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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1bjx | ||||||
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タイトル | HUMAN PROTEIN DISULFIDE ISOMERASE, NMR, 24 STRUCTURES | ||||||
要素 | PROTEIN DISULFIDE ISOMERASEプロテインジスルフィドイソメラーゼ | ||||||
キーワード | ELECTRON TRANSPORT (電子伝達系) / REDOX-ACTIVE CENTER / ISOMERASE (異性化酵素) / ENDOPLASMIC RETICULUM (小胞体) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 regulation of oxidative stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway / procollagen-proline 4-dioxygenase complex / VLDL assembly / insulin processing / procollagen-proline 4-dioxygenase activity / interleukin-23-mediated signaling pathway / LDL remodeling / thiol oxidase activity / プロテインジスルフィドイソメラーゼ / peptidyl-proline hydroxylation to 4-hydroxy-L-proline ...regulation of oxidative stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway / procollagen-proline 4-dioxygenase complex / VLDL assembly / insulin processing / procollagen-proline 4-dioxygenase activity / interleukin-23-mediated signaling pathway / LDL remodeling / thiol oxidase activity / プロテインジスルフィドイソメラーゼ / peptidyl-proline hydroxylation to 4-hydroxy-L-proline / endoplasmic reticulum chaperone complex / protein folding in endoplasmic reticulum / Collagen biosynthesis and modifying enzymes / Chylomicron assembly / Interleukin-23 signaling / interleukin-12-mediated signaling pathway / cellular response to interleukin-7 / Interleukin-12 signaling / protein disulfide isomerase activity / Insulin processing / Detoxification of Reactive Oxygen Species / protein-disulfide reductase activity / positive regulation of cell adhesion / endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment / endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport / positive regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading / response to endoplasmic reticulum stress / Hedgehog ligand biogenesis / Post-translational protein phosphorylation / Regulation of Insulin-like Growth Factor (IGF) transport and uptake by Insulin-like Growth Factor Binding Proteins (IGFBPs) / メラノソーム / integrin binding / フォールディング / lamellipodium / actin binding / cellular response to hypoxia / positive regulation of viral entry into host cell / 細胞骨格 / protein heterodimerization activity / external side of plasma membrane / 小胞体 / focal adhesion / enzyme binding / 小胞体 / protein-containing complex / RNA binding / extracellular exosome / extracellular region / 細胞質基質 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | ||||||
手法 | 溶液NMR / DISTANCE GEOMETRY, SIMULATED ANNEALING | ||||||
データ登録者 | Kemmink, J. / Dijkstra, K. / Mariani, M. / Scheek, R.M. / Penka, E. / Nilges, M. / Darby, N.J. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Biomol.NMR / 年: 1999 タイトル: The structure in solution of the b domain of protein disulfide isomerase. 著者: Kemmink, J. / Dijkstra, K. / Mariani, M. / Scheek, R.M. / Penka, E. / Nilges, M. / Darby, N.J. #1: ジャーナル: Curr.Biol. / 年: 1997 タイトル: The Folding Catalyst Protein Disulfide Isomerase is Constructed of Active and Inactive Thioredoxin Modules 著者: Kemmink, J. / Darby, N.J. / Dijkstra, K. / Nilges, M. / Creighton, T.E. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1bjx.cif.gz | 772.7 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1bjx.ent.gz | 671.5 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1bjx.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bj/1bjx ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bj/1bjx | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 12072.295 Da / 分子数: 1 / 断片: B DOMAIN / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 細胞株: BL21 / プラスミド: PET12A / 生物種 (発現宿主): Escherichia coli / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21 (DE3) 参照: UniProt: P07237, プロテインジスルフィドイソメラーゼ |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
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-試料調製
試料状態 | pH: 6.5 / 温度: 300 K |
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結晶化 | *PLUS 手法: その他 / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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-解析
ソフトウェア |
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NMR software |
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精密化 | 手法: DISTANCE GEOMETRY, SIMULATED ANNEALING / ソフトェア番号: 1 詳細: REFINEMENT DETAILS CAN BE FOUND IN THE JRNL CITATION ABOVE. | |||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: LOWEST ENERGY / 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 24 |