キーワード:cpk
、load
、select
、spacefill
、原子表現
load ftp 1mbn |
PDB ID「1mbn」のデータを読み込みます。 |
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select hem |
グループ「hem」に所属する原子を選択します。 |
[Display]-[Ball&Stick] | 選択範囲(hemグループ)の各原子を棒球表現で表示します。 |
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select iron |
鉄原子(Fe)だけを選択します(select elemno=26 、原子番号26の原子を選択としても同じ)。
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cpk |
選択範囲の原子(鉄原子)を空間充填表現(spacefill)で表示します。 |
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select atomno=1217 |
原子の固有番号1217番の原子(酸素)を選択します。
原子の固有番号はPDBMLファイルの "PDBx:atom_siteCategory/PDBx:atom_site" 要素の id 属性の値で確認できます(原子表現も参照のこと)。
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cpk |
選択範囲の原子(酸素原子)を空間充填表現(spacefill)で表示します。 |
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