SASDD43: Mycobacterial suicide toxin (MbsT) (Mycobacterial suicide toxin, MbsT)

基本情報

• 登録情報: データベース: SASBDB / ID: SASDD43

試料

Mycobacterial suicide toxin (MbsT)

• Mycobacterial suicide toxin (protein), MbsT, Mycobacterium tuberculosis H37Rv

• 機能・相同性: RES domain / RES domain / RES / 転移酵素; グリコシル基を移すもの; 五炭糖残基を移すもの / nucleotidyltransferase activity / NAD(+) phosphorylase MbcT
• 生物種: Mycobacterium tuberculosis H37Rv (結核菌)

登録者

• Diana Freire (EMBL-Hamburg, European Molecular Biology Laboratory (EMBL) - Hamburg outstation, Notkestraße 85, Geb. 25A, 22607 Hamburg, Deutschland, Germany)

モデル

• モデル #1754: ; タイプ: atomic / ダミー原子の半径: 1.90 A / カイ2乗値: 1.221 / P-value: 0.569452; Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)
• モデル #1755: ; タイプ: atomic / ダミー原子の半径: 1.90 A / カイ2乗値: 2.204; Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

試料

• 試料: 名称: Mycobacterial suicide toxin (MbsT) / 試料濃度: 0.40-7.40
• バッファ: 名称: 30 mM Tris-HCl, 200 mM NaCl, 10% glycerol / pH: 7.5

要素 #950

名称: MbsT / タイプ: protein / 記述: Mycobacterial suicide toxin / 分子量: 20.396 / 分子数: 1 / 由来: Mycobacterium tuberculosis H37Rv / 参照: UniProt: P9WLP9
配列:

MDSDALDEGL VQRIDARGTI EWSETCYRYT GAHRDALSGE GARRFGGRWN PPLLFPAIYL ADSAQACMVE VERAAQAAST TAEKMLEAAY RLHTIDVTDL AVLDLTTPQA REAVGLENDD IYGDDWSGCQ AVGHAAWFLH MQGVLVPAAG GVGLVVTAYE QRTRPGQLQL RQSVDLTPAL YQELRAT

実験情報

• ビーム: 設備名称: PETRA III P12 / 地域: Hamburg / 国: Germany / 線源: X-ray synchrotron / 波長: 0.124 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 2 mm
• 検出器: 名称: Pilatus 2M

スキャン

タイトル: Mycobacterial suicide toxin (MbsT) / 測定日: 2017年5月2日 / 保管温度: 20 °C / セル温度: 20.3 °C / 照射時間: 0.05 sec. / フレーム数: 20 / 単位: 1/nm /

	Min	Max
Q	0.1079	4.8347

距離分布関数 P(R)

ソフトウェア P(R): GNOM 5.0 / ポイント数: 1720 /

	Min	Max
Q	0.107882	4.83472
P(R) point	1	1720
R	0	5.6

結果

カーブのタイプ: single_conc

	実験値	Standard	Standard error	Porod
分子量	18 kDa	18 kDa	2	17 kDa
体積	-	-	-	30 nm3

	P(R)	P(R) error	Guinier	Guinier error
前方散乱 I0	18610	14	18612.1	21
慣性半径, Rg	1.747 nm	0.002	1.75 nm	0.1

	Min	Max
D	-	5.6
Guinier point	1	231