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- PDB-8yor: Complex of HARSWHEP and a-HARSWHEP Fab -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 8yor
タイトルComplex of HARSWHEP and a-HARSWHEP Fab
要素
  • Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic
  • a-HARSWHEP Fab-heavy chain
  • a-HARSWHEP Fab-light chain
キーワードSPLICING/IMMUNE SYSTEM / NRP2 / Lung Inflammation / His-tRNA Synthetase Splice Variant / SPLICING / SPLICING-IMMUNE SYSTEM complex
機能・相同性
機能・相同性情報


histidine-tRNA ligase / histidine-tRNA ligase activity / histidyl-tRNA aminoacylation / Cytosolic tRNA aminoacylation / tRNA aminoacylation for protein translation / mitochondrial translation / translation / protein homodimerization activity / mitochondrion / RNA binding ...histidine-tRNA ligase / histidine-tRNA ligase activity / histidyl-tRNA aminoacylation / Cytosolic tRNA aminoacylation / tRNA aminoacylation for protein translation / mitochondrial translation / translation / protein homodimerization activity / mitochondrion / RNA binding / ATP binding / identical protein binding / cytosol / cytoplasm
類似検索 - 分子機能
Histidyl-anticodon-binding / Histidine-tRNA ligase / Histidine-tRNA ligase/ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / Class II Histidinyl-tRNA synthetase (HisRS)-like catalytic core domain / Histidyl-tRNA synthetase / WHEP-TRS domain / WHEP-TRS domain / WHEP-TRS domain signature. / WHEP-TRS domain profile. / WHEP-TRS ...Histidyl-anticodon-binding / Histidine-tRNA ligase / Histidine-tRNA ligase/ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / Class II Histidinyl-tRNA synthetase (HisRS)-like catalytic core domain / Histidyl-tRNA synthetase / WHEP-TRS domain / WHEP-TRS domain / WHEP-TRS domain signature. / WHEP-TRS domain profile. / WHEP-TRS / Anticodon-binding / Anticodon binding domain / Anticodon-binding domain superfamily / Aminoacyl-tRNA synthetase, class II / Aminoacyl-transfer RNA synthetases class-II family profile. / Class II Aminoacyl-tRNA synthetase/Biotinyl protein ligase (BPL) and lipoyl protein ligase (LPL) / S15/NS1, RNA-binding
類似検索 - ドメイン・相同性
Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic
類似検索 - 構成要素
生物種Homo sapiens (ヒト)
手法X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.3 Å
データ登録者Zhai, L.
資金援助1件
組織認可番号国
Not funded
引用ジャーナル: Sci Transl Med / 年: 2025
タイトル: A human histidyl-tRNA synthetase splice variant therapeutic targets NRP2 to resolve lung inflammation and fibrosis.
著者: Nangle, L.A. / Xu, Z. / Siefker, D. / Burkart, C. / Chong, Y.E. / Zhai, L. / Geng, Y. / Polizzi, C. / Guy, L. / Eide, L. / Tong, Y. / Klopp-Savino, S. / Ferrer, M. / Rauch, K. / Wang, A. / ...著者: Nangle, L.A. / Xu, Z. / Siefker, D. / Burkart, C. / Chong, Y.E. / Zhai, L. / Geng, Y. / Polizzi, C. / Guy, L. / Eide, L. / Tong, Y. / Klopp-Savino, S. / Ferrer, M. / Rauch, K. / Wang, A. / Hamel, K. / Crampton, S. / Paz, S. / Chiang, K.P. / Do, M.H. / Burman, L. / Lee, D. / Zhang, M. / Ogilvie, K. / King, D. / Adams, R.A. / Schimmel, P.
履歴
登録2024年3月13日登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ
改定 1.02025年2月12日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12025年4月2日Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author
Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year

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構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

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集合体

登録構造単位
A: a-HARSWHEP Fab-light chain
B: a-HARSWHEP Fab-heavy chain
E: Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic
C: a-HARSWHEP Fab-light chain
F: Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic
D: a-HARSWHEP Fab-heavy chain


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)112,8686
ポリマ－112,8686
非ポリマー00
水10,323573
1
A: a-HARSWHEP Fab-light chain
B: a-HARSWHEP Fab-heavy chain
E: Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)56,4343
ポリマ－56,4343
非ポリマー00
水543
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
Buried area5240 Å2
ΔGint-27 kcal/mol
Surface area22300 Å2
手法PISA
2
C: a-HARSWHEP Fab-light chain
F: Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic
D: a-HARSWHEP Fab-heavy chain


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)56,4343
ポリマ－56,4343
非ポリマー00
水543
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
Buried area5270 Å2
ΔGint-33 kcal/mol
Surface area22010 Å2
手法PISA
単位格子
Length a, b, c (Å)86.750, 113.560, 149.499
Angle α, β, γ (deg.)90.00, 106.60, 90.00
Int Tables number5
Space group name H-MI121
Components on special symmetry positions
IDモデル要素
11B-302-

HOH

21D-304-

HOH

-
要素

#1: 抗体 a-HARSWHEP Fab-light chain


分子量: 23886.451 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌)
#2: 抗体 a-HARSWHEP Fab-heavy chain


分子量: 24961.738 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌)
#3: タンパク質 Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic / Histidyl-tRNA synthetase / HisRS / HARSWHEP


分子量: 7585.847 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: HARS1, HARS, HRS / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P12081, histidine-tRNA ligase
#4: 水 ChemComp-HOH / water


分子量: 18.015 Da / 分子数: 573 / 由来タイプ: 天然 / 式: H2O
Has protein modificationY

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実験情報

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実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶マシュー密度: 3.13 Å3/Da / 溶媒含有率: 60.65 %
結晶化温度: 289.15 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法
詳細: 20% w/v PEG 3350, 0.2 M potassium sodium tartrate tetrahydrate pH7.4

-
データ収集

回折平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源由来: シンクロトロン / サイト: SSRF / ビームライン: BL17U / 波長: 0.97891 Å
検出器タイプ: ADSC QUANTUM 315 / 検出器: CCD / 日付: 2018年9月23日
放射プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 0.97891 Å / 相対比: 1
反射解像度: 2.3→88.995 Å / Num. obs: 59732 / % possible obs: 96.85 % / 冗長度: 1.9 % / CC1/2: 0.985 / Net I/σ(I): 6.64
反射 シェル解像度: 2.3→2.382 Å / Num. unique obs: 5993 / CC1/2: 0.635

-
解析

ソフトウェア
名称バージョン分類
PHENIX1.9_1692精密化
HKL-2000データ削減
HKL-2000データスケーリング
精密化構造決定の手法: 分子置換
開始モデル: 5TL5,4CMH

5tl5

4cmh


解像度: 2.3→88.995 Å / SU ML: 0.32 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.98 / 位相誤差: 27.64 / 立体化学のターゲット値: ML
Rfactor反射数%反射
Rfree0.2728 2974 4.98 %
Rwork0.2269 --
obs0.2292 59716 96.85 %
溶媒の処理減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL
精密化ステップサイクル: LAST / 解像度: 2.3→88.995 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数7351 0 0 573 7924
拘束条件
Refine-IDタイプDev ideal数
X-RAY DIFFRACTIONf_bond_d0.0027516
X-RAY DIFFRACTIONf_angle_d0.64110193
X-RAY DIFFRACTIONf_dihedral_angle_d11.1052725
X-RAY DIFFRACTIONf_chiral_restr0.0231154
X-RAY DIFFRACTIONf_plane_restr0.0041308
LS精密化 シェル
解像度 (Å)Rfactor RfreeNum. reflection RfreeRfactor RworkNum. reflection RworkRefine-ID% reflection obs (%)
2.3-2.33770.32011590.27672690X-RAY DIFFRACTION98
2.3377-2.3780.38271370.29542716X-RAY DIFFRACTION98
2.378-2.42130.3381610.28652708X-RAY DIFFRACTION97
2.4213-2.46790.30231270.27762727X-RAY DIFFRACTION98
2.4679-2.51820.30661520.26842688X-RAY DIFFRACTION98
2.5182-2.5730.32591420.26462697X-RAY DIFFRACTION97
2.573-2.63290.3021320.26192721X-RAY DIFFRACTION97
2.6329-2.69870.31361240.25392731X-RAY DIFFRACTION97
2.6987-2.77170.32561300.25142569X-RAY DIFFRACTION92
2.7717-2.85320.33111520.26442529X-RAY DIFFRACTION92
2.8532-2.94530.31121610.25222727X-RAY DIFFRACTION98
2.9453-3.05060.28881370.24712759X-RAY DIFFRACTION99
3.0506-3.17280.28361570.23792732X-RAY DIFFRACTION99
3.1728-3.31720.2781490.22782744X-RAY DIFFRACTION98
3.3172-3.4920.27541700.21372703X-RAY DIFFRACTION98
3.492-3.71080.27021480.20732711X-RAY DIFFRACTION98
3.7108-3.99740.23191130.20232703X-RAY DIFFRACTION95
3.9974-4.39960.23421130.17972594X-RAY DIFFRACTION92
4.3996-5.03620.20951460.17692766X-RAY DIFFRACTION99
5.0362-6.34480.2291330.21142785X-RAY DIFFRACTION98
6.3448-100.2461310.24132742X-RAY DIFFRACTION95
精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

IDL11 (°2)L12 (°2)L13 (°2)L22 (°2)L23 (°2)L33 (°2)S11 (Å °)S12 (Å °)S13 (Å °)S21 (Å °)S22 (Å °)S23 (Å °)S31 (Å °)S32 (Å °)S33 (Å °)T11 (Å2)T12 (Å2)T13 (Å2)T22 (Å2)T23 (Å2)T33 (Å2)Origin x (Å)Origin y (Å)Origin z (Å)
16.20261.59530.05561.66520.65762.1822-0.0473-0.75130.07350.33350.0160.1909-0.0481-0.19-0.0710.431-0.02590.07630.43760.0680.2316-19.2068-12.0388-31.9561
21.77290.26770.04381.56680.10481.2470.0855-0.3352-0.09360.3679-0.04750.02670.1296-0.1994-0.03760.3694-0.04610.0260.36790.06570.2145-18.7174-20.3236-38.4382
34.60465.3429-0.04846.583-0.07440.00170.1275-0.5551-0.07050.1234-0.2322-0.2251-0.482-0.06170.10310.3856-0.0689-0.00060.2866-0.04190.1915-7.76220.1121-35.1738
42.0852-0.02781.17393.3521-1.24512.3359-0.0958-0.23640.52010.0609-0.04130.0844-0.3623-0.33510.11670.4020.0379-0.07460.2411-0.13680.4018-9.282816.9983-49.7026
51.8620.6313-0.04390.30140.1582.2066-0.182-0.20010.62620.2605-0.03110.0996-0.5321-0.20290.21120.47890.0492-0.09290.331-0.16970.4456-12.152217.9326-48.0384
63.9473-1.03483.34715.6582-2.81766.9091-0.28040.151.04080.0294-0.62290.088-0.920.64230.84790.5783-0.027-0.14540.3293-0.10890.6106-3.767622.8278-43.9327
70.4219-1.0451-0.11625.318-0.3330.74420.1290.24810.0261-0.2811-0.1805-0.0781-0.0138-0.03820.05860.1936-0.0164-0.01560.26440.04680.176-23.6557-18.9733-60.5925
82.4502-0.28410.08083.33471.68923.2351-0.1659-0.13670.08710.21880.13940.40720.1124-0.45130.03510.2125-0.02880.02180.3410.10950.2973-32.9588-19.8183-54.1206
92.2072-1.1503-0.04915.62270.10591.1293-0.2232-0.145-0.13890.06130.12880.6033-0.106-0.14810.1080.2032-0.04880.02970.31460.03970.219-28.2754-15.613-59.6111
100.72730.04850.12050.79180.47470.4303-0.1117-0.01960.03270.09360.20390.1354-0.0132-0.1632-0.09710.25970.00730.04940.28470.05340.2646-20.9779-11.5803-56.5374
110.5792-0.8326-0.79363.901-1.25373.1721-0.5571-0.26211.71010.0721-0.0148-0.298-0.72560.59330.62470.32730.006-0.04150.2995-0.12060.4804-1.961614.8628-55.2387
124.7291-0.25121.10720.3032-0.71411.5692-0.025-0.03520.0921-0.06890.106-0.0522-0.05360.06-0.07170.3223-0.0128-0.00930.2179-0.05970.2602-6.91516.1239-59.0062
135.1738-1.19091.79311.85691.25124.6697-0.21870.73790.9769-0.5990.181-0.6531-0.82160.4546-0.07860.4635-0.0581-0.0720.36840.07320.4107-3.226111.7847-66.6419
147.0017-5.21760.60149.53210.21363.17880.61910.9828-0.7753-1.1565-0.6620.75670.8772-0.1484-0.01830.7407-0.1823-0.1350.59120.10610.4291-30.1164-45.5206-52.5608
153.3516-1.6504-0.17383.72790.41122.96-0.0294-0.6544-0.4163-0.10750.27730.57420.24740.0555-0.12220.5658-0.1757-0.00280.43880.13660.4125-28.6206-42.1271-43.8822
162.49030.17960.4131.503-0.480.74650.3001-0.8311-0.04480.614-0.2435-0.2671-0.5470.5513-0.10060.4812-0.1724-0.07550.554-0.01660.316819.4286-6.9023-36.5324
171.46810.68660.3181.1110.35920.17690.2462-0.593-0.02340.6253-0.179-0.1152-0.35690.5161-0.03610.5731-0.1739-0.03790.5855-0.0230.27813.5748-5.3178-36.419
181.90260.03820.32840.88690.81831.95510.3844-0.9802-0.01370.5474-0.4063-0.0047-0.16720.40510.0340.4048-0.0632-0.08150.53150.04980.216618.2322-13.8541-38.3188
194.5088-0.5696-2.1561.505-0.00173.94910.08140.4167-1.0802-0.0424-0.1898-0.34570.7281-0.02160.20480.5796-0.04290.12290.27980.07441.02997.2184-45.1204-57.8034
201.835-0.8520.26592.41452.01673.00140.0389-0.8034-1.16860.0314-0.0733-0.70430.37760.47620.00850.50430.03680.0470.46580.29160.76919.7396-39.1991-43.8085
210.0010.13450.02473.0699-0.12770.25790.221-0.4091-1.58810.48780.028-0.80020.74610.15670.0550.65850.1184-0.11950.66470.39991.164816.2336-45.5445-45.9123
221.6016-0.5658-0.02713.86821.76613.8157-0.0419-0.2644-0.76620.53880.0818-0.42790.98520.1701-0.02490.48210.02770.03920.39560.19360.73139.9212-41.1019-47.7255
232.74620.3464-0.68123.93291.77912.8863-0.16110.0633-1.39640.17820.061-0.29771.1072-0.20120.23830.8673-0.12540.10310.41340.38861.13523.1595-48.2019-44.0016
240.40070.24610.40180.22630.30420.4507-0.5330.02330.2285-0.0074-0.21890.2553-1.1393-0.98670.54821.3066-0.2490.08620.7529-0.16450.789126.421928.057-54.5824
250.3745-0.69570.46371.2886-0.95741.4056-0.31570.21370.1922-1.0131-0.2268-0.6443-0.61550.2150.34191.2066-0.37270.21670.3098-0.19620.984330.772121.1601-53.2673
261.3631.1502-0.62334.9585-3.85993.071-0.2134-0.33790.3272-0.1539-0.2213-0.98610.3543-0.16530.20490.5099-0.58460.17180.7443-0.35990.847134.384714.6706-50.6411
270.50960.63681.03774.35120.94972.1272-0.0091-0.43740.2590.6965-0.3205-0.7223-0.47290.4521-0.47270.8697-0.55650.02480.6751-0.33960.676332.798612.0155-43.4163
283.2219-0.0985-1.34169.2978-1.97181.6179-0.349-0.05251.28610.42810.16681.5394-0.9193-0.10330.36750.8487-0.32880.22540.3929-0.42951.27222.854623.5716-46.0798
291.2660.084-0.80933.4819-0.05442.0677-0.027-0.006-0.0680.101-0.1721-0.4352-0.06780.24580.18710.1928-0.05560.03320.3351-0.02290.31627.3081-4.8861-58.4603
301.64110.45910.21532.9490.17980.9232-0.0291-0.1242-0.17380.1812-0.0611-0.3643-0.04390.18310.07160.2438-0.0270.01280.31910.00760.287122.8483-13.2181-56.4112
310.5935-0.87080.78343.4870.83662.8322-0.3952-0.2974-1.51470.2530.0689-0.14450.7914-0.08650.34980.37570.03510.04480.29020.12280.60441.3718-39.4928-54.9712
322.9198-0.5317-0.45870.88250.01561.6867-0.0318-0.1728-0.1008-0.09640.075-0.11210.09750.006-0.05020.3243-0.01250.08520.30290.05450.42296.3709-30.7951-58.8084
336.09460.952-0.36511.21410.83063.6959-0.31620.8769-0.5672-0.47830.24330.27241.0299-0.21590.0370.3956-0.03420.12270.3694-0.07220.53312.1764-37.7179-65.9601
精密化 TLSグループ
IDRefine-IDRefine TLS-IDSelection details
1X-RAY DIFFRACTION1chain 'A' and (resid 1 through 24 )
2X-RAY DIFFRACTION2chain 'A' and (resid 25 through 104 )
3X-RAY DIFFRACTION3chain 'A' and (resid 105 through 116 )
4X-RAY DIFFRACTION4chain 'A' and (resid 117 through 153 )
5X-RAY DIFFRACTION5chain 'A' and (resid 154 through 200 )
6X-RAY DIFFRACTION6chain 'A' and (resid 201 through 217 )
7X-RAY DIFFRACTION7chain 'B' and (resid 1 through 39 )
8X-RAY DIFFRACTION8chain 'B' and (resid 40 through 73 )
9X-RAY DIFFRACTION9chain 'B' and (resid 74 through 98 )
10X-RAY DIFFRACTION10chain 'B' and (resid 99 through 133 )
11X-RAY DIFFRACTION11chain 'B' and (resid 134 through 154 )
12X-RAY DIFFRACTION12chain 'B' and (resid 155 through 212 )
13X-RAY DIFFRACTION13chain 'B' and (resid 213 through 224 )
14X-RAY DIFFRACTION14chain 'E' and (resid 11 through 30 )
15X-RAY DIFFRACTION15chain 'E' and (resid 31 through 52 )
16X-RAY DIFFRACTION16chain 'C' and (resid 1 through 51 )
17X-RAY DIFFRACTION17chain 'C' and (resid 52 through 93 )
18X-RAY DIFFRACTION18chain 'C' and (resid 94 through 116 )
19X-RAY DIFFRACTION19chain 'C' and (resid 117 through 131 )
20X-RAY DIFFRACTION20chain 'C' and (resid 132 through 153 )
21X-RAY DIFFRACTION21chain 'C' and (resid 154 through 166 )
22X-RAY DIFFRACTION22chain 'C' and (resid 167 through 201 )
23X-RAY DIFFRACTION23chain 'C' and (resid 202 through 217 )
24X-RAY DIFFRACTION24chain 'F' and (resid 12 through 18 )
25X-RAY DIFFRACTION25chain 'F' and (resid 19 through 23 )
26X-RAY DIFFRACTION26chain 'F' and (resid 24 through 28 )
27X-RAY DIFFRACTION27chain 'F' and (resid 29 through 43 )
28X-RAY DIFFRACTION28chain 'F' and (resid 44 through 51 )
29X-RAY DIFFRACTION29chain 'D' and (resid 1 through 83 )
30X-RAY DIFFRACTION30chain 'D' and (resid 84 through 133 )
31X-RAY DIFFRACTION31chain 'D' and (resid 134 through 154 )
32X-RAY DIFFRACTION32chain 'D' and (resid 155 through 212 )
33X-RAY DIFFRACTION33chain 'D' and (resid 213 through 225 )

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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