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Structure paper

タイトルStructural and functional basis of mechanosensitive TMEM63 channelopathies.
ジャーナル・号・ページNeuron, Vol. 113, Issue 15, Page 2474-22489.e5, Year 2025
掲載日2025年8月6日
著者Wang Zheng / Augustus J Lowry / Harper E Smith / Jiale Xie / Shaun Rawson / Chen Wang / Jin Ou / Marcos Sotomayor / Tian-Min Fu / Huanghe Yang / Jeffrey R Holt /
PubMed 要旨TMEM63A, -B, and -C constitute a mammalian family of mechanosensitive ion channels that are mutated in neurodevelopmental disorders. The molecular mechanisms underlying TMEM63 activation by force and ...TMEM63A, -B, and -C constitute a mammalian family of mechanosensitive ion channels that are mutated in neurodevelopmental disorders. The molecular mechanisms underlying TMEM63 activation by force and the impact of disease-associated mutations have not been clarified. Here, we elucidate the structural and functional bases of a prevalent TMEM63B mutation p.V44M. We first found that TMEM63B p.V44M and the homologous TMEM63A p.V53M are gain-of-function mutations that do not enhance channel activity but instead evoke constitutive lipid scramblase activity. We then solved TMEM63A p.V53M mutant structures in both closed and lipid-open states, which revealed major rearrangements of pore-lining helices, creating a lateral cleft across the membrane. Simulation studies revealed lipid scrambling through this cleft. The structural rearrangements were triggered by disruption of a surface-proximal hydrophobic latch, a putative force-sensing module that includes a cluster of disease mutation sites. Our findings provide mechanistic insight into TMEM63 channelopathies and suggest a possible force-sensing mechanism.
リンクNeuron / PubMed:40480214 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度2.95 - 3.65 Å
構造データ

49158

9n93

EMDB-49158, PDB-9n93:
Human TMEM63A mutant V53M lipid-open state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.95 Å

49160

9n95

EMDB-49160, PDB-9n95:
Human TMEM63A mutant V53M closed state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.65 Å

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードTRANSPORT PROTEIN / Ion channel / Mechanosensitive / lipid scramblase

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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