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生物種
- EMDB/PDB/SASBDBの生物種情報 -

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キーワード検索の結果

7,100件中、1から20件目までを表示しています

名称EMDBPDBSASBDB
Homo sapiens (ヒト)128039694183
Escherichia coli (大腸菌)599780648
Mus musculus (ハツカネズミ)286606142
Saccharomyces cerevisiae (パン酵母)65434007
synthetic construct (人工物)304326227
Bos taurus (ウシ)285275821
Rattus norvegicus (ドブネズミ)14928451
Mycobacterium tuberculosis (結核菌)2018584
Human immunodeficiency virus 1 (ヒト免疫不全ウイルス)19314950
Gallus gallus (ニワトリ)4115926
Thermus thermophilus (サーマス・サーモフィルス)4214960
Pseudomonas aeruginosa (緑膿菌)2014091
Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)18133111
Bacillus subtilis (枯草菌)4312771
Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)13116917
Escherichia coli K-12 (大腸菌)8894910
Oryctolagus cuniculus (ウサギ)1877921
Escherichia virus T4 (T4ファージ)339020
Sus scrofa (ブタ)818520
Drosophila melanogaster (キイロショウジョウバエ)468707

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万見生物種について

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お知らせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。詳細は下記のリンクをご覧ください。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク: wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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2017年6月16日: Omokage検索で絞り込み

Omokage検索で絞り込み

  • Omokage検索の結果をキーワードとデータベースの種類で絞り込むことができるようになりました。

関連情報: Omokage検索

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2016年9月15日: 新しくなったEM Navigatorと万見

新しくなったEM Navigatorと万見

  • EM Navigatorと万見を刷新しました

関連情報: 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見

新しいEM Navigatorと万見

  • これまで開発版として公開していたEM Navigatorと万見が、9月15日から正式版となります。
  • 現行版も「旧版」としてしばらく公開を継続します。

関連情報: 新しいEM Navigatorと万見の変更点 / EM Navigator / 万見 (Yorodumi)

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2016年4月13日: Omokage検索が速くなりました

Omokage検索が速くなりました

  • データアクセスプロセスを見直し、計算時間をこれまでの半分程度に短縮しました。
  • これまで以上に、生体分子の「カタチの類似性」をお楽しみください!

関連情報: Omokage検索

すべてのお知らせ

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万見生物種

EMDB/PDB/SASBDBの生物種情報

  • EMDB/PDB/SASBDBの構造データの試料情報、由来する生物種に関するデータベース

関連情報: EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較

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