#1: ジャーナル: Acta Crystallogr.,Sect.F / 年: 2008 タイトル: Crystallization and Preliminary X-Ray Diffraction Analysis of a Breast Cancer Metastasis Suppressor 1 Predicted Coiled- Coil Region. 著者: Spinola-Amilibia, M. / Rivera, J. / Bravo, J.
#241 - 2020年1月 20年の分子を振り返って (Twenty Years of Molecules) 類似性 (1)
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集合体
登録構造単位
A: BREAST CANCER METASTASIS SUPPRESSOR 1 B: BREAST CANCER METASTASIS SUPPRESSOR 1 C: BREAST CANCER METASTASIS SUPPRESSOR 1 D: BREAST CANCER METASTASIS SUPPRESSOR 1 E: BREAST CANCER METASTASIS SUPPRESSOR 1 F: BREAST CANCER METASTASIS SUPPRESSOR 1 G: BREAST CANCER METASTASIS SUPPRESSOR 1 H: BREAST CANCER METASTASIS SUPPRESSOR 1 ヘテロ分子
A: BREAST CANCER METASTASIS SUPPRESSOR 1 B: BREAST CANCER METASTASIS SUPPRESSOR 1 D: BREAST CANCER METASTASIS SUPPRESSOR 1 E: BREAST CANCER METASTASIS SUPPRESSOR 1 ヘテロ分子
A: BREAST CANCER METASTASIS SUPPRESSOR 1 B: BREAST CANCER METASTASIS SUPPRESSOR 1 D: BREAST CANCER METASTASIS SUPPRESSOR 1 E: BREAST CANCER METASTASIS SUPPRESSOR 1 ヘテロ分子
pH: 4.3 詳細: 0.1 M SODIUM ACETATE PH 4.3, 0.2 M AMMONIUM SULPHATE, 2 % PEG 4000
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データ収集
回折
ID
平均測定温度 (K)
Crystal-ID
1
100
1
2
100
1
放射光源
由来
サイト
ビームライン
ID
波長
シンクロトロン
ESRF
ID14-1
1
0.934
シンクロトロン
ESRF
ID23-1
2
0.9729
検出器
タイプ
ID
検出器
日付
詳細
ADSC QUANTUM 210
1
CCD
2006年8月28日
MIRRORS
ADSC QUANTUM 315r
2
CCD
放射
ID
モノクロメーター
プロトコル
単色(M)・ラウエ(L)
散乱光タイプ
Wavelength-ID
1
ESRFMONOCHROMATORANDTORODIALFOCUSINGMIRROR
SINGLEWAVELENGTH
M
x-ray
1
2
SINGLEWAVELENGTH
M
x-ray
1
放射波長
ID
波長 (Å)
相対比
1
0.934
1
2
0.9729
1
反射
解像度: 2→95.56 Å / Num. obs: 20344 / % possible obs: 99.2 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 7.18 % / Biso Wilson estimate: 38.1 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.05 / Net I/σ(I): 6.66
反射 シェル
解像度: 2→2.11 Å / 冗長度: 3.87 % / Rmerge(I) obs: 0.2 / Mean I/σ(I) obs: 1.11 / % possible all: 94.7
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解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
REFMAC
5.6.0117
精密化
MOSFLM
データ削減
SCALA
データスケーリング
SHELXDE
位相決定
精密化
構造決定の手法: 単一同系置換・異常分散 開始モデル: NONE 解像度: 1.999→95.637 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.944 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.901 / SU B: 7.121 / SU ML: 0.102 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.165 / ESU R Free: 0.17 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS.
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.2585
1031
5.13 %
RANDOM
Rwork
0.1925
-
-
-
obs
0.196
20325
99.311 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL PLUS MASK