登録情報 | データベース: PDB / ID: 4dl8 |
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タイトル | Crystal structure of Trypanosoma brucei dUTPase with dUMP, planar [AlF3-OPO3] transition state analogue, Mg2+, and Na+ |
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要素 | Deoxyuridine triphosphatase |
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キーワード | HYDROLASE / all alpha NTP pyrophosphohydrolase / all alpha NTP pyrophosphatase |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
dUTP diphosphatase / dUTP diphosphatase activity / nucleoplasm / metal ion binding / cytosol類似検索 - 分子機能 all-alpha NTP pyrophosphatase fold / Type II deoxyuridine triphosphatase / dUTPase/dCTP pyrophosphatase / dUTPase / Orthogonal Bundle / Mainly Alpha類似検索 - ドメイン・相同性 ALUMINUM FLUORIDE / PHOSPHATE ION / 2'-DEOXYURIDINE 5'-MONOPHOSPHATE / Deoxyuridine triphosphatase, putative類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Trypanosoma brucei (トリパノソーマ) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / REFINED 4DKB / 解像度: 1.698 Å |
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データ登録者 | Hemsworth, G.R. / Gonzalez-Pacanowska, D. / Wilson, K.S. |
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引用 | ジャーナル: Biochem.J. / 年: 2013 タイトル: On the catalytic mechanism of dimeric dUTPases. 著者: Hemsworth, G.R. / Gonzalez-Pacanowska, D. / Wilson, K.S. |
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履歴 | 登録 | 2012年2月6日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2013年8月7日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2013年9月18日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2013年11月6日 | Group: Database references |
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改定 1.3 | 2017年11月15日 | Group: Refinement description / カテゴリ: software |
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改定 1.4 | 2023年9月13日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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