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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 6fye | ||||||
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タイトル | The crystal structure of EncM H138T mutant | ||||||
![]() | Putative FAD-dependent oxygenase EncM | ||||||
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機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Saleem-Batcha, R. / Teufel, R. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Enzymatic control of dioxygen binding and functionalization of the flavin cofactor. 著者: Saleem-Batcha, R. / Stull, F. / Sanders, J.N. / Moore, B.S. / Palfey, B.A. / Houk, K.N. / Teufel, R. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 191.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 152 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 6foqC ![]() 6fowC ![]() 6fp3C ![]() 6fy8C ![]() 6fy9C ![]() 6fyaC ![]() 6fybC ![]() 6fycC ![]() 6fydC ![]() 6fyfC ![]() 6fygC ![]() 4xloS C: 同じ文献を引用 ( S: 精密化の開始モデル |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 50037.328 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 遺伝子: encM / 発現宿主: ![]() ![]() ![]() #2: 化合物 | ![]() #3: 水 | ChemComp-HOH / | ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.14 Å3/Da / 溶媒含有率: 42.49 % |
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結晶化![]() | 温度: 295 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 詳細: 0.1M HEPES-Na, 0.2M Calcium Acetate, 20% - 30% PEG 3350, pH 7.5 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: DECTRIS EIGER X 16M / 検出器: PIXEL / 日付: 2016年3月13日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長![]() |
反射 | 解像度: 2.3→42.92 Å / Num. obs: 38810 / % possible obs: 99.8 % / 冗長度: 13.4 % / Rmerge(I) obs: 0.1 / Net I/σ(I): 15.9 |
反射 シェル | 解像度: 2.3→2.42 Å / Rmerge(I) obs: 0.48 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法![]() ![]() 開始モデル: 4XLO 解像度: 2.3→42.917 Å / SU ML: 0.24 / 交差検証法: NONE / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 24.09
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.3→42.917 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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