PDB-6f3t: Crystal structure of the human TAF5-TAF6-TAF9 complex

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 6f3t

タイトル

Crystal structure of the human TAF5-TAF6-TAF9 complex

要素

Transcription initiation factor TFIID subunit 5
Transcription initiation factor TFIID subunit 6
Transcription initiation factor TFIID subunit 9

キーワード

TRANSCRIPTION (転写 (生物学)) /

Complex /

TFIID (TFIID) / TAF / TBD-associated Factor

機能・相同性

機能・相同性情報

pre-snoRNP complex / transcription factor TFTC complex / SLIK (SAGA-like) complex / positive regulation of response to cytokine stimulus / C2H2 zinc finger domain binding / box C/D snoRNP assembly / SAGA complex / response to L-glutamate / negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator / RNA polymerase II general transcription initiation factor activity ...pre-snoRNP complex / transcription factor TFTC complex / SLIK (SAGA-like) complex / positive regulation of response to cytokine stimulus / C2H2 zinc finger domain binding / box C/D snoRNP assembly / SAGA complex / response to L-glutamate / negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator / RNA polymerase II general transcription initiation factor activity / transcription factor TFIID complex / HIV Transcription Initiation / RNA Polymerase II HIV Promoter Escape / Transcription of the HIV genome / RNA Polymerase II Promoter Escape / RNA Polymerase II Transcription Pre-Initiation And Promoter Opening / RNA Polymerase II Transcription Initiation / RNA Polymerase II Transcription Initiation And Promoter Clearance /

regulation of RNA splicing /

MLL1 complex /

aryl hydrocarbon receptor binding / RNA polymerase II transcribes snRNA genes / negative regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process / negative regulation of cell cycle / positive regulation of transcription initiation by RNA polymerase II /

regulation of DNA repair / positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway / RNA polymerase II preinitiation complex assembly / RNA Polymerase II Pre-transcription Events / response to interleukin-1 /

transcription initiation at RNA polymerase II promoter / DNA-templated transcription initiation / mRNA transcription by RNA polymerase II /

マイクロフィラメント /

p53 binding / HATs acetylate histones /

ATPase binding / DNA-binding transcription factor binding / Regulation of TP53 Activity through Phosphorylation / transcription by RNA polymerase II /

transcription coactivator activity / protein stabilization / transcription cis-regulatory region binding /

クロマチンリモデリング / positive regulation of apoptotic process / protein heterodimerization activity / negative regulation of cell population proliferation / apoptotic process / DNA damage response /

クロマチン / regulation of DNA-templated transcription / regulation of transcription by RNA polymerase II / negative regulation of apoptotic process / positive regulation of DNA-templated transcription / positive regulation of transcription by RNA polymerase II / protein-containing complex /

DNA binding /

核質 / identical protein binding /

細胞核 /

細胞質基質
類似検索 - 分子機能

生物種

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.5 Å

データ登録者

Haffke, M. / Berger, I.

資金援助

英国, 1件

引用

ジャーナル: Nat. Struct. Mol. Biol. / 年: 2018
タイトル: Chaperonin CCT checkpoint function in basal transcription factor TFIID assembly.
著者: Antonova, S.V. / Haffke, M. / Corradini, E. / Mikuciunas, M. / Low, T.Y. / Signor, L. / van Es, R.M. / Gupta, K. / Scheer, E. / Vos, H.R. / Tora, L. / Heck, A.J.R. / Timmers, H.T.M. / Berger, I.

履歴

登録	2017年11月28日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2018年12月5日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2018年12月12日	Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year
改定 1.2	2018年12月19日	Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

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PDB形式	pdb6f3t.ent.gz	1.5 MB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	6f3t.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/f3/6f3t ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/f3/6f3t	HTTPS FTP

-
関連構造データ

類似構造データ	6o06-d 5wvp-d 7c9t-d 7c9u-d 6acz-d 6p9o-d 3tn9-d 3iyc-d 7c4t-d 6snb-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

類似構造データ

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-
リンク

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「今月の分子」の関連する項目	#67 - 2005年7月 TATA結合タンパク質 (TATA-Binding Protein) 類似性 (9) #112 - 2009年4月 Oct・Sox転写因子 (Oct and Sox Transcription Factors) 類似性 (1) #240 - 2019年12月低酸素誘導因子 (Hypoxia-Inducible Factors) 類似性 (1) #7 - 2000年7月ヌクレオソーム (Nucleosome) 類似性 (2) #241 - 2020年1月 20年の分子を振り返って (Twenty Years of Molecules) 類似性 (2)

PDBのページ

PDBj /

wwPDB /

NCBI

「今月の分子」の関連する項目

#67 - 2005年7月
TATA結合タンパク質 (TATA-Binding Protein)
類似性 (9)
#112 - 2009年4月
Oct・Sox転写因子 (Oct and Sox Transcription Factors)
類似性 (1)
#240 - 2019年12月
低酸素誘導因子 (Hypoxia-Inducible Factors)
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#7 - 2000年7月
ヌクレオソーム (Nucleosome)
類似性 (2)
#241 - 2020年1月
20年の分子を振り返って (Twenty Years of Molecules)
類似性 (2)

登録構造単位

A: Transcription initiation factor TFIID subunit 5

B: Transcription initiation factor TFIID subunit 5

C: Transcription initiation factor TFIID subunit 5

D: Transcription initiation factor TFIID subunit 5

E: Transcription initiation factor TFIID subunit 6

F: Transcription initiation factor TFIID subunit 9

G: Transcription initiation factor TFIID subunit 6

H: Transcription initiation factor TFIID subunit 9

I: Transcription initiation factor TFIID subunit 6

J: Transcription initiation factor TFIID subunit 9

K: Transcription initiation factor TFIID subunit 6

L: Transcription initiation factor TFIID subunit 9

ヘテロ分子

373 kDa, 12 ポリマー
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1

A: Transcription initiation factor TFIID subunit 5

E: Transcription initiation factor TFIID subunit 6

F: Transcription initiation factor TFIID subunit 9

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
根拠: gel filtration
93.2 kDa, 3 ポリマー
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2

B: Transcription initiation factor TFIID subunit 5

G: Transcription initiation factor TFIID subunit 6

H: Transcription initiation factor TFIID subunit 9

ヘテロ分子

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93.2 kDa, 3 ポリマー
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3

C: Transcription initiation factor TFIID subunit 5

I: Transcription initiation factor TFIID subunit 6

J: Transcription initiation factor TFIID subunit 9

ヘテロ分子

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4

D: Transcription initiation factor TFIID subunit 5

K: Transcription initiation factor TFIID subunit 6

L: Transcription initiation factor TFIID subunit 9

ヘテロ分子

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単位格子

Length a, b, c (Å)	339.050, 339.050, 339.050
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 90.000
Int Tables number	197
Space group name H-M	I23

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	(chain E and resid 7 through 98)
2	1	chain G
3	1	(chain I and resid 7 through 98)
4	1	(chain K and resid 7 through 98)
1	2	(chain A and (resid 209 through 747 or resid 756 through 800))
2	2	(chain B and (resid 209 through 380 or resid 417 through 747 or resid 756 through 800))
3	2	(chain C and (resid 209 through 747 or resid 756 through 800))
4	2	(chain D and (resid 209 through 380 or resid 417 through 747 or resid 756 through 800))
1	3	chain F
2	3	chain H
3	3	chain J
4	3	chain L

NCSドメイン領域:

Dom-ID	Component-ID	Ens-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	1	1	(chain E and resid 7 through 98)	E	7 - 98
2	1	1	chain G	G	7 - 98
3	1	1	(chain I and resid 7 through 98)	I	7 - 98
4	1	1	(chain K and resid 7 through 98)	K	7 - 98
1	1	2	(chain A and (resid 209 through 747 or resid 756 through 800))	A	209 - 747
1	2	2	(chain A and (resid 209 through 747 or resid 756 through 800))	A	756 - 800
2	1	2	(chain B and (resid 209 through 380 or resid 417 through 747 or resid 756 through 800))	B	209 - 380
2	2	2	(chain B and (resid 209 through 380 or resid 417 through 747 or resid 756 through 800))	B	417 - 747
2	3	2	(chain B and (resid 209 through 380 or resid 417 through 747 or resid 756 through 800))	B	756 - 800
3	1	2	(chain C and (resid 209 through 747 or resid 756 through 800))	C	209 - 747
3	2	2	(chain C and (resid 209 through 747 or resid 756 through 800))	C	756 - 800
4	1	2	(chain D and (resid 209 through 380 or resid 417 through 747 or resid 756 through 800))	D	209 - 380
4	2	2	(chain D and (resid 209 through 380 or resid 417 through 747 or resid 756 through 800))	D	417 - 747
4	3	2	(chain D and (resid 209 through 380 or resid 417 through 747 or resid 756 through 800))	D	756 - 800
1	1	3	chain F	F	5 - 120
2	1	3	chain H	H	5 - 120
3	1	3	chain J	J	5 - 120
4	1	3	chain L	L	5 - 120

NCSアンサンブル:

ID
1
2
3

#1: タンパク質	Transcription initiation factor TFIID subunit 5 / Transcription initiation factor TFIID 100 kDa subunit / TAFII100 分子量: 68950.398 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: TAF5, TAF2D / 発現宿主: unidentified baculovirus (ウイルス) / 参照: UniProt: Q15542
#2: タンパク質	Transcription initiation factor TFIID subunit 6 / RNA polymerase II TBP-associated factor subunit E / Transcription initiation factor TFIID 70 kDa ...RNA polymerase II TBP-associated factor subunit E / Transcription initiation factor TFIID 70 kDa subunit / TAFII70 / Transcription initiation factor TFIID 80 kDa subunit / TAFII80 分子量: 10888.729 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: TAF6, TAF2E, TAFII70 / 発現宿主: unidentified baculovirus (ウイルス) / 参照: UniProt: P49848
#3: タンパク質	Transcription initiation factor TFIID subunit 9 / RNA polymerase II TBP-associated factor subunit G / STAF31/32 / Transcription initiation factor ...RNA polymerase II TBP-associated factor subunit G / STAF31/32 / Transcription initiation factor TFIID 31 kDa subunit / TAFII31 / Transcription initiation factor TFIID 32 kDa subunit / TAFII32 分子量: 13325.230 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: TAF9, TAF2G, TAFII31 / 発現宿主: unidentified baculovirus (ウイルス) / 参照: UniProt: Q16594
#4: 化合物	ChemComp-CL / CHLORIDE ION / クロリド / 塩化物分子量: 35.453 Da / 分子数: 7 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cl
#5: 水	ChemComp-HOH / water / 水分子量: 18.015 Da / 分子数: 391 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 4.42 Å³/Da / 溶媒含有率: 72.2 % / 解説: Pyramidal shape
結晶化	温度: 277.15 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6.8 詳細: 0.1 M Tris/HCl pH6.8, 0.8M Na-Citrate, 0.0-0.15M NaCl

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

ESRF

/ ビームライン: ID14-4 / 波長: 1.0044 Å

検出器

タイプ: ADSC QUANTUM 315 / 検出器: CCD / 日付: 2013年2月1日

放射

モノクロメーター: Si / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 1.0044 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 2.5→79.915 Å / Num. obs: 219180 / % possible obs: 99 % / 冗長度: 4.69 % / B_iso Wilson estimate: 71.94 Å² / CC_1/2: 0.995 / R_merge(I) obs: 0.136 / R_rim(I) all: 0.153 / Χ²: 0.833 / Net I/σ(I): 8.67

反射シェル

Diffraction-ID: 1

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Mean I/σ(I) obs	Num. unique obs	CC_1/2	R_rim(I) all	% possible all
2.5-2.6	4.146	3.048	0.64	22436	0.188	3.491	91.7
2.6-2.7	4.742	2.234	0.99	20949	0.312	2.518	99.9
2.7-2.8	4.794	1.563	1.48	18058	0.468	1.759	99.9
2.8-2.9	4.799	1.167	2.01	15686	0.603	1.314	100
2.9-3	4.797	0.808	2.84	13660	0.729	0.91	100
3-3.5	4.796	0.292	6.41	47288	0.959	0.328	100
3.5-4	4.772	0.107	12.97	26594	0.99	0.121	100
4-5	4.73	0.066	18.95	26426	0.994	0.075	100
5-6	4.671	0.064	19.81	11769	0.994	0.072	99.9
6-10	4.605	0.055	22.83	12744	0.996	0.062	99.9
10-30	4.48	0.05	27.08	3441	0.995	0.057	99.1
30-50	4.074	0.049	24.26	108	0.996	0.056	91.5
50-100	2.857	0.051	16.93	21	0.992	0.064	70

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.12_2829	精密化
XSCALE		データスケーリング
PDB_EXTRACT	3.24	データ抽出
XDS		データ削減
MOLREP		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 2.5→79.915 Å / SU ML: 0.45 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.33 / 位相誤差: 27.39 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.22	10958	5 %
R_work	0.1973	208132	-
obs	0.1984	219090	98.99 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso max: 260.34 Å² / B_iso mean: 97.2153 Å² / B_iso min: 46.13 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 2.5→79.915 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	24370	0	7	391	24768
B_iso mean	-	-	79.55	68.85	-
残基数	-	-	-	-	3040

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.003	24918
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.658	33699
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.044	3675
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.003	4354
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	11.594	15081

Refine LS restraints NCS

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	Refine-ID	Rms	タイプ
1	1	E	2333	X-RAY DIFFRACTION	11.468	TORSIONAL
1	2	G	2333	X-RAY DIFFRACTION	11.468	TORSIONAL
1	3	I	2333	X-RAY DIFFRACTION	11.468	TORSIONAL
1	4	K	2333	X-RAY DIFFRACTION	11.468	TORSIONAL
2	1	A	13741	X-RAY DIFFRACTION	11.468	TORSIONAL
2	2	B	13741	X-RAY DIFFRACTION	11.468	TORSIONAL
2	3	C	13741	X-RAY DIFFRACTION	11.468	TORSIONAL
2	4	D	13741	X-RAY DIFFRACTION	11.468	TORSIONAL
3	1	F	2886	X-RAY DIFFRACTION	11.468	TORSIONAL
3	2	H	2886	X-RAY DIFFRACTION	11.468	TORSIONAL
3	3	J	2886	X-RAY DIFFRACTION	11.468	TORSIONAL
3	4	L	2886	X-RAY DIFFRACTION	11.468	TORSIONAL

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / R_factor R_free error: 0 / Total num. of bins used: 30

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Num. reflection all	% reflection obs (%)
2.5001-2.5285	0.3846	318	0.392	6054	6372	87
2.5285-2.5582	0.3835	334	0.3837	6339	6673	91
2.5582-2.5894	0.4226	350	0.3798	6637	6987	95
2.5894-2.6222	0.3517	366	0.3629	6944	7310	100
2.6222-2.6567	0.3563	363	0.3486	6907	7270	100
2.6567-2.6931	0.3696	371	0.3403	7046	7417	100
2.6931-2.7316	0.3441	364	0.3392	6898	7262	100
2.7316-2.7723	0.4035	369	0.3773	7010	7379	100
2.7723-2.8157	0.3958	367	0.3701	6976	7343	100
2.8157-2.8618	0.3935	366	0.3459	6965	7331	100
2.8618-2.9112	0.3487	367	0.3151	6961	7328	100
2.9112-2.9641	0.2756	369	0.2848	7021	7390	100
2.9641-3.0211	0.2926	368	0.2772	6978	7346	100
3.0211-3.0828	0.2948	367	0.275	6976	7343	100
3.0828-3.1498	0.2883	366	0.2559	6962	7328	100
3.1498-3.2231	0.2586	371	0.2446	7043	7414	100
3.2231-3.3037	0.2714	366	0.2459	6950	7316	100
3.3037-3.393	0.2643	369	0.2381	7020	7389	100
3.393-3.4929	0.2643	367	0.2166	6979	7346	100
3.4929-3.6056	0.23	370	0.1978	7016	7386	100
3.6056-3.7345	0.1983	367	0.1861	6989	7356	100
3.7345-3.884	0.2185	369	0.1804	7004	7373	100
3.884-4.0608	0.1911	369	0.166	7002	7371	100
4.0608-4.2749	0.1555	369	0.1458	7016	7385	100
4.2749-4.5427	0.1702	371	0.1401	7039	7410	100
4.5427-4.8934	0.1504	371	0.1303	7067	7438	100
4.8934-5.3857	0.1655	369	0.1464	7003	7372	100
5.3857-6.1648	0.1854	373	0.1623	7082	7455	100
6.1648-7.7659	0.1868	373	0.1647	7087	7460	100
7.7659-79.9557	0.1799	379	0.1598	7161	7540	99

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
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43	1.3735	-0.9305	0.8012	1.1563	-2.022	5.131	-0.5647	-0.3378	0.7788	-0.2211	-0.2863	0.3853	-1.7623	-1.2368	0.5894	1.0666	0.204	-0.0558	1.2115	-0.027	1.2611	133.9485	104.8254	79.5984
44	3.3853	-0.3771	1.1651	3.9108	1.4699	9.1339	0.0213	0.2045	-0.5734	-0.6177	-0.0105	1.182	-0.0127	-0.9201	0.1357	0.668	0.075	-0.0781	0.985	-0.0416	1.1243	132.083	88.3793	66.9581
45	9.2515	5.4149	-3.2678	3.3588	-2.6999	5.692	0.358	0.0701	0.1683	0.9146	-0.2674	0.1099	-1.0669	0.0258	-0.0589	0.8349	0.1234	-0.0693	0.6496	-0.0222	0.8114	144.9011	102.9029	72.3458
46	2.6881	-0.1933	0.8711	1.9092	1.9138	5.6517	0.2417	0.2605	0.865	-0.4588	0.088	-1.2701	-1.2423	0.3898	-0.0766	1.1174	0.1567	0.118	0.7873	0.1692	1.0071	151.9228	110.825	63.4125
47	5.6112	-6.0196	-3.7598	6.51	4.0229	2.5039	0.3451	-0.2061	0.0876	0.049	-0.084	0.1297	-0.4294	-0.4352	0.076	0.5764	0.0342	-0.0369	0.8932	0.0816	0.7386	156.3767	90.2379	63.0269
48	6.1287	-5.9314	-3.9253	5.7987	3.4702	5.318	0.4526	0.3911	0.5745	-0.6643	-0.039	-0.8909	-0.3364	-0.0887	-0.0604	0.6569	-0.0565	0.0016	0.7021	0.0742	0.7845	167.9715	79.2774	55.576
49	2.6995	-0.5213	0.5501	1.7103	-1.536	6.3057	-0.182	-0.0456	-0.0388	0.047	-0.4968	-0.4337	0.24	0.7359	0.5718	0.5304	0.0364	-0.0276	0.7087	0.0567	0.6521	177.3489	61.8885	68.6318
50	4.3053	6.244	4.9002	9.9618	5.9428	7.6462	0.0447	-1.0684	0.8116	1.6022	-1.5111	-0.1362	-1.1825	0.6523	0.7485	0.9045	-0.1066	0.0305	1.0677	0.2212	1.131	180.1997	73.5892	79.5779
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53	5.8297	-5.6304	0.5193	5.8425	0.5003	2.571	0.7912	0.1822	0.1748	-0.0194	-0.1658	0.1245	0.2674	0.6091	-0.1328	0.8411	-0.0435	0.0184	1.4291	-0.2348	0.9998	186.8719	95.0636	100.9547
54	2.3454	1.4215	1.1734	3.0945	-1.1604	2.1375	0.1788	-0.4148	0.3695	0.017	-0.2297	-0.4703	-1.0019	1.1669	-0.1443	0.7088	-0.176	0.0344	0.9302	-0.3046	1.1507	201.1305	110.4558	85.8722
55	3.9136	0.7929	-0.8541	2.9946	3.2778	4.3826	-0.6611	-0.0726	0.4024	-0.0425	0.0704	0.0814	-0.8999	1.2756	0.5398	1.0527	-0.1034	-0.0192	1.2822	-0.0658	1.3307	206.6726	101.9071	92.5945
56	3.24	-0.0586	-0.0386	1.4003	-0.466	3.2227	0.0449	-0.5805	0.0673	0.6497	0.1202	-1.098	-0.5502	1.3596	-0.0107	0.8954	-0.0386	-0.0994	1.3578	-0.1447	1.3632	209.1764	88.4151	107.8447
57	3.1977	-2.0671	-0.8348	8.4715	1.3343	3.3708	-0.1388	-0.4293	0.1861	-0.1368	0.223	-0.5566	-0.6906	0.2421	-0.0256	0.8967	-0.0931	-0.1592	1.0309	-0.144	1.0355	197.4658	98.7206	104.1961
58	5.9031	5.9523	0.8064	6.008	1.0325	5.0838	0.2489	-0.7051	0.4897	0.8109	0.151	0.2053	-0.3013	0.0922	-0.4221	1.0212	-0.05	-0.0893	1.0117	-0.2504	1.0779	189.235	102.847	112.4016
59	9.1455	2.267	-3.3923	2.7332	-2.6376	2.9856	0.5492	-0.4226	0.6302	1.0816	0.2928	0.0765	-0.5932	0.5471	-0.2631	0.6852	0.0879	-0.0257	0.9746	-0.219	0.8216	175.1944	80.5376	115.6464
60	5.66	3.3085	3.6896	5.2902	3.9706	3.3912	-0.0418	-0.409	0.2045	-0.3202	-0.4576	0.1945	-0.1259	-1.1087	0.5398	0.7096	0.1765	0.0022	0.8923	0.026	0.6787	159.259	62.3178	107.6275
61	5.7048	-1.0769	-0.2814	3.3685	4.2761	5.6089	0.1759	-0.0248	1.2251	-0.7675	-0.5138	0.395	-0.8648	-0.5916	0.2057	0.8225	0.1273	0.0061	0.8763	-0.0544	0.8226	160.4179	68.2403	94.4005

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 207 through 373 )	A	207 - 373
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 374 through 581 )	A	374 - 581
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 582 through 800 )	A	582 - 800
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'B' and (resid 209 through 373 )	B	209 - 373
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'B' and (resid 374 through 581 )	B	374 - 581
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'B' and (resid 582 through 800 )	B	582 - 800
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'C' and (resid 209 through 373 )	C	209 - 373
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'C' and (resid 374 through 800 )	C	374 - 800
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'D' and (resid 209 through 373 )	D	209 - 373
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'D' and (resid 374 through 800 )	D	374 - 800
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'E' and (resid 6 through 15 )	E	6 - 15
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'E' and (resid 16 through 32 )	E	16 - 32
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'E' and (resid 33 through 60 )	E	33 - 60
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'E' and (resid 61 through 78 )	E	61 - 78
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'E' and (resid 79 through 83 )	E	79 - 83
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'E' and (resid 84 through 98 )	E	84 - 98
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'F' and (resid 5 through 15 )	F	5 - 15
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'F' and (resid 16 through 32 )	F	16 - 32
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'F' and (resid 33 through 60 )	F	33 - 60
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'F' and (resid 61 through 81 )	F	61 - 81
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'F' and (resid 82 through 88 )	F	82 - 88
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'F' and (resid 89 through 100 )	F	89 - 100
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'F' and (resid 101 through 110 )	F	101 - 110
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'F' and (resid 111 through 120 )	F	111 - 120
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'G' and (resid 7 through 15 )	G	7 - 15
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'G' and (resid 16 through 32 )	G	16 - 32
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'G' and (resid 33 through 60 )	G	33 - 60
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'G' and (resid 61 through 78 )	G	61 - 78
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'G' and (resid 79 through 83 )	G	79 - 83
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'G' and (resid 84 through 98 )	G	84 - 98
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'H' and (resid 5 through 12 )	H	5 - 12
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'H' and (resid 13 through 32 )	H	13 - 32
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'H' and (resid 33 through 60 )	H	33 - 60
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'H' and (resid 61 through 81 )	H	61 - 81
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'H' and (resid 82 through 100 )	H	82 - 100
36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'H' and (resid 101 through 110 )	H	101 - 110
37	X-RAY DIFFRACTION	37	chain 'H' and (resid 111 through 120 )	H	111 - 120
38	X-RAY DIFFRACTION	38	chain 'I' and (resid 5 through 32 )	I	5 - 32
39	X-RAY DIFFRACTION	39	chain 'I' and (resid 33 through 60 )	I	33 - 60
40	X-RAY DIFFRACTION	40	chain 'I' and (resid 61 through 78 )	I	61 - 78
41	X-RAY DIFFRACTION	41	chain 'I' and (resid 79 through 88 )	I	79 - 88
42	X-RAY DIFFRACTION	42	chain 'I' and (resid 89 through 98 )	I	89 - 98
43	X-RAY DIFFRACTION	43	chain 'J' and (resid 5 through 15 )	J	5 - 15
44	X-RAY DIFFRACTION	44	chain 'J' and (resid 16 through 32 )	J	16 - 32
45	X-RAY DIFFRACTION	45	chain 'J' and (resid 33 through 60 )	J	33 - 60
46	X-RAY DIFFRACTION	46	chain 'J' and (resid 61 through 81 )	J	61 - 81
47	X-RAY DIFFRACTION	47	chain 'J' and (resid 82 through 88 )	J	82 - 88
48	X-RAY DIFFRACTION	48	chain 'J' and (resid 89 through 100 )	J	89 - 100
49	X-RAY DIFFRACTION	49	chain 'J' and (resid 101 through 115 )	J	101 - 115
50	X-RAY DIFFRACTION	50	chain 'J' and (resid 116 through 120 )	J	116 - 120
51	X-RAY DIFFRACTION	51	chain 'K' and (resid 6 through 32 )	K	6 - 32
52	X-RAY DIFFRACTION	52	chain 'K' and (resid 33 through 78 )	K	33 - 78
53	X-RAY DIFFRACTION	53	chain 'K' and (resid 79 through 83 )	K	79 - 83
54	X-RAY DIFFRACTION	54	chain 'K' and (resid 84 through 98 )	K	84 - 98
55	X-RAY DIFFRACTION	55	chain 'L' and (resid 5 through 12 )	L	5 - 12
56	X-RAY DIFFRACTION	56	chain 'L' and (resid 13 through 26 )	L	13 - 26
57	X-RAY DIFFRACTION	57	chain 'L' and (resid 27 through 67 )	L	27 - 67
58	X-RAY DIFFRACTION	58	chain 'L' and (resid 68 through 81 )	L	68 - 81
59	X-RAY DIFFRACTION	59	chain 'L' and (resid 82 through 100 )	L	82 - 100
60	X-RAY DIFFRACTION	60	chain 'L' and (resid 101 through 110 )	L	101 - 110
61	X-RAY DIFFRACTION	61	chain 'L' and (resid 111 through 120 )	L	111 - 120

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