[日本語] English

万見

- PDB-9egd: AclA from Tenacibaculum discolor in complex with intermediate for... -

+
データを開く

-
基本情報

登録情報

データベース: PDB / ID: 9egd

タイトル

AclA from Tenacibaculum discolor in complex with intermediate formed by C8-Lysine attack on ADP

要素

THIF-type NAD/FAD binding fold domain-containing protein

キーワード

TRANSFERASE / N-acyl-cyclolysine / biosynthesis / signaling

機能・相同性

機能・相同性情報

tRNA threonylcarbamoyladenosine dehydratase / cyclic threonylcarbamoyladenosine biosynthetic process / ubiquitin-like modifier activating enzyme activity
類似検索 - 分子機能

生物種

Tenacibaculum discolor (バクテリア)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 3.15 Å

データ登録者

Shirkey, J.D. / Jeffrey, P.D. / Linares-Otoya, L. / Khatri Chhetri, B. / Donia, M.S. / Hughson, F.M.

資金援助

米国, 1件

引用

ジャーナル: Nature / 年: 2025
タイトル: Discovery of a widespread chemical signalling pathway in the Bacteroidota
著者: Linares-Otoya, L. / Shirkey, J.D. / Khatri Chhetri, B. / Mira, A. / Biswas, A. / Neff, S.L. / Linares-Otoya, M.V. / Chen, Y. / Campos-Florian, J.V. / Ganoza-Yupanqui, M.L. / Jeffrey, P.D. / ...

履歴

登録	2024年11月21日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2025年8月13日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2025年8月20日	Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.title / _citation.year / _citation_author.identifier_ORCID

-
構造の表示

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	9egd.cif.gz	870.6 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb9egd.ent.gz		表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	9egd.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	9egd_validation.pdf.gz	2.9 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	9egd_full_validation.pdf.gz	3 MB	表示
XML形式データ	9egd_validation.xml.gz	73.7 KB	表示
CIF形式データ	9egd_validation.cif.gz	90.4 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/eg/9egd ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/eg/9egd	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	9egbC 9egcC C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#203 - 2016年11月アミノペプチダーゼ1とオートファジー (Aminopeptidase 1 and Autophagy) 類似性 (3) #60 - 2004年12月ユビキチン (Ubiquitin) 類似性 (3) #129 - 2010年9月イソクエン酸脱水素酵素 (Isocitrate Dehydrogenase) 類似性 (1) #154 - 2012年10月クエン酸回路 (Citric Acid Cycle) 類似性 (1) #24 - 2001年12月グリコーゲンホスホリラーゼ (Glycogen Phosphorylase) 類似性 (1) #55 - 2004年7月 DNAリガーゼ (DNA Ligase) 類似性 (1) #16 - 2001年4月アミノアシル転移RNA合成酵素 (Aminoacyl-tRNA Synthetases) 類似性 (1)

PDBのページ

PDBj /

wwPDB /

NCBI

「今月の分子」の関連する項目

#203 - 2016年11月
アミノペプチダーゼ1とオートファジー (Aminopeptidase 1 and Autophagy)
類似性 (3)
#60 - 2004年12月
ユビキチン (Ubiquitin)
類似性 (3)
#129 - 2010年9月
イソクエン酸脱水素酵素 (Isocitrate Dehydrogenase)
類似性 (1)
#154 - 2012年10月
クエン酸回路 (Citric Acid Cycle)
類似性 (1)
#24 - 2001年12月
グリコーゲンホスホリラーゼ (Glycogen Phosphorylase)
類似性 (1)
#55 - 2004年7月
DNAリガーゼ (DNA Ligase)
類似性 (1)
#16 - 2001年4月
アミノアシル転移RNA合成酵素 (Aminoacyl-tRNA Synthetases)
類似性 (1)

-
集合体

登録構造単位

A: THIF-type NAD/FAD binding fold domain-containing protein

B: THIF-type NAD/FAD binding fold domain-containing protein

C: THIF-type NAD/FAD binding fold domain-containing protein

D: THIF-type NAD/FAD binding fold domain-containing protein

E: THIF-type NAD/FAD binding fold domain-containing protein

F: THIF-type NAD/FAD binding fold domain-containing protein

G: THIF-type NAD/FAD binding fold domain-containing protein

ヘテロ分子

215 kDa, 7 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

A: THIF-type NAD/FAD binding fold domain-containing protein

B: THIF-type NAD/FAD binding fold domain-containing protein

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
根拠: gel filtration
61.6 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

C: THIF-type NAD/FAD binding fold domain-containing protein

D: THIF-type NAD/FAD binding fold domain-containing protein

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
根拠: gel filtration
61.4 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

E: THIF-type NAD/FAD binding fold domain-containing protein

F: THIF-type NAD/FAD binding fold domain-containing protein

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
根拠: gel filtration
61.4 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

G: THIF-type NAD/FAD binding fold domain-containing protein

ヘテロ分子

G: THIF-type NAD/FAD binding fold domain-containing protein

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
根拠: gel filtration
61.6 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	204.122, 83.875, 162.948
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 105.491, 90.000
Int Tables number	5
Space group name H-M	C121
Space group name Hall	C2y

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID
1	1
2	1
3	1
4	1
5	1
6	1
7	1

NCSドメイン領域:

Ens-ID: 1

Dom-ID	Component-ID	Beg auth comp-ID	Beg label comp-ID	End auth comp-ID	End label comp-ID	Selection details	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	LYS	LYS	GLU	GLU	(chain 'A' and (resid 2 through 250 or resid 301 through 302))	A	A	2 - 249	16 - 263
1	2	AMP	AMP	A1BIH	A1BIH	(chain 'A' and (resid 2 through 250 or resid 301 through 302))	A	H - I	301 - 302
2	1	LYS	LYS	GLU	GLU	(chain 'B' and (resid 2 through 249 or (resid 250...	B	B	2 - 249	16 - 263
2	2	AMP	AMP	A1BIH	A1BIH	(chain 'B' and (resid 2 through 249 or (resid 250...	B	J - K	301 - 302
3	1	LYS	LYS	GLU	GLU	(chain 'C' and (resid 2 through 249 or (resid 250...	C	C	2 - 249	16 - 263
3	2	AMP	AMP	A1BIH	A1BIH	(chain 'C' and (resid 2 through 249 or (resid 250...	C	N - O	301 - 302
4	1	LYS	LYS	GLU	GLU	(chain 'D' and (resid 2 through 250 or resid 301 through 302))	D	D	2 - 249	16 - 263
4	2	AMP	AMP	A1BIH	A1BIH	(chain 'D' and (resid 2 through 250 or resid 301 through 302))	D	P - Q	301 - 302
5	1	LYS	LYS	GLU	GLU	(chain 'E' and (resid 2 through 249 or (resid 250...	E	E	2 - 249	16 - 263
5	2	AMP	AMP	A1BIH	A1BIH	(chain 'E' and (resid 2 through 249 or (resid 250...	E	R - S	301 - 302
6	1	LYS	LYS	GLU	GLU	(chain 'F' and (resid 2 through 249 or (resid 250...	F	F	2 - 249	16 - 263
6	2	AMP	AMP	A1BIH	A1BIH	(chain 'F' and (resid 2 through 249 or (resid 250...	F	T - U	301 - 302
7	1	LYS	LYS	GLU	GLU	(chain 'G' and (resid 2 through 249 or (resid 250...	G	G	2 - 249	16 - 263
7	2	AMP	AMP	A1BIH	A1BIH	(chain 'G' and (resid 2 through 249 or (resid 250...	G	V - W	301 - 302

-
要素

#1: タンパク質	THIF-type NAD/FAD binding fold domain-containing protein 分子量: 30056.287 Da / 分子数: 7 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Tenacibaculum discolor (バクテリア) 遺伝子: CSC81_02270 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: A0A2G1BYE5
#2: 化合物	ChemComp-AMP / ADENOSINE MONOPHOSPHATE / AMP 分子量: 347.221 Da / 分子数: 7 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₀H₁₄N₅O₇P / コメント: AMP*YM
#3: 化合物	ChemComp-A1BIH / N~2~-octanoyl-L-lysine 分子量: 272.384 Da / 分子数: 7 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₄H₂₈N₂O₃ / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION
#4: 化合物	ChemComp-PEG / DI(HYDROXYETHYL)ETHER / ジエチレングリコ-ル分子量: 106.120 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₄H₁₀O₃
研究の焦点であるリガンドがあるか	Y
Has protein modification	N

-
実験情報

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 3.2 Å³/Da / 溶媒含有率: 61.51 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7 / 詳細: pH 7.0, DL-Malic Acid, PEG-3350, MgCl2

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: NSLS-II / ビームライン: 17-ID-1 / 波長: 0.9201 Å
検出器	タイプ: DECTRIS EIGER X 9M / 検出器: PIXEL / 日付: 2023年7月28日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.9201 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 3.15→29.62 Å / Num. obs: 45960 / % possible obs: 99 % / 冗長度: 3.9 % / CC_1/2: 0.987 / R_merge(I) obs: 0.231 / R_pim(I) all: 0.134 / R_rim(I) all: 0.268 / Χ²: 0.98 / Net I/σ(I): 5.3
反射シェル	解像度: 3.15→3.26 Å / 冗長度: 4 % / R_merge(I) obs: 1.536 / Num. unique obs: 4488 / CC_1/2: 0.541 / R_pim(I) all: 0.867 / R_rim(I) all: 1.767 / Χ²: 0.9

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.17_3644	精密化
Aimless		データスケーリング
XDS		データ削減
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 3.15→29.62 Å / SU ML: 0.4709 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.36 / 位相誤差: 28.0731
立体化学のターゲット値: GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2494	2354	5.13 %
R_work	0.1935	43551	-
obs	0.1964	45905	99.3 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso mean: 88.97 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 3.15→29.62 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	13987	0	308	0	14295

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.0082	14606
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.2727	19699
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.0724	2145
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.0077	2493
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	23.2938	5500

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
3.15-3.21	0.4154	128	0.368	2522	X-RAY DIFFRACTION	98.88
3.21-3.28	0.3457	131	0.3164	2553	X-RAY DIFFRACTION	99.44
3.28-3.36	0.3753	136	0.3044	2551	X-RAY DIFFRACTION	99.04
3.36-3.44	0.3692	145	0.283	2547	X-RAY DIFFRACTION	99.3
3.44-3.54	0.3262	137	0.2843	2529	X-RAY DIFFRACTION	99.22
3.54-3.64	0.2983	148	0.2556	2530	X-RAY DIFFRACTION	99.33
3.64-3.76	0.319	131	0.2206	2540	X-RAY DIFFRACTION	99.11
3.76-3.89	0.2665	135	0.2187	2548	X-RAY DIFFRACTION	99.22
3.89-4.05	0.275	132	0.2042	2550	X-RAY DIFFRACTION	99.3
4.05-4.23	0.243	135	0.1762	2586	X-RAY DIFFRACTION	99.52
4.23-4.45	0.2277	150	0.1515	2541	X-RAY DIFFRACTION	99.34
4.45-4.73	0.1807	143	0.142	2533	X-RAY DIFFRACTION	98.75
4.73-5.1	0.1967	143	0.1542	2572	X-RAY DIFFRACTION	99.23
5.1-5.61	0.2503	145	0.1648	2579	X-RAY DIFFRACTION	99.49
5.61-6.41	0.2082	128	0.169	2602	X-RAY DIFFRACTION	99.71
6.41-8.05	0.2113	149	0.1677	2599	X-RAY DIFFRACTION	99.82
8.05-29.62	0.1901	138	0.1469	2669	X-RAY DIFFRACTION	99.4

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.366987955019	1.08281872042	-1.47172458314	9.25715932453	-7.10994128041	7.18691783873	-0.188097927229	-0.127021330405	1.31027269416	1.78577935568	-0.410448722795	0.205989924601	-0.670913027666	-0.968310560518	0.733753741434	0.739718649302	0.237154163297	-0.0701047083343	0.608771500005	-0.226538713987	1.21069972832	-59.331397734	18.0728895082	62.822530767
2	3.27615273876	1.5350427809	1.16618273325	3.54775189555	1.00110000236	4.70558819015	-0.308067872169	-0.130279108779	1.34477416809	0.302968918059	0.055117309656	-0.0596773530526	-0.457956845421	0.0270772377475	0.160165866013	0.811243958195	0.0127513740632	-0.361133712066	0.335416254005	-0.0489824297306	1.06449283184	-41.7063411906	23.054711011	61.6902190021
3	0.333065791092	0.403740999109	0.263214951401	1.64220175648	-0.0447602744924	0.684640193736	-0.459134406625	-0.128204821098	0.591332589507	0.218298375242	-0.248015787844	-0.0241691699749	-0.660018964186	-0.178523485437	-0.113459429984	1.10332990016	-0.0268634034417	-0.633897820285	0.314533831118	-0.0685510827346	1.41946248022	-36.9842061029	30.6814418523	59.4152460004
4	0.00501776808581	0.070741038683	0.0291886652521	1.12675858932	0.502546079914	0.220575951667	0.606392738787	-0.705742024285	0.63627778234	0.408171988451	-0.182853931047	0.0166355770815	-0.499141384547	0.332445876183	0.931879426879	0.953242811429	-0.288914525507	-0.48943442621	0.382117642815	-0.371366660233	0.853023986103	-32.699294331	21.5663760743	72.3498313156
5	0.976632613942	-0.336267061233	0.362890111555	3.04993377378	1.21409493825	2.34143155174	0.144369588243	-0.364848700496	0.0717054417586	0.621646543463	0.103773590884	-0.809501029099	-0.118627222191	0.121461389296	0.20382312188	0.79526221002	-0.0323341877852	-0.434224003265	0.154282672055	-0.0582950707204	0.978586520981	-29.527830063	13.9830105191	63.6945156155
6	2.72096055631	-0.161910212843	1.23280964976	6.65357406534	2.43931112873	2.60549790905	-0.112063777407	0.145099994166	0.0230825497811	-0.0101107555993	-0.19701190068	-1.03731222856	0.288092888417	0.847292617947	-0.087826514666	0.693419224534	0.0221048933232	-0.242170490743	0.472340143628	0.0269505377893	0.921167018898	-24.1133886441	4.78585603976	59.5801562128
7	3.17145892745	-1.62680743363	-1.52886801916	3.50493294401	-0.413111972158	6.55623405338	0.263984147869	0.303246067694	0.502326186338	-0.136278659544	-0.133841020058	-0.406324303524	0.301246396496	0.672939637929	-0.19413566624	0.611016321449	-0.0700728814534	-0.444467903628	0.514969289198	-0.0531869489014	0.902763472261	-32.4108057698	9.59373703386	50.4025912192
8	5.08762135532	-4.91460226133	0.306583547515	7.50380960201	-2.62722399352	6.76683976036	0.095430884586	-0.173172474267	-0.188699167692	0.520569110557	-0.137919310375	0.0330201262759	0.823445321066	-0.493231536323	-0.110318702356	0.653994706343	-0.124491765801	-0.356248105166	0.289407940397	0.0146838814883	0.687727718903	-39.2704269995	3.75085420226	60.4509786692
9	2.58515673026	-4.81096486535	-4.03986187094	9.39117446539	8.23679937318	7.45122402508	-1.01201237716	-0.0611596511697	0.760300251527	-1.57704880692	0.0685097570822	-0.358324886713	-2.28359111502	1.58680655772	0.475292673357	0.871102549423	-0.330207981384	-0.537316656482	0.956452130561	0.246296240983	1.54152042316	-30.4848299688	20.2576402423	39.2953563895
10	1.97922158654	-0.997316158543	0.481745832807	3.24768632512	0.632027666043	3.12163298407	-0.628098611776	0.328020878877	0.994052015569	-0.575039662596	-0.221238349605	0.468254030492	-0.946129422441	-0.209195951069	0.532994517977	0.862866567494	0.00746177178788	-0.484262658121	0.545094311495	0.0663844561172	1.21087772785	-51.9935368274	24.7829908141	40.262745833
11	2.42478890706	0.110837908004	-0.426966696009	2.24022090065	-2.13632883605	7.61348410309	-0.0475299158576	0.661472932808	0.109475343891	-0.102705292906	0.0771209694226	0.601902713135	-0.386177660945	-0.216320277837	-0.0747659358205	0.744865654616	0.0653426085189	-0.486295405164	0.472033662016	0.0771011347854	1.09020976158	-57.9586055648	11.8468754038	37.3245115246
12	1.59782776429	-0.142439801977	1.75086906774	2.29233196878	0.500519867091	7.25180177238	-0.193231171366	0.126269604163	-0.283450439772	-0.219589741557	-0.432511613383	0.690145226421	-0.403818499651	-0.699242290207	-0.025329675837	0.663962290269	0.0675459484685	-0.278015012152	0.557451942935	-0.212449347315	1.01776641519	-61.95455589	0.222305344892	43.2031154411
13	1.35420773816	-1.91766951887	-0.27873740879	5.07332341593	3.53789420108	7.87548653821	-0.194811842694	-0.0339525728614	-0.500845951758	0.993934234266	-0.238380480524	1.29644977543	0.535748757195	-0.839706093173	0.703942160411	0.685175201327	-0.118822592625	-0.176005583785	0.522098847849	-0.0857057699323	1.04385411796	-62.1171262657	5.29399533876	58.2817810902
14	5.26072624399	2.62986192633	-3.07408742207	1.33372931025	-1.62531072586	9.26868694424	-0.0524072967412	0.349747433509	-0.07272085679	0.0039244338329	-0.134045284375	-0.343483784821	-0.342617080465	0.151311202636	0.345080505575	0.504285640254	0.0225347430758	-0.191387021054	0.394971131902	0.0577314908866	0.922585738744	-45.553936112	12.6122874179	43.8266941965
15	8.22400149495	4.46053909832	-1.19861228227	4.03720352185	2.06688939087	5.57074299374	-0.138076310686	0.654074631307	-0.89270147068	-0.179813267425	-0.0786293441272	-0.350455840824	1.14594001276	0.0581711479946	0.188898468772	0.591189735236	0.0901293866165	-0.336284165088	0.376706381678	-0.112047109796	1.0103454192	-47.1046741476	2.81327175895	41.9608990459
16	9.78517105988	0.785795674639	0.177489377077	3.25614805695	-4.67768245648	6.91489252308	-0.405091072364	-0.502493067118	1.65813834639	0.840407696685	0.297083261341	-0.752676965147	-1.26044134546	-0.18246500449	-0.0482718766574	0.693132188763	0.126789849229	-0.256948865544	0.690177657395	-0.197867596764	1.4259058357	-4.84424901605	59.0180116119	24.8086760196
17	4.28720089206	-1.22139324579	-0.935132135293	6.22254349329	-0.620112302501	2.87596427671	0.0352359964847	-0.253762636815	0.784860735985	-0.252142756362	0.297548059657	0.833850153086	-0.255490004065	-1.00609707915	0.0167083907565	0.302580323588	0.104010768872	0.0581813637259	0.988007490244	-0.0816786557201	0.551741290319	-15.7363386813	46.6305604384	25.9224235403
18	2.79355584217	-1.94575282136	-1.59444196005	3.5127604567	1.12961080828	2.37563297866	-0.192576307922	-0.493447274362	0.449724867516	0.152150669131	0.13809207719	1.16979159992	-0.586428637535	-0.786718006295	-0.145824815054	0.328222257301	0.138758842098	0.0488822481408	1.10762384613	-0.129454215362	0.780775436001	-19.4011749573	47.2447816909	31.0578489982
19	2.85207921565	0.403734413953	-2.55305031634	6.24612497333	-2.43727510439	3.57214319168	-0.602359036353	0.8389794492	0.241997434704	-0.450603273675	0.38094552274	-0.197251515529	0.0271023865775	-1.21678579073	0.160602616291	0.455634675867	0.169397003246	-0.115050359476	1.16271587648	-0.00464612890934	1.10929538885	-23.8322227198	47.5451677027	13.2666555861
20	5.08073496955	0.465100992024	1.0102348324	2.31108878848	0.7050041857	1.28571640547	0.160747245721	0.643642749324	0.391837852952	-0.582872235296	-0.0864058410318	0.542044588753	0.0104601007629	-0.723060241057	-0.102980810463	0.411167594726	0.217886679714	-0.164983114049	0.835475313594	-0.0838946256491	0.744257999143	-13.5546894819	44.2169634839	10.548218388
21	6.01109223999	2.81421676236	-0.891940695243	6.10647483148	-3.03765885044	6.44082387383	0.82677317715	0.869177970034	-0.751982259039	0.167620129787	-0.705554965818	0.689564815432	0.0960692348846	-0.928872154005	-0.125843058178	0.373499066703	-0.113310363708	-0.0491946314403	1.45584307304	0.0668995031617	1.03828274624	-14.7526297699	37.9230917275	2.11564879837
22	6.66119493182	-0.0707319686634	-3.13012937387	7.09974497939	-2.00463925341	2.95373623591	-0.562167862465	1.23649654125	-1.04662478205	-0.592744891085	0.3559188698	0.0704664028835	1.02925856304	-0.541352450144	0.124769930069	0.447630622785	-0.162913408092	0.00294755555697	0.826674692058	-0.0832202921774	0.528944761021	-6.90813934951	26.7710310435	12.5616044784
23	8.29891878931	1.595181025	-2.94112101416	6.06566761202	-1.78708485931	5.68448872304	-0.0119943126175	0.714512870344	0.459791522492	0.203233098466	0.0347644743874	-0.369319409832	-0.381513068416	0.416461511359	-0.0632499619753	0.241018010898	0.063159605472	-0.116439158886	0.567663023469	-0.140867443819	0.59442192673	-2.60323530138	45.2644115549	15.814973326
24	7.99365945359	0.263310844804	-1.23948702913	7.13626476345	6.5252841865	7.89987213581	-0.920141730614	-0.802273336594	-1.34269067757	0.62655208959	0.303943330127	1.40872907323	1.0523612327	-0.51422093039	0.601855181721	0.739270893578	-0.025376768362	0.0204845204998	1.06129529164	0.185518096417	1.13605243923	-13.3868485088	25.4847593349	29.1520138502
25	4.22327021546	1.11264806653	0.717184378196	5.9499109638	1.33392262128	4.3997684175	-0.134689195347	-1.09120068239	0.70232709468	0.331086433391	-0.398089514004	-0.20528625935	-0.483613197314	-0.251089263621	0.408117830703	0.357763180196	0.0876951915007	-0.0307955920892	1.01069251502	-0.103640440912	0.587053887483	-4.05190074115	39.9859030382	39.779372547
26	8.78332239845	5.19566534296	1.3167382388	3.47386293633	1.48814809353	3.92778822997	0.462300875917	-1.77354945106	0.174060759669	1.37246965537	-0.185927717066	0.492751320254	0.241408432206	-0.469131537314	-0.144352004585	0.596748621625	0.140184246874	-0.0290972976805	1.4393760618	-0.0890880342305	0.67994831637	-9.00343331094	38.9309842591	45.0994409492
27	6.40977962317	2.25020989123	1.34338667031	2.74976662221	3.14634377966	4.32095882384	0.129419178012	-2.2921840878	0.496770828621	1.74813979901	0.229532795045	-0.869730494932	0.803462776471	0.666267009757	-0.473872488001	1.0010201619	0.206777143882	-0.202225062086	1.72735988586	-0.0551453121773	0.731096917679	8.59707641769	39.31143328	52.8041660612
28	2.4336061537	-0.817184184325	-0.402266282383	8.68824559641	-4.04267700028	7.34964205422	0.43687459549	-1.8209563577	0.154819785252	1.91728923821	0.151771137937	-0.879680645654	0.017914655059	0.759256223009	-0.445256727101	0.609592823264	0.112366164797	-0.140113184211	1.1317581668	-0.106340484574	0.622260460137	9.29323754789	38.6127027656	43.4127789399
29	4.4231458544	-2.87256905038	1.9349809258	7.29304560609	-5.01565910197	5.50735450234	-0.136454723931	-1.43451519603	0.551844164833	0.705375578601	-0.955413212997	-1.71155330684	-0.179545169098	2.08354443522	0.760789030381	0.830386750829	0.151104188708	-0.473292741294	1.70763302251	0.0208643199425	1.32005496775	15.4918678142	34.6294299541	45.0133230595
30	6.64991645875	0.868609016473	0.616739682193	4.44625282285	-5.2802043469	9.02533176571	0.472817380478	0.0747681355811	0.390834256966	-0.230141133049	-0.921625097852	-0.333955383492	0.560978885354	1.48696085028	0.359706881975	0.453189206524	0.183377027828	-0.260381245342	0.922110877662	-0.102101725252	0.866382340225	9.02178626475	38.9860302769	32.2088419786
31	7.82908110477	-0.6364232895	4.00094194349	8.99986290672	3.18154892375	5.35007728986	-0.95441502067	-0.597072501138	0.962018932922	0.187989984246	0.840496926566	1.03672819345	-0.357116500392	-0.0414548001772	0.211826706922	0.717368979869	0.080259113452	-0.176334230911	1.20022712641	-0.0837408136632	1.11055804634	22.4322495764	39.904009511	36.2524378882
32	8.80234251871	-1.85832919572	-1.99815802425	8.05591744432	-3.07596927278	2.57009321753	0.166765945859	0.168099242614	0.0362462414979	0.918564803689	0.0914519807791	-1.05763834942	-0.177920561942	0.567875579637	-0.245723479363	0.429403968568	0.0865727955706	-0.227756777668	0.971379781045	-0.235000304742	1.03772501258	18.5128934522	43.2834549391	23.7662975531
33	6.19527559298	0.210151824386	-1.67844436446	5.47526790912	-2.29810704139	5.07415890878	0.403773386454	-0.311020419342	0.591224378709	-0.0139990631762	-0.340093147629	-0.416517045848	-0.473256613289	0.294492180727	-0.0622445531164	0.415984231507	0.032549450749	-0.210251628413	0.75758969564	-0.0692233925458	0.803447034832	8.31468386935	47.501460006	27.009896544
34	3.8558461849	1.22359453101	1.89074576411	0.908394539679	0.581228845354	1.81027263267	0.373919847789	0.211904385399	-1.55775984113	0.216275287474	-0.0213856460955	-0.988631952604	0.722083790624	0.779710484624	-0.163511110086	0.389912221163	0.215026425395	-0.0955590084577	1.03240975943	-0.0142718629795	1.05481519723	9.25157000623	32.8692452903	25.4371885424
35	5.15305379911	1.34587372845	-0.838829918318	3.00774086924	-1.5652011588	4.2592876827	0.460138459833	1.69730454255	0.530393370997	-0.354472208482	-0.452350712904	-0.696853557129	-0.178652350257	0.190649974856	-0.162054740238	0.511841433792	0.298253130596	0.117418635591	1.39183716709	0.0750479708093	0.863162359622	-45.2050303519	69.9872092246	11.1583948468
36	4.06935724323	-0.869397945502	-1.32882664323	1.07913119624	0.647544964068	1.58843673144	0.299534902275	0.52925988222	-1.02290862663	0.244580156728	-0.163749729232	-0.415110080842	0.502274810492	0.561550626348	-0.121422759732	0.514334048054	0.215814311651	-0.296847343337	0.962779174272	-0.33228949283	1.44179900245	-46.0602838062	52.782570341	20.4462577817
37	5.04581019046	1.24223638659	2.57998577221	2.94701702765	-1.8700071722	7.22491465289	-0.253226391098	2.17103160258	0.225689736608	-0.215916022861	-0.173532755169	-1.6586367129	0.675703762608	1.00960172022	0.308139478127	0.560661250633	0.328076305119	-0.00901027512368	1.45698062045	-0.367027985462	1.08547310126	-39.5486261767	54.8537388618	14.0392869599
38	0.261560522423	-0.287516649684	-0.170283314299	3.53349622997	-0.0384754030038	0.122186097157	0.140879268678	-0.259242462295	-1.13568799676	0.643800792845	0.807977339853	-1.00655389706	0.337254627164	0.286103962585	-0.668363898676	0.592627090292	0.114308796467	-0.350956344286	0.833869546953	-0.268927245472	2.0970512555	-30.9800822011	56.9826261052	31.1478830228
39	6.49960692683	2.45449942311	-2.92939735819	3.49457786699	1.55282671199	4.07179149164	-0.160821804784	0.620760059936	-0.595266126342	0.702517248315	-0.250693753708	-0.256356992894	0.410580509444	0.629617667832	0.299583396896	0.322166650365	0.141769258543	-0.0645202979779	0.815338304256	0.0308639450816	1.24963576519	-39.0541250328	61.5289417515	31.3081451796
40	5.26701737595	0.227902226812	-0.377480374856	0.37099429281	0.380078762894	2.60391598246	0.194730853001	0.519161706683	0.376574471818	0.0821878146149	0.0142011169149	-0.370757684672	0.139230628815	0.246893872177	-0.0860782346245	0.297000518078	0.110990118831	-0.21818341907	0.666122521321	-0.0518651935663	1.22648215103	-43.9819859417	65.6739256227	32.9876454679
41	5.99183724784	2.58295422631	-1.32661395107	5.02682245893	-0.749518182112	2.49070962667	-0.00455035149093	0.311314622614	0.288054253892	0.334827056267	0.269614251776	0.131061838009	0.251863899118	0.0738203171129	-0.31475776024	0.587541202359	0.0405336309909	-0.45845147251	0.70046763672	-0.059213300506	1.27654222163	-44.4261510095	66.2642051142	43.9164581907
42	6.28115110672	-3.32553576132	0.00385695939276	6.26726744288	3.68309841652	6.21465238574	-0.198757851611	-0.0345060493448	-0.630614728777	1.00768064893	0.11786772865	0.117637209845	0.554539006523	0.103634400029	0.0525073627743	0.550281998862	0.0148022205659	-0.217685047726	0.521163551795	-0.150098001998	0.977258421125	-59.5319474595	59.6023790075	40.636752623
43	2.26139514985	-1.93647852557	1.1190023788	3.37948894799	0.0217734072238	6.30882503912	0.542629306766	1.29810092194	0.662644296323	0.211845916818	-0.60926893486	-0.338796897102	-0.000830272694202	-0.105410855731	-0.11305976792	0.279188423467	0.131115415726	-0.0075023496502	0.800141616488	-0.0956022740394	0.805867943188	-51.4947108481	66.6461204026	21.9428555271
44	2.63952817519	-0.0867514841329	0.553466137503	6.66568589563	-1.23414472141	2.41697593781	0.0407251634493	1.19778611514	1.10729001249	0.182510842046	0.0927280495569	-0.360311298618	-0.379610774356	-0.5145428969	0.119233561413	0.293542162008	0.077879176084	-0.0530982589168	0.792230229079	-0.00378004844212	1.07993053908	-54.136016694	73.0353652885	29.7990685925
45	2.65443124574	0.524781769505	0.414489060513	2.34268516687	0.0808347597647	2.45224112918	0.0798297921321	1.51186307659	-0.832944116305	0.0995410011388	-0.157735802864	0.243386580073	0.615792561411	-0.31901106984	-0.179692074574	0.537607893163	0.164783414597	-0.394702445981	1.22420613756	-0.530267386662	1.41668705486	-62.8049715432	49.8325449034	17.2305566781
46	2.06598151115	0.315948292044	2.92468835146	4.56950048673	0.230724926307	4.15393205583	0.158992312308	2.61470156608	-0.586577266199	-0.614207654325	0.256882258096	-0.282222961326	0.634443471788	0.473607906093	-0.439217240129	0.894999338555	0.0766278967774	-0.127829599052	2.44209122786	-0.79698961916	1.26429805725	-52.9420848239	55.1106529118	3.39802047606
47	3.39956672575	0.520921477373	3.40046354793	0.152106916248	0.476503532875	3.41046443457	0.118055983689	0.318912078136	-0.422547908568	-0.237790236255	0.19964082022	-0.118009418014	0.608011633297	-0.201182555428	-0.846409583656	0.610854638299	-0.0227747404806	-0.487771732507	1.50386819434	-0.7789021715	1.55271675302	-59.9277666467	45.1501589696	8.68853929812
48	3.20133484314	-1.58626404592	-0.299202541367	2.02763776157	0.0454008811648	0.0346687898047	0.242695164446	3.04271185076	-0.323433268712	-2.01202741772	-0.0416504319752	0.435693591868	0.488907861279	-0.92693921598	-0.531120603302	1.02812892813	-0.0636721119142	-0.203569989723	2.06392072032	-0.222555090417	1.03656057845	-74.9132704949	52.007856942	-1.20736231237
49	2.42366869054	1.26168371081	-0.213658158122	1.10144433952	-0.447388252867	0.264529680564	-0.019382140634	1.15485132119	0.0447310234324	-0.71207228282	-0.102624830397	0.437920376528	0.416269971274	-0.223679340843	-0.28577016495	0.422757080946	0.190447072915	-0.623235899489	1.69740814507	-0.571891435175	1.40124359974	-73.7856605002	60.3482470776	9.65571736113
50	4.25833722814	-4.78402614885	2.15609658369	5.48385168285	-1.69530469707	6.16016604871	0.820371903969	1.87033114126	-0.101448051005	-0.00352199780482	-0.355413714607	-0.49975345173	0.407041479701	1.11074124619	-0.499817217534	0.668759665832	0.0845034789865	-0.163676569943	1.25852462978	-0.242721471401	1.00174033287	-80.1086670749	70.0781703351	7.9839341828
51	1.01158375957	-1.19931353413	-0.429519539665	2.24210176086	0.188780331029	1.46364531972	0.182951552307	0.828363298956	0.359249571289	-0.264987021723	0.0533940218812	0.00162962607461	-0.173341999879	-0.429434650698	-0.285028006597	0.445728201443	0.136527867533	-0.210367809521	1.2930826457	-0.0109599759955	1.02421536068	-65.1626482887	72.7032987612	14.1786920291
52	3.32670553766	-0.0614220663816	0.684798791871	1.70960744596	-1.30136518738	1.1184864621	-0.143040033152	0.425595959223	0.0384094469913	-0.113773143139	-0.335211921732	0.422936349175	0.119232656886	-0.249672985457	-0.918330275889	0.34014927696	0.450737742946	-0.425743769577	1.21616736947	-0.361186610595	1.05839525879	-71.7262055837	65.319905504	23.4449886307
53	4.07500826334	-2.21424950696	0.485907324401	3.64394908532	2.58309286823	3.37523576877	0.460550258562	-0.666511032704	-1.33593624845	0.389637167266	-0.159014090765	0.948122269699	0.363952936814	-0.399525863662	0.449665182483	0.809916010534	-0.173902216951	-0.244678708711	0.351322738194	0.108598307187	0.617136515236	-37.8510523402	52.5189285841	83.5955049125
54	0.634492243495	0.0387096988391	0.506115891908	0.0425275643121	0.042127493783	0.400757390951	0.212304605512	-0.088613321378	-0.849693743022	-0.392148919593	0.288543856254	0.187097219384	0.369720279573	-0.083655637537	0.100618316223	0.971245631091	0.017448713354	-0.615806330577	0.331092011084	-0.141429404	1.39134475966	-29.35317781	44.7942077444	68.7967873014
55	5.58068949165	3.20681724418	0.437398735597	2.46130839697	1.13795108618	1.31589663548	0.188887102124	0.451727104936	-0.477355138481	-0.579306931979	-0.232158232703	0.274940509148	0.0830893927419	-0.384105355331	0.0191983073228	0.779814389379	-0.0210494685271	-0.487025995518	0.230613181301	0.0395717210507	0.966380474019	-33.4911201789	58.2950286733	62.874687998
56	5.54408909246	2.1590394503	2.04720286021	3.48913487025	0.637526397974	2.08100075332	0.429740206224	0.949369120235	0.113784683926	-1.21999959745	-0.0174122797842	0.676696571875	-0.151610761818	0.306040111491	-0.40263908177	1.31293979865	0.135884933954	-0.686853205198	0.629408205959	-0.0680321283245	1.24135229699	-31.7636659956	66.9559772978	54.8429001163
57	5.20476779651	-3.47719346596	2.37973941048	5.68074364952	0.646574009676	2.66365221343	-0.0975700277627	0.850791221271	0.428957173698	-0.310904582252	-0.0911690137847	-0.375795077725	-0.185548902133	0.475876278792	-0.0791057966414	0.685459663554	0.0107405464155	-0.206939866057	0.374740408316	0.00366067224664	0.972429765412	-15.9285572585	68.0670922982	62.2933175348
58	3.63410304	-1.00686121474	-0.0568120102049	0.6257521912	-1.1552326628	4.13505257835	0.294178620659	-0.179570623582	0.0642681452846	-0.0774663448426	-0.461674729462	0.285312088621	-0.439187261611	-0.184565198498	0.377682812348	0.734761197892	-0.0172062613817	-0.378275684275	0.361811685836	0.0521547105961	0.956875807786	-29.6817884439	63.7896398465	74.7170125349

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 1 through 13 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 14 through 62 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 63 through 103 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 104 through 116 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 117 through 154 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 155 through 186 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'A' and (resid 187 through 233 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'A' and (resid 234 through 250 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 1 through 13 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 14 through 108 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 109 through 154 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resid 155 through 187 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resid 188 through 213 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'B' and (resid 214 through 232 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'B' and (resid 233 through 250 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'C' and (resid 2 through 31 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'C' and (resid 32 through 60 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'C' and (resid 61 through 95 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'C' and (resid 96 through 123 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'C' and (resid 124 through 154 )
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'C' and (resid 155 through 172 )
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'C' and (resid 173 through 213 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'C' and (resid 214 through 250 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'D' and (resid 1 through 13 )
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'D' and (resid 14 through 74 )
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'D' and (resid 75 through 95 )
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'D' and (resid 96 through 108 )
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'D' and (resid 109 through 123 )
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'D' and (resid 124 through 135 )
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'D' and (resid 136 through 154 )
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'D' and (resid 155 through 172 )
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'D' and (resid 173 through 187 )
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'D' and (resid 188 through 232 )
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'D' and (resid 233 through 250 )
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'E' and (resid 2 through 31 )
36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'E' and (resid 32 through 74 )
37	X-RAY DIFFRACTION	37	chain 'E' and (resid 75 through 95 )
38	X-RAY DIFFRACTION	38	chain 'E' and (resid 96 through 108 )
39	X-RAY DIFFRACTION	39	chain 'E' and (resid 109 through 123 )
40	X-RAY DIFFRACTION	40	chain 'E' and (resid 124 through 154 )
41	X-RAY DIFFRACTION	41	chain 'E' and (resid 155 through 172 )
42	X-RAY DIFFRACTION	42	chain 'E' and (resid 173 through 213 )
43	X-RAY DIFFRACTION	43	chain 'E' and (resid 214 through 233 )
44	X-RAY DIFFRACTION	44	chain 'E' and (resid 234 through 250 )
45	X-RAY DIFFRACTION	45	chain 'F' and (resid 2 through 62 )
46	X-RAY DIFFRACTION	46	chain 'F' and (resid 63 through 74 )
47	X-RAY DIFFRACTION	47	chain 'F' and (resid 75 through 95 )
48	X-RAY DIFFRACTION	48	chain 'F' and (resid 96 through 108 )
49	X-RAY DIFFRACTION	49	chain 'F' and (resid 109 through 154 )
50	X-RAY DIFFRACTION	50	chain 'F' and (resid 155 through 172 )
51	X-RAY DIFFRACTION	51	chain 'F' and (resid 173 through 232 )
52	X-RAY DIFFRACTION	52	chain 'F' and (resid 233 through 250 )
53	X-RAY DIFFRACTION	53	chain 'G' and (resid 2 through 31 )
54	X-RAY DIFFRACTION	54	chain 'G' and (resid 32 through 108 )
55	X-RAY DIFFRACTION	55	chain 'G' and (resid 109 through 154 )
56	X-RAY DIFFRACTION	56	chain 'G' and (resid 155 through 172 )
57	X-RAY DIFFRACTION	57	chain 'G' and (resid 173 through 213 )
58	X-RAY DIFFRACTION	58	chain 'G' and (resid 214 through 250 )

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-ダウンロード

-検証レポート

-関連構造データ

-リンク

-集合体

-要素

-実験情報

-実験

-試料調製

-データ収集

-解析

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)