PDB-7azv: Crystal structure of a shortened IpgC variant in complex with 4-(...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 7azv

タイトル

Crystal structure of a shortened IpgC variant in complex with 4-(trifluoromethyl)benzene-1-carboximidamide

要素

Chaperone protein IpgC

シャペロン

キーワード

CHAPERONE (シャペロン) / IpgC / Dimer /

Shigella (赤痢菌) /

Mutant (ミュータント (人類)) /

Magnesium (マグネシウム) /

Chlorine (塩素) / 4-(trifluoromethyl)benzene-1-carboximidamide

機能・相同性

Tetratricopeptide TPR-3 /

Tetratricopeptide repeat /

Type III secretion system, low calcium response, chaperone LcrH/SycD, subgroup /

Type III secretion system, low calcium response, chaperone LcrH/SycD / Tetratricopeptide-like helical domain superfamily / identical protein binding /

細胞質 / 4-(trifluoromethyl)benzenecarboximidamide /

Chaperone protein IpgC

機能・相同性情報

生物種

Shigella flexneri (フレクスナー赤痢菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.68 Å

データ登録者

Gardonyi, M. / Heine, A. / Klebe, G.

引用

ジャーナル: To be published
タイトル: Crystal structure of a shortened IpgC variant in complex with 4-(trifluoromethyl)benzene-1-carboximidamide
著者: Gardonyi, M. / Heine, A. / Klebe, G.

履歴

登録	2020年11月17日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2021年12月1日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2024年1月31日	Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model / struct_ncs_dom_lim Item: _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id ..._struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	7azv.cif.gz	208.9 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb7azv.ent.gz	140.4 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	7azv.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/az/7azv ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/az/7azv	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	6scbS S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	1do6-d 3qva-d 1wxh-d 6scb-d 3o52-1 5cwl-d 2iab-d 7ayw-d 1ywq-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#32 - 2002年8月シャペロン (Chaperones) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Chaperone protein IpgC

B: Chaperone protein IpgC

ヘテロ分子

33.2 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者が定義した集合体
根拠: gel filtration

単位格子

Length a, b, c (Å)	58.368, 58.368, 155.040
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 120.000
Int Tables number	154
Space group name H-M	P3₂21
Space group name Hall	P3₂2"
Symmetry operation	#1: x,y,z #2: -y,x-y,z+2/3 #3: -x+y,-x,z+1/3 #4: x-y,-y,-z+1/3 #5: -x,-x+y,-z+2/3 #6: y,x,-z

Components on special symmetry positions

ID	モデル	要素
1	1	A-205- FBF
2	1	A-205- FBF
3	1	A-205- FBF
4	1	A-205- FBF

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID
1	1
2	1

NCSドメイン領域:

Ens-ID: 1

Dom-ID	Component-ID	Beg auth comp-ID	Beg label comp-ID	End auth comp-ID	End label comp-ID	Selection details	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	GLY	GLY	ASN	ASN	(chain 'A' and (resid 9 through 20 or (resid 21...	A	A	9 - 20	1 - 12
1	2	ILE	ILE	LYS	LYS	(chain 'A' and (resid 9 through 20 or (resid 21...	A	A	31 - 49	23 - 41
1	3	ILE	ILE	PHE	PHE	(chain 'A' and (resid 9 through 20 or (resid 21...	A	A	52 - 59	44 - 51
1	4	PHE	PHE	ASN	ASN	(chain 'A' and (resid 9 through 20 or (resid 21...	A	A	61 - 69	53 - 61
1	5	ASP	ASP	TYR	TYR	(chain 'A' and (resid 9 through 20 or (resid 21...	A	A	71 - 72	63 - 64
1	6	MET	MET	GLN	GLN	(chain 'A' and (resid 9 through 20 or (resid 21...	A	A	74 - 144	66 - 136
1	7	TYR	TYR	ALA	ALA	(chain 'A' and (resid 9 through 20 or (resid 21...	A	A	146 - 149	138 - 141
2	8	GLY	GLY	ASN	ASN	(chain 'B' and (resid 9 through 34 or (resid 35...	B	B	9 - 20	1 - 12
2	9	ILE	ILE	LYS	LYS	(chain 'B' and (resid 9 through 34 or (resid 35...	B	B	31 - 49	23 - 41
2	10	ILE	ILE	PHE	PHE	(chain 'B' and (resid 9 through 34 or (resid 35...	B	B	52 - 59	44 - 51
2	11	PHE	PHE	ASN	ASN	(chain 'B' and (resid 9 through 34 or (resid 35...	B	B	61 - 69	53 - 61
2	12	ASP	ASP	TYR	TYR	(chain 'B' and (resid 9 through 34 or (resid 35...	B	B	71 - 72	63 - 64
2	13	MET	MET	GLN	GLN	(chain 'B' and (resid 9 through 34 or (resid 35...	B	B	74 - 144	66 - 136
2	14	TYR	TYR	ALA	ALA	(chain 'B' and (resid 9 through 34 or (resid 35...	B	B	146 - 149	138 - 141

NCSアンサンブル:

ID
1
2

#1: タンパク質	Chaperone protein IpgC / シャペロン分子量: 16310.492 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Shigella flexneri (フレクスナー赤痢菌) 遺伝子: ipgC, ippI, CP0129 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P0A2U4
#2: 化合物	ChemComp-CL / CHLORIDE ION / クロリド / 塩化物分子量: 35.453 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cl
#3: 化合物	ChemComp-FBF / 4-(trifluoromethyl)benzenecarboximidamide / 4-(トリフルオロメチル)ベンズアミジン分子量: 188.150 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₈H₇F₃N₂
#4: 化合物	ChemComp-MG / MAGNESIUM ION / マグネシウムジカチオン分子量: 24.305 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: Mg
#5: 水	ChemComp-HOH / water / 水分子量: 18.015 Da / 分子数: 201 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
研究の焦点であるリガンドがあるか	N

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.33 Å³/Da / 溶媒含有率: 47.18 %
結晶化	温度: 291 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法詳細: 30% PEG 4000, 0.1 M TRIS (pH 7.0), 0.3 M magnesium chloride

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: BESSY / ビームライン: 14.2 / 波長: 0.9184 Å
検出器	タイプ: DECTRIS PILATUS3 2M / 検出器: PIXEL / 日付: 2019年11月9日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.9184 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.68→50 Å / Num. obs: 35809 / % possible obs: 99.9 % / 冗長度: 7.1 % / B_iso Wilson estimate: 25.07 Å² / CC_1/2: 1 / R_sym value: 0.059 / Net I/σ(I): 19.06
反射シェル	解像度: 1.68→1.77 Å / Num. unique obs: 5690 / CC_1/2: 0.786 / R_sym value: 0.843

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.16	精密化
XDS	1.02	データ削減
XDS	1.02	データスケーリング
PHASER	7.0.047	位相決定
Coot	0.8.9	モデル構築

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 6scb

6scb

解像度: 1.68→24.94 Å / SU ML: 0.1817 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.37 / 位相誤差: 20.0456
立体化学のターゲット値: GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.2083	1790	5 %	Random selection
R_work	0.1788	33996	-	-
obs	0.1803	35786	99.85 %	-

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso mean: 29.67 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.68→24.94 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	2156	0	29	201	2386

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.0087	2286
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.8892	3107
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.0525	339
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.0068	419
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	15.8879	1366

LS精密化シェル

解像度: 1.68→1.73 Å

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2714	135	-
R_work	0.2468	2557	-
obs	-	-	99.67 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.0395070529923	-0.0095369916939	-0.0147944976304	0.0294040239162	-0.0513992161423	0.110505846519	0.19822380692	0.329832038453	-0.0223273602442	-0.0339520441965	0.34527951642	0.263135853402	0.155169803744	0.140748923897	-8.42333916993E-5	0.283713632937	-0.0353854410214	-0.0230721109625	0.429784820999	-0.0248879804518	0.38876213427	-16.0564905147	12.6695699933	186.636088506
2	0.139037769208	-0.167817930115	-0.213302116977	0.329975962897	0.25418104619	0.333610786421	-0.10331200221	0.188115549314	0.208546577804	-0.201029691753	-0.188345070682	0.419640795884	0.585072545124	0.506528384957	-0.0145725145829	0.224446494481	0.0450532214687	-0.0246435691026	0.312579318148	0.00403157850703	0.272724196925	-22.2189091832	8.85233865957	179.962917988
3	0.027546247249	0.0243156782131	-0.00892116860931	0.0327424938273	-0.0302046161504	0.0393474697086	0.261583938321	-0.0834304680252	-0.421493977586	-0.0917219173764	-0.0897799109833	-0.00173793925922	0.326513039683	-0.113707451721	-0.000564682215115	0.223723160257	-0.0109696578162	-0.0288097201713	0.26572721396	0.00928719647327	0.26474859952	-32.0926805115	8.80492141055	175.651229272
4	0.127074173197	-0.115615428353	0.0251091413843	0.106280848476	-0.0489225823345	0.0457929629742	0.00104571743554	0.226902115977	0.139013986426	-0.302924304395	0.0291045234686	0.0621364979424	-0.287008894317	-0.0854923273619	-0.000135939049869	0.202311040696	0.0351337728928	-0.0266592154957	0.317545783932	-0.0252091743998	0.2381216682	-39.9646819745	21.0566855338	173.140213343
5	0.428119857694	0.355956663752	-0.108716552502	0.348927755079	-0.20318532268	0.421367277966	0.0404011769212	0.0512878504314	0.0482660330895	0.0358937855854	-0.0187214356375	-0.0207316299128	0.0132210439672	-0.0951611919765	5.99780023176E-5	0.162834187936	0.0164702455136	0.00547351515103	0.233935860282	0.0106209560677	0.193573453803	-28.3776353154	20.7567817479	174.398052819
6	0.0403406123133	0.0189004440283	-0.0456020746085	0.0460963856877	-0.0153962121297	0.0460968051299	-0.0746045051704	0.04847006066	0.160273891207	0.187773740352	0.120001210549	0.247603634729	-0.291997277687	-0.367951274566	0.000329863348416	0.242245353482	0.078494754657	0.0581640768805	0.312767139663	0.0288386197162	0.276325101951	-33.2303689227	32.819284489	171.767270503
7	0.0120288085229	-0.00445779366977	-0.019379227553	0.0100269106623	0.0136159697428	0.0349381317668	-0.18295796356	-0.374770677149	0.416690146006	0.267091630158	0.181221930381	-0.382294397263	-0.225787119764	0.0603171713074	0.000154317525793	0.238285741997	0.0238118688213	-5.16225442517E-5	0.302692438494	-0.016842626093	0.264191085901	-26.7875364421	35.1886988842	170.260673454
8	0.208380090153	0.151702810975	0.147104565466	0.218222582157	0.132286975206	0.112364372394	-0.368793821108	-0.142419196508	0.0873374768299	-0.0880948461522	-0.16265173949	0.535063126728	-0.853324895263	0.226462972137	-0.00899778064486	0.30729876943	-0.00809835723585	-0.0335062086385	0.448080794447	-0.040739130088	0.346806196755	-18.7605937604	26.8599044672	176.784833524
9	0.457374174197	0.393757848399	0.350644098391	0.320919727962	0.300768828484	0.270658988749	0.0271808648717	-0.151336507175	0.477106039116	0.0919160890699	-0.132472709128	-0.165720920798	-0.0251786469434	0.00779536996045	2.99945317017E-5	0.247695300442	0.00213326820207	0.00698633661603	0.28649664904	-0.0123712787573	0.252691938168	2.85318590345	35.744260502	171.363105628
10	0.0394840117732	0.0212084010521	0.0743088749172	0.248127472975	0.036964473823	0.490320525921	0.121750294061	-0.116855962968	-0.258129408875	0.00686594891982	0.0846696942771	0.14225972127	0.0565948243051	-0.14328798618	0.000540238804377	0.197368098359	0.00614110639949	-0.015132376002	0.264653672755	0.0199812700107	0.229525536608	-4.61671358027	29.8313855048	173.890508353
11	0.414386126381	0.229416802957	0.47307793548	0.355806816432	0.501721530218	0.745878853952	-0.0537742207533	-0.122261693356	-0.0532397859026	-0.0190917121928	0.105895298923	-0.0422837442417	0.0397423171241	0.0107121134559	8.39388846112E-5	0.259231909764	0.00574188099735	0.00252937505017	0.227844991267	0.00905884732341	0.222996226747	-6.89334762705	24.4186240221	165.027889222
12	0.0475427527056	-0.0332766692274	-0.00158156629123	0.0253828156552	-0.00908851013872	0.0332212040053	0.154926749435	0.00707686133135	0.154806505574	-0.183694544322	0.29965971883	0.0485339018632	0.0843303714165	-0.343383646433	9.63070101336E-6	0.43707693862	0.099675995106	-0.0704525980797	0.401373608348	-0.0462231918501	0.469602251486	-13.3262828461	33.44859582	156.674613084
13	0.0611025952252	-0.0366893770417	0.0635948681387	0.102381248843	0.0155395410439	0.483335105744	-0.0434444043006	0.0868821922408	-0.167364127988	-0.296183655047	0.200200813547	0.191301278514	0.473430113522	-0.190936291087	9.40251076417E-5	0.309536047171	-0.0251681841541	-0.0193866734833	0.258640025708	-0.014738981747	0.26108145469	-8.30505561889	17.6756599348	155.207633454
14	0.0922055493894	0.0759880793995	-0.00402714148203	0.0622533585213	-0.0225392860575	0.0680542371773	0.141340727002	-0.0856521258692	-0.155553598618	-0.0954583791081	-0.082346374223	0.391502456905	0.274115338915	-0.163803918916	-0.000235168512511	0.295239231463	-0.00317652942239	-0.0122088709114	0.298550996039	0.0181455377809	0.25683699439	-11.689873311	23.2130236644	147.478228585
15	0.55317411073	-0.042149232677	-0.032634972642	0.0291295917512	-0.0786317030177	0.47897858627	-0.0225793492221	0.187458374697	6.40963563584E-5	-0.149613865208	-0.0985568965054	0.177209460222	0.203601626034	0.443116728039	-0.000149032506043	0.315928990663	0.0549766499431	0.00700897813024	0.253991016313	0.00977217540023	0.250037049714	-3.34178381956	22.106149594	145.615913115
16	0.51062483152	-0.159306702332	0.128660653946	0.0465154501424	-0.0446010542317	0.806881972532	-0.0155199858172	-0.0695712291526	0.0663271813665	0.102114131879	0.0852571510846	0.025286243925	0.0227478085509	0.176061725886	7.73073998859E-5	0.173231494049	0.00765973178981	0.00441288400493	0.229301334229	0.00385102786738	0.216650813639	-24.9733396554	31.186733113	161.788999448
17	0.238222448697	-0.129910509629	-0.0137419430806	0.0703103156995	0.0233075381071	0.0403056183443	0.153314805807	0.078380624603	0.0319128142322	-0.213337840321	0.152002688392	-0.410242458136	-0.0835719120593	0.515305256828	-0.000168226550283	0.206077336719	0.00912091340497	0.0151547128417	0.283072501166	0.0196202466546	0.254847654229	-22.6272913922	33.4002569482	152.670643892
18	0.20272006819	0.0455326938569	0.158880265401	0.104023356494	0.062626590294	0.115524070582	0.0295938484269	-0.0362244841986	-0.126367802082	-0.325750554969	-0.0797119511583	-0.138078827411	0.0841520971121	-0.111462003718	-0.000109030082285	0.234464144582	0.0330359935945	-0.0343861260272	0.254468032308	-0.00993361242355	0.279633641481	-30.9831937394	31.5644991357	149.630994281

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 9 through 24 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 25 through 32 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 33 through 39 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 40 through 53 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 54 through 78 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 79 through 85 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'A' and (resid 86 through 89 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 9 through 21 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 31 through 51 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 52 through 68 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 69 through 98 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resid 99 through 103 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resid 104 through 124 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'B' and (resid 125 through 134 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'B' and (resid 135 through 150 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'A' and (resid 90 through 121 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'A' and (resid 122 through 134 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'A' and (resid 135 through 150 )

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-ダウンロード

-検証レポート

-関連構造データ

-リンク

-集合体

-要素

-実験情報

-実験

-試料調製

-データ収集

-解析

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)