解像度: 2.3→2.38 Å / 冗長度: 2.5 % / Rmerge(I) obs: 0.391 / Mean I/σ(I) obs: 2.17 / Num. unique all: 1453 / % possible all: 87.3
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
HKL-2000
データ収集
PHASER
位相決定
REFMAC
5.7.0029
精密化
HKL-2000
データ削減
HKL-2000
データスケーリング
精密化
構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 2.3→19.53 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.963 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.942 / SU B: 10.064 / SU ML: 0.13 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.22 / ESU R Free: 0.198 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.22858
826
5.1 %
RANDOM
Rwork
0.17376
-
-
-
obs
0.17634
15288
94.4 %
-
all
-
16195
-
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK
原子変位パラメータ
Biso mean: 48.402 Å2
Baniso -1
Baniso -2
Baniso -3
1-
0.2 Å2
0.2 Å2
0 Å2
2-
-
0.2 Å2
0 Å2
3-
-
-
-0.65 Å2
精密化ステップ
サイクル: LAST / 解像度: 2.3→19.53 Å
タンパク質
核酸
リガンド
溶媒
全体
原子数
1682
0
251
87
2020
拘束条件
Refine-ID
タイプ
Dev ideal
Dev ideal target
数
X-RAY DIFFRACTION
r_bond_refined_d
0.014
0.019
1995
X-RAY DIFFRACTION
r_bond_other_d
0.001
0.02
1776
X-RAY DIFFRACTION
r_angle_refined_deg
2.078
2.111
2736
X-RAY DIFFRACTION
r_angle_other_deg
1.403
3
4068
X-RAY DIFFRACTION
r_dihedral_angle_1_deg
6.187
5
209
X-RAY DIFFRACTION
r_dihedral_angle_2_deg
30.381
23.448
87
X-RAY DIFFRACTION
r_dihedral_angle_3_deg
15.057
15
302
X-RAY DIFFRACTION
r_dihedral_angle_4_deg
14.69
15
16
X-RAY DIFFRACTION
r_chiral_restr
0.197
0.2
351
X-RAY DIFFRACTION
r_gen_planes_refined
0.008
0.021
1962
X-RAY DIFFRACTION
r_gen_planes_other
0.001
0.02
406
LS精密化 シェル
解像度: 2.3→2.357 Å / Total num. of bins used: 10
Rfactor
反射数
%反射
Rfree
0.325
67
-
Rwork
0.245
973
-
obs
-
-
85.39 %
精密化 TLS
手法: refined / Origin x: 4.4459 Å / Origin y: 37.8325 Å / Origin z: -3.2914 Å