登録情報 データベース : PDB / ID : 3giq 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal structure of N-acyl-D-Glutamate Deacylase from Bordetella Bronchiseptica complexed with zinc and phosphonate inhibitor, a mimic of the reaction tetrahedral intermediate. 要素N-acyl-D-glutamate deacylase 詳細 キーワード HYDROLASE (加水分解酵素) / N-acyl-D-Glutamate Deacylase / amidohydrolase (アミド加水分解酵素) / reaction intermediate (反応中間体)機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
N-acyl-D-glutamate deacylase / N-acyl-D-glutamate deacylase activity / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 D-aminoacylase. Domain 3 / D-aminoacylase, insert domain superfamily / Amidohydrolase 3 / Amidohydrolase family / Urease, subunit C; domain 1 / Urease, subunit C, domain 1 / Metal-dependent hydrolase, composite domain superfamily / Metal-dependent hydrolases / Metal-dependent hydrolase / Dna Ligase; domain 1 ... D-aminoacylase. Domain 3 / D-aminoacylase, insert domain superfamily / Amidohydrolase 3 / Amidohydrolase family / Urease, subunit C; domain 1 / Urease, subunit C, domain 1 / Metal-dependent hydrolase, composite domain superfamily / Metal-dependent hydrolases / Metal-dependent hydrolase / Dna Ligase; domain 1 / Roll / TIMバレル / Alpha-Beta Barrel / 2-Layer Sandwich / Mainly Beta / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 N-[(R)-hydroxy(methyl)phosphoryl]-D-glutamic acid / N-acyl-D-glutamate deacylase / N-acyl-D-glutamate deacylase 類似検索 - 構成要素生物種 Bordetella bronchiseptica (気管支敗血症菌)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 1.8 Å 詳細データ登録者 Fedorov, A.A. / Fedorov, E.V. / Cummings, J. / Raushel, F.M. / Almo, S.C. 引用ジャーナル : Biochemistry / 年 : 2009タイトル : Annotating enzymes of uncertain function: the deacylation of D-amino acids by members of the amidohydrolase superfamily.著者 : Cummings, J.A. / Fedorov, A.A. / Xu, C. / Brown, S. / Fedorov, E. / Babbitt, P.C. / Almo, S.C. / Raushel, F.M. 履歴 登録 2009年3月5日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2009年9月1日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2011年7月13日 Group : Version format compliance改定 1.2 2023年9月6日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_site Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
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