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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 9mvv | |||||||||||||||
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タイトル | Pfs230 (D9-D14) with Pfs48/45 of the endogenous Pfs230-Pfs48/45 complex | |||||||||||||||
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![]() | PROTEIN BINDING / 6-cysteine protein / Plasmodium falciparum / malaria transmission | |||||||||||||||
機能・相同性 | ![]() | |||||||||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.36 Å | |||||||||||||||
![]() | Dietrich, M.H. / Glukhova, A. / Shakeel, S. / Tham, W.H. | |||||||||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Cryo-EM structure of the native Pfs230 and Pfs48/45 fertilization complex from Plasmodium falciparum 著者: Dietrich, M.H. / Chmielewski, J. / Chan, L.J. / Tan, L.L. / Adair, A. / Lyons, F.M.T. / Gabriela, M. / Lopaticki, S. / Dite, T.A. / Dagley, L.F. / Longley, R. / Mueller, I. / Glukhova, A. / ...著者: Dietrich, M.H. / Chmielewski, J. / Chan, L.J. / Tan, L.L. / Adair, A. / Lyons, F.M.T. / Gabriela, M. / Lopaticki, S. / Dite, T.A. / Dagley, L.F. / Longley, R. / Mueller, I. / Glukhova, A. / Shakeel, S. / Tham, W.H. | |||||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 340 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 205.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 720.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 729.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 39.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 62.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 48673MC ![]() 9mvtC C: 同じ文献を引用 ( M: このデータのモデリングに利用したマップデータ |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 363701.750 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() ![]() 参照: UniProt: P68874 |
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#2: タンパク質 | 分子量: 48506.062 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() ![]() 参照: UniProt: Q8I6T1 |
Has protein modification | Y |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
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試料調製
構成要素 | 名称: Heterodimeric complex of endogenous Plasmodium falciparum proteins Pfs230 and Pfs48/45 タイプ: COMPLEX / Entity ID: all / 由来: NATURAL |
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分子量 | 値: 0.4 MDa / 実験値: NO |
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
緩衝液 | pH: 8 |
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES |
試料支持 | グリッドの材料: GOLD / グリッドのタイプ: UltrAuFoil R1.2/1.3 |
急速凍結 | 装置: FEI VITROBOT MARK IV / 凍結剤: ETHANE / 湿度: 100 % |
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電子顕微鏡撮影
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: TFS KRIOS |
電子銃 | 電子線源: ![]() |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 1600 nm / 最小 デフォーカス(公称値): 400 nm / Cs: 2.7 mm / C2レンズ絞り径: 70 µm |
試料ホルダ | 凍結剤: NITROGEN |
撮影 | 電子線照射量: 50 e/Å2 フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON IV (4k x 4k) |
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解析
EMソフトウェア |
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CTF補正 | タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION | ||||||||||||||||||||||||
3次元再構成 | 解像度: 3.36 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 87061 / 対称性のタイプ: POINT | ||||||||||||||||||||||||
精密化 | 交差検証法: NONE 立体化学のターゲット値: GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2 | ||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 104.34 Å2 | ||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
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