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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1qk6 | ||||||
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タイトル | Solution structure of huwentoxin-I by NMR | ||||||
要素 | HUWENTOXIN-I | ||||||
キーワード | TOXIN / HUWENTOXIN-I / SPIDER / CYSTINE KNOT | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 host cell postsynaptic membrane / ion channel inhibitor activity / : / toxin activity / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | SELENOCOSMIA HUWENA (クモ) | ||||||
手法 | 溶液NMR / distance geometry | ||||||
データ登録者 | Qu, Y. / Liang, S. / Ding, J. / Liu, X. / Zhang, R. / Gu, X. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Protein Chem. / 年: 1997 タイトル: Proton Nuclear Magnetic Resonance Studies on Huwentoxin-I from the Venom of the Spider Selenocosmia Huwena:2.Three-Dimensional Structure in Solution 著者: Qu, Y. / Liang, S. / Ding, J. / Liu, X. / Zhang, R. / Gu, X. #1: ジャーナル: J.Protein Chem. / 年: 1995 タイトル: Proton Nuclear Magnetic Resonance Studies on Huwentoxin-I from the Venom of the Spider Selenocosmia Huwena:1.Sequence-Specific 1H-NMR Assignment 著者: Qu, Y. / Liang, S. / Ding, J. / Ma, L. / Zhang, R. / Gu, X. | ||||||
履歴 |
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Remark 700 | SHEET DETERMINATION METHOD: AUTHOR PROVIDED. |
-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1qk6.cif.gz | 102.2 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1qk6.ent.gz | 88.1 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1qk6.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1qk6_validation.pdf.gz | 348.2 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1qk6_full_validation.pdf.gz | 397.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1qk6_validation.xml.gz | 6.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1qk6_validation.cif.gz | 10.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/qk/1qk6 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/qk/1qk6 | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 3764.470 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) SELENOCOSMIA HUWENA (クモ) / 器官: VENOM GLAND / Secretion: VENOM / 参照: UniProt: P56676 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: BEST PROCHECK RESULT. NULL |
-試料調製
詳細 | 内容: 10% WATER/90% D2O |
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試料状態 | イオン強度: 20 mM / pH: 5 / 圧: 1 atm / 温度: 285 K |
結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker DMX / 製造業者: Bruker / モデル: DMX / 磁場強度: 500 MHz |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: distance geometry / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: STEREOCHEMICAL ENERGY AND RESULT OF PROCHECK 計算したコンフォーマーの数: 50 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |