解像度: 1.98→2.01 Å / Rmerge(I) obs: 2.404 / Mean I/σ(I) obs: 0.67 / Num. unique obs: 4716 / CC1/2: 0.6 / % possible all: 100
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
REFMAC
5
精密化
DIALS
データ削減
XSCALE
データスケーリング
PHASER
位相決定
精密化
構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 1.98→94.97 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.971 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.959 / SU B: 7.104 / SU ML: 0.089 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.105 / ESU R Free: 0.1 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD 詳細: U VALUES : WITH TLS ADDED HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS U VALUES : RESIDUAL ONLY
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.20029
2271
4.7 %
RANDOM
Rwork
0.18316
-
-
-
obs
0.18394
45541
100 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.7 Å / 減衰半径: 0.7 Å / VDWプローブ半径: 1 Å / 溶媒モデル: MASK
原子変位パラメータ
Biso mean: 60.837 Å2
Baniso -1
Baniso -2
Baniso -3
1-
-0.21 Å2
-0.11 Å2
-0 Å2
2-
-
-0.21 Å2
0 Å2
3-
-
-
0.69 Å2
精密化ステップ
サイクル: LAST / 解像度: 1.98→94.97 Å
タンパク質
核酸
リガンド
溶媒
全体
原子数
2538
0
141
80
2759
拘束条件
Refine-ID
タイプ
Dev ideal
Dev ideal target
数
X-RAY DIFFRACTION
r_bond_refined_d
0.009
0.016
2788
X-RAY DIFFRACTION
r_bond_other_d
0.001
0.015
2543
X-RAY DIFFRACTION
r_angle_refined_deg
1.551
1.828
3850
X-RAY DIFFRACTION
r_angle_other_deg
0.481
1.611
5853
X-RAY DIFFRACTION
r_dihedral_angle_1_deg
6.039
5.441
374
X-RAY DIFFRACTION
r_dihedral_angle_2_deg
1.745
5
9
X-RAY DIFFRACTION
r_dihedral_angle_3_deg
14.364
10
369
X-RAY DIFFRACTION
r_chiral_restr
0.093
0.2
424
X-RAY DIFFRACTION
r_gen_planes_refined
0.005
0.02
3354
X-RAY DIFFRACTION
r_gen_planes_other
0.001
0.02
587
X-RAY DIFFRACTION
r_mcbond_it
2.405
3.536
1358
X-RAY DIFFRACTION
r_mcbond_other
2.405
3.536
1358
X-RAY DIFFRACTION
r_mcangle_it
3.624
5.276
1698
X-RAY DIFFRACTION
r_mcangle_other
3.623
5.281
1699
X-RAY DIFFRACTION
r_scbond_it
3.156
3.929
1430
X-RAY DIFFRACTION
r_scbond_other
3.155
3.93
1431
X-RAY DIFFRACTION
r_scangle_other
4.758
5.775
2152
X-RAY DIFFRACTION
r_long_range_B_refined
7.542
49.75
3047
X-RAY DIFFRACTION
r_long_range_B_other
7.537
48.722
3040
LS精密化 シェル
解像度: 1.98→2.031 Å / Total num. of bins used: 20
Rfactor
反射数
%反射
Rfree
0.333
177
-
Rwork
0.352
3314
-
obs
-
-
99.97 %
精密化 TLS
手法: refined / Origin x: -44.685 Å / Origin y: 27.747 Å / Origin z: 46.752 Å