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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 9cpj | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
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タイトル | Structures of small molecules bound to RNA repeat expansions that cause Huntington's disease-like 2 and myotonic dystrophy type 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
要素 | RNA (5'-R(*キーワード | RNA / CUG repeats / myotonic dystrophy type 1 / DM1 / 5'CUG/3'GUC | 機能・相同性 | RNA / RNA (> 10) | 機能・相同性情報 生物種 | Homo sapiens (ヒト) | 手法 | 溶液NMR / simulated annealing | データ登録者 | Chen, J.L. / Taghavi, A. / Disney, M.D. / Fountain, M.A. / Childs-Disney, J.L. | 資金援助 | 米国, 3件 |
引用 | ジャーナル: Bioorg.Med.Chem.Lett. / 年: 2024 | タイトル: Structures of small molecules bound to RNA repeat expansions that cause Huntington's disease-like 2 and myotonic dystrophy type 1. 著者: Chen, J.L. / Taghavi, A. / Frank, A.J. / Fountain, M.A. / Choudhary, S. / Roy, S. / Childs-Disney, J.L. / Disney, M.D. 履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 9cpj.cif.gz | 325.5 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb9cpj.ent.gz | 272.8 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 9cpj.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 9cpj_validation.pdf.gz | 424.8 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 9cpj_full_validation.pdf.gz | 802.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | 9cpj_validation.xml.gz | 33.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 9cpj_validation.cif.gz | 47.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/cp/9cpj ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/cp/9cpj | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | 9cpdC 9cpgC 9cpiC C: 同じ文献を引用 (文献) |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索 |
その他のデータベース |
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-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: RNA鎖 | 分子量: 4133.501 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) Homo sapiens (ヒト) |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 |
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-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 2 | ||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: fewest violations | ||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the least restraint violations 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |