例006:水素結合

キーワード:hbond

load ftp 1smd PDBID 1SMD のファイルを読み込みます(→load コマンド参照)。
1SMD
(右上部分を拡大したもの)
hbond on (分子全体)の水素結合を表示。
1SMD, hydrogen bonds are turned on
hbond 0.2 選択範囲(分子全体)の水素結合を半径0.2Åの太さで表示。
1SMD, hydrogen bonds are turned on with 0.2 angstrom radius
hbond off 選択範囲(分子全体)の水素結合表示を消去。
1SMD
select 470:a | 473:a a鎖の470番残基と473番残基を選択(→select コマンド、比較演算子参照)。
hbond 0.2 選択範囲(470,473番残基)にある水素結合を半径0.2Åの太さで表示。
1SMD