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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8wcc | ||||||
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タイトル | Cryo-EM structure of the CHA-bound mTAAR1 complex | ||||||
要素 | Trace amine-associated receptor 1 | ||||||
キーワード | MEMBRANE PROTEIN / CHA / mTAAR1 | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 G protein-coupled amine receptor activity / Amine ligand-binding receptors / trace-amine receptor activity / G alpha (s) signalling events / positive regulation of cAMP-mediated signaling / adenylate cyclase-activating dopamine receptor signaling pathway / G protein-coupled receptor signaling pathway / membrane / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Mus musculus (ハツカネズミ) | ||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.04 Å | ||||||
データ登録者 | Rong, N.K. / Guo, L.L. / Zhang, M.H. / Li, Q. / Yang, F. / Sun, J.P. | ||||||
資金援助 | 中国, 1件
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引用 | ジャーナル: Cell / 年: 2023 タイトル: Structural and signaling mechanisms of TAAR1 enabled preferential agonist design. 著者: Pan Shang / Naikang Rong / Jing-Jing Jiang / Jie Cheng / Ming-Hui Zhang / Dongwei Kang / Lei Qi / Lulu Guo / Gong-Ming Yang / Qun Liu / Zhenzhen Zhou / Xiao-Bing Li / Kong-Kai Zhu / Qing-Biao ...著者: Pan Shang / Naikang Rong / Jing-Jing Jiang / Jie Cheng / Ming-Hui Zhang / Dongwei Kang / Lei Qi / Lulu Guo / Gong-Ming Yang / Qun Liu / Zhenzhen Zhou / Xiao-Bing Li / Kong-Kai Zhu / Qing-Biao Meng / Xiang Han / Wenqi Yan / Yalei Kong / Lejin Yang / Xiaohui Wang / Dapeng Lei / Xin Feng / Xinyong Liu / Xiao Yu / Yue Wang / Qian Li / Zhen-Hua Shao / Fan Yang / Jin-Peng Sun / 要旨: Trace amine-associated receptor 1 (TAAR1) senses a spectrum of endogenous amine-containing metabolites (EAMs) to mediate diverse psychological functions and is useful for schizophrenia treatment ...Trace amine-associated receptor 1 (TAAR1) senses a spectrum of endogenous amine-containing metabolites (EAMs) to mediate diverse psychological functions and is useful for schizophrenia treatment without the side effects of catalepsy. Here, we systematically profiled the signaling properties of TAAR1 activation and present nine structures of TAAR1-Gs/Gq in complex with EAMs, clinical drugs, and synthetic compounds. These structures not only revealed the primary amine recognition pocket (PARP) harboring the conserved acidic D for conserved amine recognition and "twin" toggle switch for receptor activation but also elucidated that targeting specific residues in the second binding pocket (SBP) allowed modulation of signaling preference. In addition to traditional drug-induced Gs signaling, Gq activation by EAM or synthetic compounds is beneficial to schizophrenia treatment. Our results provided a structural and signaling framework for molecular recognition by TAAR1, which afforded structural templates and signal clues for TAAR1-targeted candidate compounds design. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 8wcc.cif.gz | 64.8 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb8wcc.ent.gz | 45.2 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 8wcc.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 8wcc_validation.pdf.gz | 948.7 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 8wcc_full_validation.pdf.gz | 950 KB | 表示 | |
XML形式データ | 8wcc_validation.xml.gz | 21.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 8wcc_validation.cif.gz | 28.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/wc/8wcc ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/wc/8wcc | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | 37438MC 8wc3C 8wc4C 8wc5C 8wc6C 8wc7C 8wc8C 8wc9C 8wcaC 8wcbC M: このデータのモデリングに利用したマップデータ C: 同じ文献を引用 (文献) |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索 |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 37656.586 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Mus musculus (ハツカネズミ) / 遺伝子: Taar1, Ta1, Tar1, Trar1 発現宿主: Spodoptera frugiperda (ツマジロクサヨトウ) 参照: UniProt: Q923Y8 |
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#2: 化合物 | ChemComp-HAI / |
研究の焦点であるリガンドがあるか | Y |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
-試料調製
構成要素 | 名称: Cryo-EM structure of the CHA-bound mTAAR1 complex / タイプ: COMPLEX / Entity ID: #1 / 由来: RECOMBINANT |
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由来(天然) | 生物種: Mus musculus (ハツカネズミ) |
由来(組換発現) | 生物種: Spodoptera frugiperda (ツマジロクサヨトウ) |
緩衝液 | pH: 7.4 |
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES |
急速凍結 | 凍結剤: ETHANE |
-電子顕微鏡撮影
実験機器 | モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源: FIELD EMISSION GUN / 加速電圧: 300 kV / 照射モード: FLOOD BEAM |
電子レンズ | モード: DIFFRACTION / 最大 デフォーカス(公称値): 2000 nm / 最小 デフォーカス(公称値): 1000 nm |
撮影 | 電子線照射量: 1.875 e/Å2 フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON IV (4k x 4k) |
-解析
EMソフトウェア | 名称: PHENIX / バージョン: 1.20.1_4487: / カテゴリ: モデル精密化 | ||||||||||||||||||||||||
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CTF補正 | タイプ: NONE | ||||||||||||||||||||||||
3次元再構成 | 解像度: 3.04 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 296951 / 対称性のタイプ: POINT | ||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
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