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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3lu7 | ||||||
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タイトル | Human serum albumin in complex with compound 2 | ||||||
![]() | Serum albumin![]() | ||||||
![]() | ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() | ||||||
機能・相同性 | ![]() cellular response to calcium ion starvation / ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Buttar, D. / Colclough, N. / Gerhardt, S. / MacFaul, P.A. / Phillips, S.D. / Plowright, A. / Whittamore, P. / Tam, K. / Maskos, K. / Steinbacher, S. / Steuber, H. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: A combined spectroscopic and crystallographic approach to probing drug-human serum albumin interactions 著者: Buttar, D. / Colclough, N. / Gerhardt, S. / Macfaul, P.A. / Phillips, S.D. / Plowright, A. / Whittamore, P. / Tam, K. / Maskos, K. / Steinbacher, S. / Steuber, H. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 229 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 193.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | ![]() 分子量: 66571.219 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() ![]() #2: 化合物 | #3: 化合物 | ChemComp-PO4 / ![]() #4: 水 | ChemComp-HOH / | ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.38 Å3/Da / 溶媒含有率: 48.45 % |
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結晶化![]() | 温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7.4 詳細: PEG, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MAR CCD 165 mm / 検出器: CCD / 日付: 2007年6月9日 |
放射 | モノクロメーター: SAGITALLY FOCUSED Si(111) / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長![]() |
反射 | 解像度: 2.8→92.45 Å / Num. all: 29572 / Num. obs: 29572 / % possible obs: 92.9 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 2.1 % / Rmerge(I) obs: 0.1 / Net I/σ(I): 4.9 |
反射 シェル | 解像度: 2.8→2.95 Å / 冗長度: 2.1 % / Rmerge(I) obs: 0.546 / Mean I/σ(I) obs: 1.2 / % possible all: 90.3 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.8→55.44 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.929 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.894 / SU B: 17.738 / SU ML: 0.347 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R Free: 0.481 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
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溶媒の処理 | イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 66.006 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.8→55.44 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 2.8→2.873 Å / Total num. of bins used: 20
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