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タイトルStepwise recruitment of chaperone Hsc70 by DNAJB1 produces ordered arrays primed for bursts of amyloid fibril disassembly.
ジャーナル・号・ページCommun Biol, Vol. 8, Issue 1, Page 522, Year 2025
掲載日2025年3月30日
著者Jim Monistrol / Joseph G Beton / Erin C Johnston / Thi Lieu Dang / Bernd Bukau / Helen R Saibil /
PubMed 要旨The Hsp70 chaperone system is capable of disassembling pathological aggregates such as amyloid fibres associated with serious degenerative diseases. Here we examine the role of the J-domain protein ...The Hsp70 chaperone system is capable of disassembling pathological aggregates such as amyloid fibres associated with serious degenerative diseases. Here we examine the role of the J-domain protein co-factor in amyloid disaggregation by the Hsc70 system. We used cryo-EM and tomography to compare the assemblies with wild-type DNAJB1 or inactive mutants. We show that DNAJB1 binds regularly along α-synuclein amyloid fibrils and acts in a 2-step recruitment of Hsc70, releasing DNAJB1 auto-inhibition before activating Hsc70 ATPase. The wild-type DNAJB1:Hsc70:Apg2 complex forms dense arrays of chaperones on the fibrils, with Hsc70 on the outer surface. When the auto-inhibition is removed by mutating DNAJB1 (ΔH5 DNAJB1), Hsc70 is recruited to the fibrils at a similar level, but the ΔH5 DNAJB1:Ηsc70:Apg2 complex is inactive, binds less regularly to the fibrils and lacks the ordered clusters. Therefore, we propose that 2-step activation of DNAJB1 regulates the ordered assembly of Hsc70 on the fibril. The localised, dense packing of chaperones could trigger a cascade of recruitment and activation to give coordinated, sequential binding and disaggregation from an exposed fibril end, as previously observed in AFM videos. This mechanism is likely to be important in maintaining a healthy cellular proteome into old age.
リンクCommun Biol / PubMed:40159506 / PubMed Central
手法EM (トモグラフィー) / EM (らせん対称)
解像度3.2 - 25.0 Å
構造データ

EMDB-19441: Alpha-synuclein amyloid fibrils with DNAJB1-Helix V mutant, HSC70, HSP110 and ATP
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-19443: Alpha-synuclein amyloid fibrils with WT DNAJB1, HSC70, HSP110 and ATP
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-19444: Alpha-synuclein amyloid fibrils with WT DNAJB1, HSC70, HSP110 and ATP
手法: EM (トモグラフィー)

19446

8rqm

EMDB-19446, PDB-8rqm:
Alpha-synuclein amyloid fibrils
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.2 Å

EMDB-19447: Alpha-synuclein amyloid fibrils with deltaJ DNAJB1
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 25.0 Å

EMDB-19448: Alpha-synuclein amyloid fibrils with DNAJB1-Helix V mutant, HSC70, HSP110 and ATP
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-19461: Alpha-synuclein amyloid fibrils with WT DNAJB1
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 11.16 Å

19462

8rrr

EMDB-19462, PDB-8rrr:
Alpha-synuclein amyloid fibril
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.4 Å

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードPROTEIN FIBRIL / Chaperones / amyloid fibril

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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