- PDB-8sxy: X-ray crystal structure of UDP- 2,3-diacetamido-2,3-dideoxy-glucu... -
+
データを開く
IDまたはキーワード:
読み込み中...
-
基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 8sxy
タイトル
X-ray crystal structure of UDP- 2,3-diacetamido-2,3-dideoxy-glucuronic acid-2-epimerase from Thermus thermophilus strain HB27 in complex with its product UDP-2,3-diacetamido-2,3-dideoxy-d-mannuronic acid at pH 5
解像度: 1.8→1.9 Å / 冗長度: 4.4 % / Mean I/σ(I) obs: 3.5 / Num. unique obs: 10677 / Rsym value: 0.3 / % possible all: 98.7
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
REFMAC
5.8.0403
精密化
SAINT
データ削減
SADABS
データスケーリング
PHASER
位相決定
精密化
構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 1.8→41.71 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.955 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.936 / SU B: 3.272 / SU ML: 0.095 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.126 / ESU R Free: 0.122 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.21819
3515
4.9 %
RANDOM
Rwork
0.1796
-
-
-
obs
0.1815
68030
99.01 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK