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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1rsu | ||||||
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タイトル | COMPLEX BETWEEN STREPTAVIDIN AND THE STREP-TAG II PEPTIDE | ||||||
要素 |
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キーワード | COMPLEX (SIGNAL PROTEIN/PEPTIDE) / COMPLEX (SIGNAL PROTEIN-PEPTIDE) / SIGNAL PROTEIN (信号 (電気工学)) / COMPLEX (SIGNAL PROTEIN-PEPTIDE) complex | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | Streptomyces avidinii (バクテリア) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 1.7 Å | ||||||
データ登録者 | Koepke, J. / Schmidt, T. / Skerra, A. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1996 タイトル: Molecular interaction between the Strep-tag affinity peptide and its cognate target, streptavidin. 著者: Schmidt, T.G. / Koepke, J. / Frank, R. / Skerra, A. #1: ジャーナル: J.Chromatogr.,A / 年: 1994 タイトル: One-Step Affinity Purification of Bacterially Produced Proteins by Means of the 'Strep Tag' and Immobilized Recombinant Core Streptavidin 著者: Schmidt, T.G. / Skerra, A. #2: ジャーナル: Protein Eng. / 年: 1993 タイトル: The Random Peptide Library-Assisted Engineering of a C-Terminal Affinity Peptide, Useful for the Detection and Purification of a Functional Ig Fv Fragment 著者: Schmidt, T.G. / Skerra, A. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1rsu.cif.gz | 48.8 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1rsu.ent.gz | 35.5 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1rsu.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/rs/1rsu ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/rs/1rsu | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 13341.454 Da / 分子数: 1 / 断片: RESIDUES 13 - 139 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Streptomyces avidinii (バクテリア) プラスミド: PSA1 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P22629 |
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#2: タンパク質・ペプチド | 分子量: 1261.341 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.58 Å3/Da / 溶媒含有率: 49 % | ||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 7 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射光源 | 波長: 1.5418 |
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検出器 | タイプ: RIGAKU / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1994年6月13日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.7→37.38 Å / Num. obs: 16909 / % possible obs: 97.2 % / Observed criterion σ(I): 0 / Rmerge(I) obs: 0.0923 |
-解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 1.7→8 Å / σ(F): 2
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原子変位パラメータ | Biso mean: 20.2 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Refine analyze | Luzzati coordinate error obs: 0.18 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.7→8 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: X-PLOR / バージョン: 3.1 / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.18 / Rfactor Rwork: 0.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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