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タイトルInteraction with AK2A links AIFM1 to cellular energy metabolism.
ジャーナル・号・ページMol Cell, Vol. 85, Issue 13, Page 2550-22566.e6, Year 2025
掲載日2025年7月3日
著者Robin Alexander Rothemann / Egor Pavlenko / Mrityunjoy Mondal / Sarah Gerlich / Pavel Grobushkin / Sebastian Mostert / Julia Racho / Konstantin Weiss / Dylan Stobbe / Katharina Stillger / Kim Lapacz / Silja Lucia Salscheider / Carmelina Petrungaro / Dan Ehninger / Thi Hoang Duong Nguyen / Jörn Dengjel / Ines Neundorf / Daniele Bano / Simon Poepsel / Jan Riemer /
PubMed 要旨Apoptosis-inducing factor 1 (AIFM1) is a flavoprotein essential for mitochondrial function and biogenesis. Its interaction with MIA40/CHCHD4, the central component of the mitochondrial disulfide ...Apoptosis-inducing factor 1 (AIFM1) is a flavoprotein essential for mitochondrial function and biogenesis. Its interaction with MIA40/CHCHD4, the central component of the mitochondrial disulfide relay, accounts for some, but not all, aspects of AIFM1 function. We provide a high-confidence AIFM1 interactome that elucidates functional partners within the mitochondrial intermembrane space. We found that AIFM1 binding to adenylate kinase 2 (AK2), an essential enzyme that maintains cellular adenine nucleotide pools, depends on the AK2 C-terminal domain. High-resolution cryoelectron microscopy (cryo-EM) and biochemical analyses showed that both MIA40 and AK2A bind the AIFM1 C-terminal β-sheet domain. Their binding enhances NADH oxidoreductase activity by locking an active dimer conformation and, in the case of MIA40, affecting the cofactor-binding site. The AIFM1-AK2A interaction is important during mitochondrial respiration because AIFM1 serves as a recruiting hub within the IMS, regulating mitochondrial bioenergetic output by creating hotspots of metabolic enzymes.
リンクMol Cell / PubMed:40578348
手法EM (単粒子)
解像度2.36 - 2.8 Å
構造データ

EMDB-51514, PDB-9gqy:
Interaction with AK2A links AIFM1 to cellular energy metabolism. The cryo-EM structure of dimeric AIFM1 without any binding partner.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.8 Å

EMDB-51515, PDB-9gqz:
Interaction with AK2A links AIFM1 to cellular energy metabolism. The cryo-EM structure of dimeric AIFM1 engaged to MIA40.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.36 Å

EMDB-51516, PDB-9gr0:
Interaction with AK2A links AIFM1 to cellular energy metabolism. The cryo-EM structure of dimeric AIFM1 bound by AK2A.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.61 Å

化合物

ChemComp-FAD:
FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE / FAD / FAD*YM

ChemComp-NAD:
NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE / NAD*YM

ChemComp-HOH:
WATER

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードFLAVOPROTEIN / Complex / Homodimer / NADH / FAD / Reduced / Tetramer

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EMN文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN文献

3DEM構造データから引用されている文献のデータベース

  • EMDDBとPDBの3次元電子顕微鏡エントリから引用されている文献のデータベースです。
  • PubMedのデータを利用しています。

関連情報:EMDB / PDB / Q: EM Navigatorの情報源は? / EM Navigator / 万見文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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