SASDFL4: C-type lectins CTL4/CTLMA2, 3.1 mg/ml (AGAP005335-PA, CTL4 + AGAP...

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登録情報	データベース: SASBDB / ID: SASDFL4
試料	C-type lectins CTL4/CTLMA2, 3.1 mg/ml AGAP005335-PA (protein), CTL4, Anopheles gambiae AGAP005334-PA (protein), CTLMA2, Anopheles gambiae
機能・相同性	機能・相同性情報 negative regulation of melanization defense response / carbohydrate binding / external side of plasma membrane 類似検索 - 分子機能 : / C-type lectin, conserved site / C-type lectin domain signature. / Lectin C-type domain / C-type lectin domain profile. / C-type lectin-like / C-type lectin (CTL) or carbohydrate-recognition domain (CRD) / C-type lectin-like/link domain superfamily / C-type lectin fold 類似検索 - ドメイン・相同性 AGAP005335-PA / AGAP005334-PA 類似検索 - 構成要素
生物種	Anopheles gambiae (ガンビエハマダラカ)
登録者	Richard Baxter (Temple University)

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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Data source

SASBDBのページ	SASDFL4

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関連構造データ

類似構造データ	2843 1h09-d 6fi9-2 6gxg-d 7co7-d 1p9w-d 6fi9-4 4mxe-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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外部リンク

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モデル #2841	タイプ: atomic / カイ2乗値: 1.07275877370135 / P-value: 0.481779 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)
モデル #2842	タイプ: atomic / カイ2乗値: 1.07275877370135 / P-value: 0.481779 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)
モデル #2843	タイプ: atomic / カイ2乗値: 1.07275877370135 / P-value: 0.481779 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

試料	名称: C-type lectins CTL4/CTLMA2, 3.1 mg/ml / 試料濃度: 3.1 mg/ml / Entity id: 1505 / 1506
バッファ	名称: 500 mM NaCl, 20 mM CHES, 0.5 mM CaCl2, 1% glycerol / pH: 9 コメント: necessary to prevent formation of higher order oligomers
要素 #1505	名称: CTL4 / タイプ: protein / 記述: AGAP005335-PA / 分子量: 18.095 / 分子数: 1 / 由来: Anopheles gambiae / 参照: UniProt: Q7Q7F7 配列: YRATTAREMI TQNLCVCPCG NPRGGKLYTT PNLRLNWFDA VSYCSSIGMS IATIKDTNER QLLQLHLDGD RRLTRSQKRS KIPYWIGANS LIAGQGLRWG LTDQEVKESA EWADGIAPAN NRVEPFCVYI QGSTMSWVAT SCDDEPRQFI CEYHHHHHH
要素 #1506	名称: CTLMA2 / タイプ: protein / 記述: AGAP005334-PA / 分子量: 17.874 / 分子数: 1 / 由来: Anopheles gambiae / 参照: UniProt: Q7Q7F8 配列: DLSVPKTVDD ILQQNPCLCP CKPFEEKEYF IPISRTSDWF GAVAYCHSVG MELAEVLNED EARAMGEVIA EEESDSDDEF YWIGANDLGV QGTYRWALAG RPVLYSQWAA GEPNHARGEN GQQPAERCVA VAMDKYEWND FQCTQQKPFI CQQFRKH

ビーム

設備名称: Thomas Jefferson University Rigaku BioSAXS-2000
地域: Philadelphia, PA / 国: USA

/ 線源: X-ray in house / 波長: 0.154187 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 0.481 mm

検出器

名称: Pilatus 100K / Pixsize x: 172 mm

スキャン

タイトル: C-type lectins CTL4/CTLMA2, 3.1 mg/ml / 測定日: 2018年8月30日 / 保管温度: 20 °C / セル温度: 20 °C / 照射時間: 300 sec. / フレーム数: 6 / 単位: 1/A /

	Min	Max
Q	0.0066	0.694

距離分布関数 P(R)

ソフトウェア P(R): GNOM 4.6 / ポイント数: 263 /

	Min	Max
Q	0.03097	0.4068
P(R) point	17	279
R	0	80

結果

カーブのタイプ: single_conc /

	実験値	Porod
分子量	39 kDa	36 kDa
体積	-	58 nm³

	P(R)	Guinier	Guinier error
前方散乱 I0	0.6474	0.65	0.01
慣性半径, Rg	2.54 nm	2.49 nm	0.03

	Min	Max
D	-	8
Guinier point	9	32

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関連情報:EMDBヘッダ

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