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タイトルSpatial Organization and Molecular Interactions of the Schizosaccharomyces pombe Ccq1-Tpz1-Poz1 Shelterin Complex.
ジャーナル・号・ページJ Mol Biol, Vol. 429, Issue 19, Page 2863-2872, Year 2017
掲載日2017年9月15日
著者Harry Scott / Jin-Kwang Kim / Clinton Yu / Lan Huang / Feng Qiao / Derek J Taylor /
PubMed 要旨The shelterin complex is a macromolecular assembly of proteins that binds to and protects telomeric DNA, which composes the ends of all linear chromosomes. Shelterin proteins prevent chromosome ends ...The shelterin complex is a macromolecular assembly of proteins that binds to and protects telomeric DNA, which composes the ends of all linear chromosomes. Shelterin proteins prevent chromosome ends from fusing together and from eliciting erroneous induction of DNA damage response pathways. In addition, shelterin proteins play key roles in regulating the recruitment and activation of telomerase, an enzyme that extends telomeric DNA. In fission yeast, Schizosaccharomyces pombe, interactions between the shelterin proteins Ccq1, Tpz1, and Poz1 are important for regulating telomerase-mediated telomere synthesis and thus telomere length homeostasis. Here, we used electron microscopy combined with genetic labeling to define the three-dimensional arrangement of the S. pombe Ccq1-Tpz1-Poz1 (CTP) complex. Crosslinking mass spectrometry was used to identify individual residues that are in proximity to the protein-protein interfaces of the assembled CTP complex. Together, our data provide a first glimpse into the architectural design of the CTP complex and reveals unique interactions that are important in maintaining the S. pombe telomere in a non-extendible state.
リンクJ Mol Biol / PubMed:28807855 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度25.9 - 34.4 Å
構造データ

EMDB-8863:
Negative-stain reconstruction of the S. pombe CTP complex (Ccq1 2-716, Tpz1 406-508, Poz1 2-249)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 34.4 Å

EMDB-8864:
Negative-stain reconstruction of an N-terminally MBP tagged Ccq1 in the S. pombe CTP complex (Ccq1 2-716, Tpz1 406-508, Poz1 2-249)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 30.8 Å

EMDB-8865:
Negative-stain reconstruction of an N-terminally MBP tagged Poz1 in the S. pombe CTP complex (Ccq1 2-716, Tpz1 406-508, Poz1 2-249)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 30.7 Å

EMDB-8866:
Negative-stain reconstruction of a C-terminal truncation in Ccq1 of the the S. pombe CTP complex (Ccq1 2-439, Tpz1 406-508, Poz1 2-249)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 25.9 Å

由来
  • Schizosaccharomyces pombe (分裂酵母)

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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