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キーワード
構造解析手法	All X線回折 NMR 電子顕微鏡小角散乱中性子線回折線維回折粉末回折赤外分光 EPR FRET 理論モデルハイブリッド
著者・登録者
ジャーナル
IF	>30 >20 >10 >5 all

タイトル	Structural characterization of Helicobacter pylori dethiobiotin synthetase reveals differences between family members.
ジャーナル・号・ページ	Febs J., Vol. 279, Page 1093-1105, Year 2012
掲載日	2007年7月16日 (構造データの登録日)
著者	Porebski, P.J. / Klimecka, M. / Chruszcz, M. / Nicholls, R.A. / Murzyn, K. / Cuff, M.E. / Xu, X. / Cymborowski, M. / Murshudov, G.N. / Savchenko, A. ...Porebski, P.J. / Klimecka, M. / Chruszcz, M. / Nicholls, R.A. / Murzyn, K. / Cuff, M.E. / Xu, X. / Cymborowski, M. / Murshudov, G.N. / Savchenko, A. / Edwards, A. / Minor, W.
リンク	Febs J. / PubMed:22284390
手法	X線回折
解像度	1.34 - 2.8 Å
構造データ	PDB-2qmo: Crystal structure of dethiobiotin synthetase (bioD) from Helicobacter pylori 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.47 Å PDB-3mle: Crystal structure of dethiobiotin synthetase (BioD) from Helicobacter pylori cocrystallized with ATP 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.8 Å PDB-3qxc: Crystal structure of dethiobiotin synthetase (BioD) from Helicobacter pylori complexed with ATP 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.34 Å PDB-3qxh: Crystal structure of dethiobiotin synthetase (BioD) from Helicobacter pylori complexed with ADP and 8-aminocaprylic acid 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.36 Å PDB-3qxj: Crystal structure of dethiobiotin synthetase (BioD) from Helicobacter pylori complexed with GTP 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.38 Å PDB-3qxs: Crystal structure of dethiobiotin synthetase (BioD) from Helicobacter pylori complexed with ANP 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.35 Å PDB-3qxx: Crystal structure of dethiobiotin synthetase (BioD) from Helicobacter pylori complexed with GDP and 8-aminocaprylic acid 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.36 Å PDB-3qy0: Crystal structure of dethiobiotin synthetase (BioD) from Helicobacter pylori complexed with GDP 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.6 Å
化合物	ChemComp-CL: Unknown entry / クロリド ChemComp-HOH: WATER ChemComp-PO4: PHOSPHATE ION / ホスファ-ト ChemComp-MG: Unknown entry / マグネシウムジカチオン ChemComp-NO3: NITRATE ION ChemComp-8AC: 8-aminooctanoic acid / 8-アミノオクタン酸 ChemComp-ADP: ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / ADP / ADP, エネルギー貯蔵分子YM ChemComp-ATP: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / ATP / ATP, エネルギー貯蔵分子YM ChemComp-EDO: 1,2-ETHANEDIOL / エチレングリコ-ル ChemComp-GOL: GLYCEROL / グリセロ-ル ChemComp-PEG: DI(HYDROXYETHYL)ETHER / ジエチレングリコ-ル ChemComp-GTP: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / GTP / GTP, エネルギー貯蔵分子YM ChemComp-ANP: PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER / AMP-PNP / AMP-PNP, エネルギー貯蔵分子類似体YM ChemComp-GDP: GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE / GDP / GDP, エネルギー貯蔵分子*YM
由来	helicobacter pylori (ピロリ菌)
キーワード	LIGASE / dethiobiotin synthetase / structural genomics / PSI-2 / Protein Structure Initiative / Midwest Center for Structural Genomics / MCSG / ATP-binding / Biotin biosynthesis / Magnesium / Nucleotide-binding / DTBS / ATP binding / PSI-BIOLOGY / ADP binding