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-基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDDB9 |
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試料 | Structure of Halobacterium salinarum VNG0258H/RosR in the presence of 2 M NaBr
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機能・相同性 | Transcription regulator PadR, N-terminal / Transcriptional regulator PadR-like family / Winged helix DNA-binding domain superfamily / Winged helix-like DNA-binding domain superfamily / metal ion binding / PadR family transcription regulator RosR 機能・相同性情報 |
生物種 | Halobacterium salinarum NRC-1 (好塩性) |
引用 | 日付: 2018 Aug タイトル: The 3-D structure of VNG0258H/RosR – a haloarchaeal DNA-binding protein in its ionic shell 著者: Kutnowski N / Shmuely H / Dahan I / Shmulevich F / Davidov G / Shahar A / Eichler J / Zarivach R |
登録者 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-モデル
モデル #2137 | タイプ: dummy / ダミー原子の半径: 2.90 A / カイ2乗値: 0.837225 / P-value: 0.002142 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
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モデル #2144 | タイプ: dummy / ソフトウェア: (5) / ダミー原子の半径: 2.00 A / カイ2乗値: 0.837225 / P-value: 0.002142 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
-試料
試料 | 名称: Structure of Halobacterium salinarum VNG0258H/RosR in the presence of 2 M NaBr 試料濃度: 3 mg/ml |
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バッファ | 名称: 50 mM HEPES, 2 M NaBr, 0.02% NaN3 / pH: 7 |
要素 #1169 | 名称: VNG0258H/RosR / タイプ: protein / 記述: VNG0258H/RosR / 分子量: 14.533 / 分子数: 2 / 由来: Halobacterium salinarum NRC-1 / 参照: UniProt: Q9HSF4 配列: MSEAQPDARS DARDLTAFQK NILTVLGEEA RYGLAIKREL EEYYGEEVNH GRLYPNLDDL VNKGLVEKSE LDKRTNEYAL TNEGFDAVVD DLEWTLSKFV ADADRRERVE TIVADDAAAL EHHHHHH |
-実験情報
ビーム | 設備名称: ESRF BM29 / 地域: Grenoble / 国: France / 線源: X-ray synchrotron / 波長: 0.09919 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 2.869 mm | ||||||||||||||||||||||||||||||
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検出器 | 名称: Pilatus 1M / Pixsize x: 172 mm | ||||||||||||||||||||||||||||||
スキャン | タイトル: Structure of Halobacterium salinarum VNG0258H/RosR in the presence of 2M NaBr 測定日: 2015年9月26日 / 保管温度: 20 °C / セル温度: 20 °C / 照射時間: 1 sec. / フレーム数: 10 / 単位: 1/nm /
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距離分布関数 P(R) | ソフトウェア P(R): GNOM 4.6 / ポイント数: 296 /
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結果 | カーブのタイプ: single_conc コメント: Individual (top) and spatially averaged (DAMFILT, bottom) ab initio models are displayed.
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