SASDFF9: Poly-adenosine rA30 in 1 mM MgCl2 (Poly-adenosine, rA30)

IDまたはキーワード:

登録情報	データベース: SASBDB / ID: SASDFF9
試料	Poly-adenosine rA30 in 1 mM MgCl2 Poly-adenosine (RNA), rA30
登録者	Alex Plumridge (Cornell University, Ithaca, NY, United States)

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
Data source

SASBDBのページ	SASDFF9

-
関連構造データ

類似構造データ	2f42-d 5wi8-2 2gl2-2 1422 3373 2lov-d 5b3d-3 3352 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細)

類似構造データ

Omokage検索で類似形状データを探す (詳細)

モデル #3377	タイプ: atomic / カイ2乗値: 1.024144 / P-value: 0.877594 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)
モデル #3378	タイプ: atomic / カイ2乗値: 1.024144 / P-value: 0.877594 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)
モデル #3379	タイプ: atomic / カイ2乗値: 1.024144 / P-value: 0.877594 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)
モデル #3380	タイプ: atomic / カイ2乗値: 1.024144 / P-value: 0.877594 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)
モデル #3381	タイプ: atomic / カイ2乗値: 1.024144 / P-value: 0.877594 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)
モデル #3382	タイプ: atomic / カイ2乗値: 1.024144 / P-value: 0.877594 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)
モデル #3383	タイプ: atomic / カイ2乗値: 1.024144 / P-value: 0.877594 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)
モデル #3384	タイプ: atomic / カイ2乗値: 1.024144 / P-value: 0.877594 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)
モデル #3385	タイプ: atomic / カイ2乗値: 1.024144 / P-value: 0.877594 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)
モデル #3386	タイプ: atomic / カイ2乗値: 1.024144 / P-value: 0.877594 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)
モデル #3387	タイプ: atomic / カイ2乗値: 1.024144 / P-value: 0.877594 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)
モデル #3388	タイプ: atomic / カイ2乗値: 1.024144 / P-value: 0.877594 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)
モデル #3389	タイプ: atomic / カイ2乗値: 1.024144 / P-value: 0.877594 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)
モデル #3390	タイプ: atomic / カイ2乗値: 1.024144 / P-value: 0.877594 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)
モデル #3391	タイプ: atomic / カイ2乗値: 1.024144 / P-value: 0.877594 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)
モデル #3392	タイプ: atomic / カイ2乗値: 1.024144 / P-value: 0.877594 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)
モデル #3393	タイプ: atomic / カイ2乗値: 1.024144 / P-value: 0.877594 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)
モデル #3394	タイプ: atomic / カイ2乗値: 1.024144 / P-value: 0.877594 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)
モデル #3395	タイプ: atomic / カイ2乗値: 1.024144 / P-value: 0.877594 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)
モデル #3396	タイプ: atomic / カイ2乗値: 1.024144 / P-value: 0.877594 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

試料	名称: Poly-adenosine rA30 in 1 mM MgCl2 / 試料濃度: 0.40-1.20
バッファ	名称: 1 mM Na-MOPS, 20 mM NaCl, 1 mM MgCl2, 20 µM EDTA / pH: 7
要素 #1769	名称: rA30 / タイプ: RNA / 記述: Poly-adenosine / 分子量: 9.894 / 分子数: 1 配列: AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA

ビーム

設備名称: Cornell High Energy Synchrotron Source (CHESS) G1
地域: Ithaca, NY / 国: USA

/ 線源: X-ray synchrotron / 波長: 0.11 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 2.04 mm

検出器

名称: Finger Lakes CCD / タイプ: CCD

スキャン

タイトル: Poly-adenosine rA30 in 1 mM MgCl2 / 測定日: 2019年7月24日 / 保管温度: 4 °C / セル温度: 25 °C / 照射時間: 10 sec. / フレーム数: 30 / 単位: 1/A /

	Min	Max
Q	0.01	0.27

距離分布関数 P(R)

ソフトウェア P(R): GNOM 5.0 / ポイント数: 242 /

	Min	Max
Q	0.029	0.27
P(R) point	1	242
R	0	104

結果

カーブのタイプ: extrapolated /

	実験値	Porod
分子量	11 kDa	-
体積	-	12 nm³

	P(R)	Guinier	Guinier error
前方散乱 I0	43.28	42.8	0.49
慣性半径, Rg	2.62 nm	2.45 nm	0.03

	Min	Max
D	-	10.4
Guinier point	18	44

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
Data source

-
関連構造データ

-
モデル

-
試料

-
実験情報

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-Data source

-関連構造データ

-モデル

-試料

-実験情報

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
Data source

-
関連構造データ

-
モデル

-
試料

-
実験情報

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)