung Hyun Cho / Carol M Bator / Steven D Dong / Kutub Mahmood / Konstantin M Chumakov / Scott K Dessain / Susan L Hafenstein /
PubMed 要旨Poliovirus remains a serious threat to human health. Complete eradication of wild-type poliovirus has not yet succeeded, making the development of successful antivirals critical. Microneutralization ...Poliovirus remains a serious threat to human health. Complete eradication of wild-type poliovirus has not yet succeeded, making the development of successful antivirals critical. Microneutralization assays against all three poliovirus serotypes identified a panel of human monoclonal IgGs, which are either serotype-specific or cross-neutralizing. Here, through cryoEM single particle analysis, we solved high resolution structures of four distinct poliovirus-FAb complexes. These antibodies bind to capsids at the circular depression (canyon) surrounding the icosahedral five-fold symmetry axis, which is also the binding site of the poliovirus receptor (PVR). Analysis of these structures confirms overlap of FAb contacts on the viral capsid with those of PVR. For three of the FAbs, the capsid residues are identified that dictate serotype-specific recognition. Contacts for the cross-neutralizing mAb 10D2 are located deep in the capsid canyon. These structural analyses indicate that antibody competition with the receptor likely leads to neutralization of virus particles and inhibition of poliovirus entry into host cells. Thus, the human IgGs studied here may facilitate development of therapeutics for the ongoing efforts in global eradication of poliovirus.
リンクNat Commun / PubMed:41484135 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度2.84 - 3.65 Å
構造データ

70318

9ocl

EMDB-70318, PDB-9ocl:
PV2-10D2 Complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.65 Å

70320

9oco

EMDB-70320, PDB-9oco:
SIPV3-2E1 Complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.95 Å

70339

9od3

EMDB-70339, PDB-9od3:
SIPV3-6B5 Complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.94 Å

70392

9oea

EMDB-70392, PDB-9oea:
SIPV1-5E12 Complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.84 Å

化合物

ChemComp-PLM:
PALMITIC ACID

由来
  • poliovirus 2 (ポリオウイルス)
  • homo sapiens (ヒト)
  • poliovirus 3 (ポリオウイルス)
  • human poliovirus 1 strain sabin (ポリオウイルス)
キーワードVIRUS / Antibody / Complex

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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