登録情報 | データベース: PDB / ID: 3bu0 |
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タイトル | crystal structure of human ABH2 cross-linked to dsDNA with cofactors |
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要素 | - Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 2
- DNA (5'-D(*CP*TP*GP*TP*AP*TP*(2YR)P*AP*TP*TP*GP*CP*G)-3')
- DNA (5'-D(*DTP*DCP*DGP*DCP*DAP*DAP*DTP*DAP*DAP*DTP*DAP*DCP*DA)-3')
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キーワード | Oxidoreductase/DNA / protein/DNA interaction / human dioxygenase / DNA repair (DNA修復) / cross-link (架橋) / DNA damage (DNA修復) / Iron (鉄) / Metal-binding / Nucleus (Nucleus) / Oxidoreductase (酸化還元酵素) / Oxidoreductase-DNA COMPLEX |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報 |
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生物種 | Homo sapiens (ヒト) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.5 Å |
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データ登録者 | Yang, C.-G. / Yi, C. / He, C. |
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引用 | ジャーナル: Nature / 年: 2008 タイトル: Crystal structures of DNA/RNA repair enzymes AlkB and ABH2 bound to dsDNA. 著者: Yang, C.G. / Yi, C. / Duguid, E.M. / Sullivan, C.T. / Jian, X. / Rice, P.A. / He, C. |
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履歴 | 登録 | 2007年12月31日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2008年4月22日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Advisory / Version format compliance |
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改定 1.2 | 2014年5月21日 | Group: Other |
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改定 1.3 | 2021年10月20日 | Group: Database references / Derived calculations カテゴリ: database_2 / pdbx_struct_conn_angle ...database_2 / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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