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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1gos | ||||||
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タイトル | Human Monoamine Oxidase B | ||||||
要素 | MONOAMINE OXIDASEモノアミン酸化酵素 | ||||||
キーワード | OXIDOREDUCTASE (酸化還元酵素) / FAD-CONTAINING AMINE OXIDASE | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 Biogenic amines are oxidatively deaminated to aldehydes by MAOA and MAOB / aliphatic amine oxidase activity / monoamine oxidase activity / モノアミン酸化酵素 / phenylethylamine catabolic process / positive regulation of dopamine metabolic process / primary amine oxidase activity / negative regulation of serotonin secretion / response to aluminum ion / response to selenium ion ...Biogenic amines are oxidatively deaminated to aldehydes by MAOA and MAOB / aliphatic amine oxidase activity / monoamine oxidase activity / モノアミン酸化酵素 / phenylethylamine catabolic process / positive regulation of dopamine metabolic process / primary amine oxidase activity / negative regulation of serotonin secretion / response to aluminum ion / response to selenium ion / : / dopamine catabolic process / 一級アミンオキシダーゼ / mitochondrial envelope / hydrogen peroxide biosynthetic process / response to corticosterone / substantia nigra development / response to toxic substance / flavin adenine dinucleotide binding / response to ethanol / mitochondrial outer membrane / response to lipopolysaccharide / electron transfer activity / response to xenobiotic stimulus / neuronal cell body / 樹状突起 / ミトコンドリア / identical protein binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | HOMO SAPIENS (ヒト) | ||||||
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 単一同系置換 / 解像度: 3 Å | ||||||
データ登録者 | Binda, C. / Newton-Vinson, P. / Hubalek, F. / Edmondson, D.E. / Mattevi, A. | ||||||
引用 | ジャーナル: Nat.Struct.Biol. / 年: 2001 タイトル: Structure of Human Monoamine Oxidase B, a Drug Target for the Treatment of Neurological Disorders 著者: Binda, C. / Newton-Vinson, P. / Hubalek, F. / Edmondson, D.E. / Mattevi, A. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1gos.cif.gz | 201.3 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1gos.ent.gz | 169.9 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1gos.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/go/1gos ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/go/1gos | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | |
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類似構造データ |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCS oper: (Code: given Matrix: (-0.55753, -0.48823, -0.67142), ベクター: |
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 58837.730 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) HOMO SAPIENS (ヒト) / 発現宿主: PICHIA PASTORIS (菌類) / 参照: UniProt: P27338, モノアミン酸化酵素 #2: 化合物 | #3: 化合物 | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.85 Å3/Da / 溶媒含有率: 57 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | pH: 6.5 / 詳細: pH 6.50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 4 ℃ / 手法: 蒸気拡散法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: シンクロトロン / サイト: ESRF / ビームライン: ID14-3 / 波長: 0.934 |
検出器 | 検出器: CCD |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.934 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 3→40 Å / Num. obs: 24034 / % possible obs: 95.3 % / 冗長度: 8.1 % / Rmerge(I) obs: 0.128 |
反射 シェル | *PLUS % possible obs: 94.6 % / 冗長度: 6.6 % / Rmerge(I) obs: 0.338 |
-解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: 単一同系置換 / 解像度: 3→40 Å
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 3→40 Å
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精密化 | *PLUS 最低解像度: 40 Å / Rfactor obs: 0.23 / Rfactor Rwork: 0.23 | ||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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