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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1rlq | ||||||
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タイトル | TWO BINDING ORIENTATIONS FOR PEPTIDES TO SRC SH3 DOMAIN: DEVELOPMENT OF A GENERAL MODEL FOR SH3-LIGAND INTERACTIONS | ||||||
要素 |
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キーワード | COMPLEX (SIGNAL TRANSDUCTION/PEPTIDE) / COMPLEX (SIGNAL TRANSDUCTION-PEPTIDE) / COMPLEX (SIGNAL TRANSDUCTION-PEPTIDE) complex | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 Signaling by ERBB2 / Nuclear signaling by ERBB4 / PIP3 activates AKT signaling / Signaling by SCF-KIT / Regulation of KIT signaling / Signaling by EGFR / GAB1 signalosome / Regulation of gap junction activity / FCGR activation / PECAM1 interactions ...Signaling by ERBB2 / Nuclear signaling by ERBB4 / PIP3 activates AKT signaling / Signaling by SCF-KIT / Regulation of KIT signaling / Signaling by EGFR / GAB1 signalosome / Regulation of gap junction activity / FCGR activation / PECAM1 interactions / CD28 co-stimulation / CTLA4 inhibitory signaling / EPHA-mediated growth cone collapse / Ephrin signaling / G alpha (i) signalling events / GP1b-IX-V activation signalling / Recycling pathway of L1 / Thrombin signalling through proteinase activated receptors (PARs) / VEGFR2 mediated cell proliferation / RAF activation / PI5P, PP2A and IER3 Regulate PI3K/AKT Signaling / RET signaling / Receptor Mediated Mitophagy / ADP signalling through P2Y purinoceptor 1 / Downregulation of ERBB4 signaling / EPH-ephrin mediated repulsion of cells / Cyclin D associated events in G1 / Regulation of RUNX3 expression and activity / Activated NTRK3 signals through PI3K / Downstream signal transduction / MAP2K and MAPK activation / Integrin signaling / GRB2:SOS provides linkage to MAPK signaling for Integrins / MET activates PTK2 signaling / Extra-nuclear estrogen signaling / EPHB-mediated forward signaling / p130Cas linkage to MAPK signaling for integrins / VEGFA-VEGFR2 Pathway / connexin binding / osteoclast development / progesterone receptor signaling pathway / negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway / bone resorption / extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane / negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway / non-specific protein-tyrosine kinase / non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity / epidermal growth factor receptor signaling pathway / 細胞結合 / protein phosphatase binding / protein tyrosine kinase activity / ミトコンドリア内膜 / 細胞分化 / 細胞骨格 / endosome membrane / regulation of cell cycle / 細胞接着 / 細胞周期 / リン酸化 / signaling receptor binding / focal adhesion / 自然免疫系 / heme binding / perinuclear region of cytoplasm / protein-containing complex / ATP binding / 生体膜 / 細胞核 / 細胞膜 / 細胞質基質 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Gallus gallus (ニワトリ) | ||||||
手法 | 溶液NMR | ||||||
データ登録者 | Feng, S. / Chen, J.K. / Yu, H. / Simon, J.A. / Schreiber, S.L. | ||||||
引用 | ジャーナル: Science / 年: 1994 タイトル: Two binding orientations for peptides to the Src SH3 domain: development of a general model for SH3-ligand interactions. 著者: Feng, S. / Chen, J.K. / Yu, H. / Simon, J.A. / Schreiber, S.L. #1: ジャーナル: Cell(Cambridge,Mass.) / 年: 1994 タイトル: Structural Basis for the Binding of Proline-Rich Peptides to SH3 Domains 著者: Yu, H. / Chen, J.K. / Feng, S. / Dalgarno, D.C. / Brauer, A.W. / Schreiber, S.L. #2: ジャーナル: Science / 年: 1992 タイトル: Solution Structure of the SH3 Domain of Src and Identification of its Ligand-Binding Site 著者: Yu, H. / Rosen, M.K. / Shin, T.B. / Seidel-Dugan, C. / Brugge, J.S. / Schreiber, S.L. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1rlq.cif.gz | 29.8 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1rlq.ent.gz | 23 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1rlq.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/rl/1rlq ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/rl/1rlq | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 7003.641 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Gallus gallus (ニワトリ) / 遺伝子: SYNTHETIC OLIGO / プラスミド: PGEX-2T GENE: SYNTHETIC OLIGO / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P00523 |
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#2: タンパク質・ペプチド | 分子量: 1084.314 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
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-試料調製
結晶化 | *PLUS 手法: その他 / 詳細: NMR |
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-解析
ソフトウェア |
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NMR software | 名称: X-PLOR / 開発者: BRUNGER / 分類: 精密化 | ||||||||
NMRアンサンブル | 登録したコンフォーマーの数: 1 |