SASDF72: roX2 RNA stem-loop 7 18mer-fragment (roX2 stem-loop 7, 18-mer fra...

基本情報

• 登録情報: データベース: SASBDB / ID: SASDF72

試料

roX2 RNA stem-loop 7 18mer-fragment

• roX2 stem-loop 7, 18-mer fragment (RNA), SL7-18mer, synthetic construct

• 生物種: synthetic construct (人工物)

登録者

• Po-chia Chen (EMBL, European Molecular Biology Laboratory (EMBL) - Heidelberg, Heidelberg, Germany)

モデル

• モデル #2735: ; タイプ: dummy / ダミー原子の半径: 1.50 A / 対称性: Prolate / カイ2乗値: 0.353 / P-value: 0.336223; Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

試料

• 試料: 名称: roX2 RNA stem-loop 7 18mer-fragment / 試料濃度: 1 mg/ml
• バッファ: 名称: 20 mM NaPO4, 200 mM NaCl, 1 mM DTT / pH: 6.5

要素 #1424

名称: SL7-18mer / タイプ: RNA / 記述: roX2 stem-loop 7, 18-mer fragment / 分子量: 11.592 / 分子数: 1 / 由来: synthetic construct
配列:

AGACGUGUAA AAUGUUGCUC CGCGCAUUUU GCAAUG

実験情報

• ビーム: 設備名称: ESRF BM29 / 地域: Grenoble / 国: France / 線源: X-ray synchrotron / 波長: 0.09919 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 2.867 mm
• 検出器: 名称: Pilatus 1M / タイプ: Dectris / Pixsize x: 172 mm

スキャン

タイトル: roX2 RNA stem-loop 7 18mer-fragment / 測定日: 2016年11月29日 / セル温度: 20 °C / 照射時間: 1 sec. / フレーム数: 10 / 単位: 1/nm /

	Min	Max
Q	0.0348	4.9439

距離分布関数 P(R)

ソフトウェア P(R): GNOM 5.0 / ポイント数: 844 /

	Min	Max
Q	0.397561	4.36915
P(R) point	1	844
R	0	8.5

結果

カーブのタイプ: single_conc /

	実験値	Porod
分子量	11.25 kDa	-
体積	-	14.4 nm3

	P(R)	Guinier	Guinier error
前方散乱 I0	27.73	26.38	0.13
慣性半径, Rg	2.096 nm	1.83 nm	0.51

	Min	Max
D	-	8.5
Guinier point	78	144